RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479554.5

ATG4B-218, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 4

Gene ATG4B, Length 556 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-218ENST00000479554 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa14.81□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 EFHC1Q5JVL4 640 aa14.81□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 OR6B2Q6IFH4 312 aa14.81□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 OLFML1Q6UWY5 402 aa14.81□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa14.81□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 KDM1BQ8NB78 822 aa14.81□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 RNF34Q969K3 372 aa14.81□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 MRGPRX3Q96LB0 322 aa14.81□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 PPP1R9BQ96SB3 815 aa14.81□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa14.81□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 NDST4Q9H3R1 872 aa14.81□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 SYNCQ9H7C4 482 aa14.81□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 SCML1Q9UN30 329 aa14.81□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 WASF3Q9UPY6 502 aa14.81□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 ERVW-1Q9UQF0 538 aa14.81□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 CACNA1BQ00975 2339 aa14.81□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 CACNA1EQ15878 2313 aa14.8□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 PES1O00541 588 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 SIN3BO75182 1162 aa14.8□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 CER1O95813 267 aa14.8□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 CLCN1P35523 988 aa14.8□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 ECT2LQ008S8 904 aa14.8□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 PTPN20Q4JDL3 420 aa14.8□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 RABGAP1LQ5R372 815 aa14.8□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 LUZP1Q86V48 1076 aa14.8□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 SLC47A2Q86VL8 602 aa14.8□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 GANCQ8TET4 914 aa14.8□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 ADAM33Q9BZ11 813 aa14.8□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 SGK2Q9HBY8 427 aa14.8□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa14.8□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 AKAP13Q12802 2813 aa14.79□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa14.79□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 A0A1B0GVM2 712 aa14.79□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 TCAF2A6NFQ2 919 aa14.79□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 SMTNL1A8MU46 457 aa14.79□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 TTC34A8MYJ7 566 aa14.79□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 SH3BP5O60239 455 aa14.79□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 DAB1O75553 588 aa14.79□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 KRT37O76014 449 aa14.79□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 FSBPO95073 299 aa14.79□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 ERBB2P04626 1255 aa14.79□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 PDGFRAP16234 1089 aa14.79□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 RDXP35241 583 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 MATKP42679 507 aa14.79□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 BPIFB4P59827 614 aa14.79□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 SLC12A1Q13621 1099 aa14.79□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 RAPGEF1Q13905 1077 aa14.79□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 ARID5BQ14865 1188 aa14.79□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 MIIPQ5JXC2 388 aa14.79□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 IL27RAQ6UWB1 636 aa14.79□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa14.79□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 ITIH6Q6UXX5 1313 aa14.79□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 USP30Q70CQ3 517 aa14.79□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 NAXDQ8IW45 347 aa14.79□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 FAM71AQ8IYT1 594 aa14.79□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 C1orf216Q8TAB5 229 aa14.79□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 BIRC7Q96CA5 298 aa14.79□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 PDLIM2Q96JY6 352 aa14.79□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 SCNM1Q9BWG6 230 aa14.79□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 PDCL3Q9H2J4 239 aa14.79□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 GAREM1Q9H706 876 aa14.79□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 PLCB1Q9NQ66 1216 aa14.79□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa14.79□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 A0A1B0GVT2 93 aa14.78□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 MID1O15344 667 aa14.78□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 PROS1P07225 676 aa14.78□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 NOS2P35228 1153 aa14.78□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 FAM193AP78312 1265 aa14.78□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 BNC1Q01954 994 aa14.78□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 SLC6A3Q01959 620 aa14.78□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 CENPCQ03188 943 aa14.78□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 NME3Q13232 169 aa14.78□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 MTA1Q13330 715 aa14.78□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 KCNJ12Q14500 433 aa14.78□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 TEAD4Q15561 434 aa14.78□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 CST6Q15828 149 aa14.78□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 C9orf64Q5T6V5 341 aa14.78□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 SLC26A9Q7LBE3 791 aa14.78□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.3 ms