RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439890.3

NANOGP9-201, Transcript of Nanog homeobox pseudogene 9, humanhuman

BASIC

Gene NANOGP9, Length 892 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP9-201ENST00000439890 ERVK-21P61565 698 aa6.25□□□□□ -1.41
NANOGP9-201ENST00000439890 PSMC5P62195 406 aa6.25□□□□□ -1.41
NANOGP9-201ENST00000439890 CNTN2Q02246 1040 aa6.25□□□□□ -1.41
NANOGP9-201ENST00000439890 CYP4A11Q02928 519 aa6.25□□□□□ -1.41
NANOGP9-201ENST00000439890 SREBF2Q12772 1141 aa6.25□□□□□ -1.41
NANOGP9-201ENST00000439890 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
NANOGP9-201ENST00000439890 MTM1Q13496 603 aa6.25□□□□□ -1.41
NANOGP9-201ENST00000439890 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
NANOGP9-201ENST00000439890 NEDD9Q14511 834 aa6.25□□□□□ -1.41
NANOGP9-201ENST00000439890 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
NANOGP9-201ENST00000439890 CCDC142Q17RM4 750 aa6.25□□□□□ -1.41
NANOGP9-201ENST00000439890 FBXO42Q6P3S6 717 aa6.25□□□□□ -1.41
NANOGP9-201ENST00000439890 Q6ZNX1 250 aa6.25□□□□□ -1.41
NANOGP9-201ENST00000439890 TPH2Q8IWU9 490 aa6.25□□□□□ -1.41
NANOGP9-201ENST00000439890 C4orf19Q8IY42 314 aa6.25□□□□□ -1.41
NANOGP9-201ENST00000439890 COLGALT2Q8IYK4 626 aa6.25□□□□□ -1.41
NANOGP9-201ENST00000439890 ADSSL1Q8N142 457 aa6.25□□□□□ -1.41
NANOGP9-201ENST00000439890 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
NANOGP9-201ENST00000439890 CAGE1Q8TC20 777 aa6.25□□□□□ -1.41
NANOGP9-201ENST00000439890 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
NANOGP9-201ENST00000439890 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
NANOGP9-201ENST00000439890 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
NANOGP9-201ENST00000439890 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
NANOGP9-201ENST00000439890 LXNQ9BS40 222 aa6.25□□□□□ -1.41
NANOGP9-201ENST00000439890 TIPINQ9BVW5 301 aa6.25□□□□□ -1.41
NANOGP9-201ENST00000439890 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa6.25□□□□□ -1.41
NANOGP9-201ENST00000439890 ANKEF1Q9NU02 776 aa6.25□□□□□ -1.41
NANOGP9-201ENST00000439890 PANK4Q9NVE7 773 aa6.25□□□□□ -1.41
NANOGP9-201ENST00000439890 SLC5A4Q9NY91 659 aa6.25□□□□□ -1.41
NANOGP9-201ENST00000439890 RGL1Q9NZL6 768 aa6.25□□□□□ -1.41
NANOGP9-201ENST00000439890 SLC9A2Q9UBY0 812 aa6.25□□□□□ -1.41
NANOGP9-201ENST00000439890 ODF2LQ9ULJ1 636 aa6.25□□□□□ -1.41
NANOGP9-201ENST00000439890 DMTF1Q9Y222 760 aa6.25□□□□□ -1.41
NANOGP9-201ENST00000439890 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa6.25□□□□□ -1.41
NANOGP9-201ENST00000439890 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa6.25□□□□□ -1.41
NANOGP9-201ENST00000439890 MYH11P35749 1972 aa6.25□□□□□ -1.41
NANOGP9-201ENST00000439890 ZNF236Q9UL36 1845 aa6.25□□□□□ -1.41
NANOGP9-201ENST00000439890 ASTN1O14525 1302 aa6.25□□□□□ -1.41
NANOGP9-201ENST00000439890 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa6.25□□□□□ -1.41
NANOGP9-201ENST00000439890 CCDC78A2IDD5 438 aa6.24□□□□□ -1.41
NANOGP9-201ENST00000439890 ARHGEF35A5YM69 484 aa6.24□□□□□ -1.41
NANOGP9-201ENST00000439890 AP5Z1O43299 807 aa6.24□□□□□ -1.41
