RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466245.1

TTLL3-223, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

TSL 3

Gene TTLL3, Length 616 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-223	ENST00000466245	TMEM25	Q86YD3	366 aa		10.44	□□□□□ -0.74
TTLL3-223	ENST00000466245	SLC41A1	Q8IVJ1	513 aa		10.44	□□□□□ -0.74
TTLL3-223	ENST00000466245	CLEC4C	Q8WTT0	213 aa		10.44	□□□□□ -0.74
TTLL3-223	ENST00000466245	NDRG1	Q92597	394 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
TTLL3-223	ENST00000466245	EDEM1	Q92611	657 aa		10.44	□□□□□ -0.74
TTLL3-223	ENST00000466245	NT5C3B	Q969T7	300 aa		10.44	□□□□□ -0.74
TTLL3-223	ENST00000466245	C18orf8	Q96DM3	657 aa		10.44	□□□□□ -0.74
TTLL3-223	ENST00000466245	PGAP3	Q96FM1	320 aa	Predicted RBP	10.44	□□□□□ -0.74
TTLL3-223	ENST00000466245	ZNF419	Q96HQ0	510 aa	Predicted RBP	10.44	□□□□□ -0.74
TTLL3-223	ENST00000466245	ZDHHC4	Q9NPG8	344 aa		10.44	□□□□□ -0.74
TTLL3-223	ENST00000466245	NLRC4	Q9NPP4	1024 aa		10.44	□□□□□ -0.74
TTLL3-223	ENST00000466245	SLTM	Q9NWH9	1034 aa	Known RBP eCLIP	10.44	□□□□□ -0.74
TTLL3-223	ENST00000466245	PCOLCE2	Q9UKZ9	415 aa		10.44	□□□□□ -0.74
TTLL3-223	ENST00000466245	DOCK4	Q8N1I0	1966 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TTLL3-223	ENST00000466245	KALRN	O60229	2985 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TTLL3-223	ENST00000466245		A0A1W2PQJ5	194 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TTLL3-223	ENST00000466245	SCAMP3	O14828	347 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
TTLL3-223	ENST00000466245	DAB1	O75553	588 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TTLL3-223	ENST00000466245	ZIC2	O95409	532 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
TTLL3-223	ENST00000466245	TRUB2	O95900	331 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
TTLL3-223	ENST00000466245	CYBB	P04839	570 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TTLL3-223	ENST00000466245	CISD3	P0C7P0	127 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TTLL3-223	ENST00000466245	IRF1	P10914	325 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TTLL3-223	ENST00000466245	NCAM1	P13591	858 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TTLL3-223	ENST00000466245	CHRNB2	P17787	502 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TTLL3-223	ENST00000466245	MMP8	P22894	467 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TTLL3-223	ENST00000466245	CD6	P30203	668 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TTLL3-223	ENST00000466245	NOS2	P35228	1153 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TTLL3-223	ENST00000466245	PRKCI	P41743	596 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TTLL3-223	ENST00000466245	WAS	P42768	502 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TTLL3-223	ENST00000466245	TBX4	P57082	545 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TTLL3-223	ENST00000466245	FMO1	Q01740	532 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TTLL3-223	ENST00000466245	CENPC	Q03188	943 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TTLL3-223	ENST00000466245	MESP2	Q0VG99	397 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TTLL3-223	ENST00000466245	EIF4H	Q15056	248 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
TTLL3-223	ENST00000466245	MPPE1	Q53F39	396 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TTLL3-223	ENST00000466245	FYB2	Q5VWT5	728 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TTLL3-223	ENST00000466245	ERICH1	Q86X53	443 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TTLL3-223	ENST00000466245	SFTPA1	Q8IWL2	248 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TTLL3-223	ENST00000466245	PDCD7	Q8N8D1	485 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
TTLL3-223	ENST00000466245	NAT16	Q8N8M0	369 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TTLL3-223	ENST00000466245	ADAM32	Q8TC27	787 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TTLL3-223	ENST00000466245	RHBDD1	Q8TEB9	315 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TTLL3-223	ENST00000466245	BAP1	Q92560	729 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TTLL3-223	ENST00000466245	FAM149B1	Q96BN6	582 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TTLL3-223	ENST00000466245	P2RY11	Q96G91	374 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TTLL3-223	ENST00000466245	FCRL2	Q96LA5	508 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
TTLL3-223	ENST00000466245	PCMTD1	Q96MG8	357 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
TTLL3-223	ENST00000466245	DCBLD2	Q96PD2	775 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TTLL3-223	ENST00000466245	DDX50	Q9BQ39	737 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
