RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485450.5

USP4-211, Transcript of ubiquitin specific peptidase 4, humanhuman

TSL 2

Gene USP4, Length 3,541 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP4-211ENST00000485450 RASA2Q15283 850 aa7.9□□□□□ -1.14
USP4-211ENST00000485450 ZNF697Q5TEC3 545 aa7.9□□□□□ -1.14
USP4-211ENST00000485450 IZUMO2Q6UXV1 221 aa7.9□□□□□ -1.14
USP4-211ENST00000485450 LPPQ93052 612 aa7.9□□□□□ -1.14
USP4-211ENST00000485450 BTBD10Q9BSF8 475 aa7.9□□□□□ -1.14
USP4-211ENST00000485450 NDEL1Q9GZM8 345 aa7.9□□□□□ -1.14
USP4-211ENST00000485450 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP7.9□□□□□ -1.14
USP4-211ENST00000485450 TMEM8AQ9HCN3 771 aa7.9□□□□□ -1.14
USP4-211ENST00000485450 MLXIPLQ9NP71 852 aa7.9□□□□□ -1.14
USP4-211ENST00000485450 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa7.9□□□□□ -1.14
USP4-211ENST00000485450 PARP2Q9UGN5 583 aa7.9□□□□□ -1.14
USP4-211ENST00000485450 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa7.9□□□□□ -1.14
USP4-211ENST00000485450 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP7.9□□□□□ -1.158e-6■■■■■ 107
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USP4-211ENST00000485450 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP7.9□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 GSC2O15499 205 aa7.9□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 NFICP08651 508 aa7.9□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 CHRNB1P11230 501 aa7.9□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 PFKLP17858 780 aa7.9□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 ASPAP45381 313 aa7.9□□□□□ -1.15
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USP4-211ENST00000485450 HYAL1Q12794 435 aa7.9□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 SLC45A4Q5BKX6 768 aa7.9□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP7.9□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 LVRNQ6Q4G3 990 aa7.9□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 ARHGAP24Q8N264 748 aa7.9□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 TPCN2Q8NHX9 752 aa7.9□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 DTX3LQ8TDB6 740 aa7.9□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 HES6Q96HZ4 224 aa7.9□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 GAD1Q99259 594 aa7.9□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 COLEC11Q9BWP8 271 aa7.9□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 STK33Q9BYT3 514 aa7.9□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa7.9□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 KCNK9Q9NPC2 374 aa7.9□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 SIX2Q9NPC8 291 aa7.9□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 TLR9Q9NR96 1032 aa7.9□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 CLEC1BQ9P126 229 aa7.9□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP7.9□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 PODXLO00592 558 aa7.89□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 BRAFP15056 766 aa7.89□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 MAGEA11P43364 429 aa7.89□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 SCNN1GP51170 649 aa7.89□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 TPGS2Q68CL5 300 aa7.89□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa7.89□□□□□ -1.15
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USP4-211ENST00000485450 SPRED2Q7Z698 418 aa7.89□□□□□ -1.15
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USP4-211ENST00000485450 LINC00469Q8N7U9 141 aa7.89□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 C10orf82Q8WW14 230 aa7.89□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 ZFP42Q96MM3 310 aa7.89□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 FNBP1Q96RU3 617 aa7.89□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 NUP85Q9BW27 656 aa7.89□□□□□ -1.15
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USP4-211ENST00000485450 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 ZNF304Q9HCX3 659 aa7.89□□□□□ -1.15
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USP4-211ENST00000485450 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa7.89□□□□□ -1.15
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USP4-211ENST00000485450 ZWINTO95229 277 aa7.89□□□□□ -1.15
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USP4-211ENST00000485450 SNX25Q9H3E2 840 aa7.89□□□□□ -1.15
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USP4-211ENST00000485450 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa7.89□□□□□ -1.15
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USP4-211ENST00000485450 COG5Q9UP83 839 aa7.89□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 NR2E1Q9Y466 385 aa7.89□□□□□ -1.15
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USP4-211ENST00000485450 CDC16Q13042 620 aa7.89□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 LONRF1Q17RB8 773 aa7.89□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 PKDCCQ504Y2 493 aa7.89□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 FUT10Q6P4F1 479 aa7.89□□□□□ -1.15
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USP4-211ENST00000485450 CRYBG2Q8N1P7 616 aa7.89□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa7.89□□□□□ -1.15
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