TTLL3-223	ENST00000466245	SYT11	Q9BT88	431 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TTLL3-223	ENST00000466245	NUP58	Q9BVL2	599 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TTLL3-223	ENST00000466245	BBS2	Q9BXC9	721 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TTLL3-223	ENST00000466245	NUCKS1	Q9H1E3	243 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
TTLL3-223	ENST00000466245	MIR1-1HG	Q9H1L0	117 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TTLL3-223	ENST00000466245	PDCL3	Q9H2J4	239 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TTLL3-223	ENST00000466245	GAREM1	Q9H706	876 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TTLL3-223	ENST00000466245	TM7SF3	Q9NS93	570 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TTLL3-223	ENST00000466245	DNAJC17	Q9NVM6	304 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
TTLL3-223	ENST00000466245	AIPL1	Q9NZN9	384 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TTLL3-223	ENST00000466245	NAALADL1	Q9UQQ1	740 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TTLL3-223	ENST00000466245	PCDHGB2	Q9Y5G2	931 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TTLL3-223	ENST00000466245	CKAP5	Q14008	2032 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TTLL3-223	ENST00000466245	MUC22	E2RYF6	1773 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
TTLL3-223	ENST00000466245	LAMA5	O15230	3695 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TTLL3-223	ENST00000466245		A0A087WV48	116 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TTLL3-223	ENST00000466245	GOLGA8CP	A6NN73	597 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TTLL3-223	ENST00000466245	BCAT2	O15382	392 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
TTLL3-223	ENST00000466245	RRP8	O43159	456 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
TTLL3-223	ENST00000466245	TEX33	O43247	280 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TTLL3-223	ENST00000466245	ACSL4	O60488	711 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TTLL3-223	ENST00000466245	GFPT2	O94808	682 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TTLL3-223	ENST00000466245	F9	P00740	461 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TTLL3-223	ENST00000466245	SERPINC1	P01008	464 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TTLL3-223	ENST00000466245	ERBB2	P04626	1255 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TTLL3-223	ENST00000466245	MME	P08473	750 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TTLL3-223	ENST00000466245	UNG	P13051	313 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
TTLL3-223	ENST00000466245	TYR	P14679	529 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TTLL3-223	ENST00000466245	OXTR	P30559	389 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TTLL3-223	ENST00000466245	SLC11A2	P49281	568 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TTLL3-223	ENST00000466245	CDK17	Q00537	523 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TTLL3-223	ENST00000466245	FANCC	Q00597	558 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TTLL3-223	ENST00000466245	CYP4F3	Q08477	520 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TTLL3-223	ENST00000466245	TEAD4	Q15561	434 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TTLL3-223	ENST00000466245	SYPL2	Q5VXT5	272 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TTLL3-223	ENST00000466245	FAM183BP	Q6ZVS7	135 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TTLL3-223	ENST00000466245	BNIPL	Q7Z465	357 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TTLL3-223	ENST00000466245	IRF2BP2	Q7Z5L9	587 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TTLL3-223	ENST00000466245	LUZP1	Q86V48	1076 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TTLL3-223	ENST00000466245	XYLT1	Q86Y38	959 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TTLL3-223	ENST00000466245	PHF13	Q86YI8	300 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
TTLL3-223	ENST00000466245	DENND1C	Q8IV53	801 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TTLL3-223	ENST00000466245	PASD1	Q8IV76	773 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TTLL3-223	ENST00000466245	ZCCHC9	Q8N567	271 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
TTLL3-223	ENST00000466245	DDX51	Q8N8A6	666 aa	Known RBP eCLIP	10.42	□□□□□ -0.74
TTLL3-223	ENST00000466245	CADM4	Q8NFZ8	388 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TTLL3-223	ENST00000466245	SLC39A7	Q92504	469 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TTLL3-223	ENST00000466245	SYN2	Q92777	582 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
TTLL3-223	ENST00000466245	NXPE2	Q96DL1	559 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TTLL3-223	ENST00000466245	PIWIL1	Q96J94	861 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.4 ms