NANOGP9-201ENST00000439890 TOMM70O94826 608 aa6.24□□□□□ -1.41
NANOGP9-201ENST00000439890 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
NANOGP9-201ENST00000439890 TPM3P06753 285 aa6.24□□□□□ -1.41
NANOGP9-201ENST00000439890 IDEP14735 1019 aa6.24□□□□□ -1.41
NANOGP9-201ENST00000439890 ZNF18P17022 549 aa6.24□□□□□ -1.41
NANOGP9-201ENST00000439890 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
NANOGP9-201ENST00000439890 CCNE1P24864 410 aa6.24□□□□□ -1.41
NANOGP9-201ENST00000439890 MPLP40238 635 aa6.24□□□□□ -1.41
NANOGP9-201ENST00000439890 PTH2RP49190 550 aa6.24□□□□□ -1.41
NANOGP9-201ENST00000439890 PSMC6P62333 389 aa6.24□□□□□ -1.41
NANOGP9-201ENST00000439890 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
NANOGP9-201ENST00000439890 SPAG1Q07617 926 aa6.24□□□□□ -1.41
NANOGP9-201ENST00000439890 SCAPQ12770 1279 aa6.24□□□□□ -1.41
NANOGP9-201ENST00000439890 STK4Q13043 487 aa6.24□□□□□ -1.41
NANOGP9-201ENST00000439890 COASYQ13057 564 aa6.24□□□□□ -1.41
NANOGP9-201ENST00000439890 GIT2Q14161 759 aa6.24□□□□□ -1.41
NANOGP9-201ENST00000439890 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
NANOGP9-201ENST00000439890 WDR78Q5VTH9 848 aa6.24□□□□□ -1.41
NANOGP9-201ENST00000439890 KLHL10Q6JEL2 608 aa6.24□□□□□ -1.41
NANOGP9-201ENST00000439890 RINT1Q6NUQ1 792 aa6.24□□□□□ -1.41
NANOGP9-201ENST00000439890 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa6.24□□□□□ -1.41
NANOGP9-201ENST00000439890 PGM2L1Q6PCE3 622 aa6.24□□□□□ -1.41
NANOGP9-201ENST00000439890 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa6.24□□□□□ -1.41
NANOGP9-201ENST00000439890 OTUD6AQ7L8S5 288 aa6.24□□□□□ -1.41
NANOGP9-201ENST00000439890 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa6.24□□□□□ -1.41
NANOGP9-201ENST00000439890 CNTD1Q8N815 330 aa6.24□□□□□ -1.41
NANOGP9-201ENST00000439890 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
NANOGP9-201ENST00000439890 SIMC1Q8NDZ2 872 aa6.24□□□□□ -1.41
NANOGP9-201ENST00000439890 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa6.24□□□□□ -1.41
NANOGP9-201ENST00000439890 NELFBQ8WX92 580 aa6.24□□□□□ -1.41
NANOGP9-201ENST00000439890 ATP6V0A1Q93050 837 aa6.24□□□□□ -1.41
NANOGP9-201ENST00000439890 VOPP1Q96AW1 172 aa6.24□□□□□ -1.41
NANOGP9-201ENST00000439890 BOD1Q96IK1 185 aa6.24□□□□□ -1.41
NANOGP9-201ENST00000439890 CTAGE1Q96RT6 745 aa6.24□□□□□ -1.41
NANOGP9-201ENST00000439890 PNKPQ96T60 521 aa6.24□□□□□ -1.41
NANOGP9-201ENST00000439890 AIFM2Q9BRQ8 373 aa6.24□□□□□ -1.41
NANOGP9-201ENST00000439890 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
NANOGP9-201ENST00000439890 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
NANOGP9-201ENST00000439890 PORCNQ9H237 461 aa6.24□□□□□ -1.41
NANOGP9-201ENST00000439890 HSD3B7Q9H2F3 369 aa6.24□□□□□ -1.41
NANOGP9-201ENST00000439890 BHMT2Q9H2M3 363 aa6.24□□□□□ -1.41
NANOGP9-201ENST00000439890 SEL1LQ9UBV2 794 aa6.24□□□□□ -1.41
NANOGP9-201ENST00000439890 GDAQ9Y2T3 454 aa6.24□□□□□ -1.41
NANOGP9-201ENST00000439890 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa6.24□□□□□ -1.41
NANOGP9-201ENST00000439890 DOCK5Q9H7D0 1870 aa6.24□□□□□ -1.41
NANOGP9-201ENST00000439890 ADGRA2Q96PE1 1338 aa6.24□□□□□ -1.41
NANOGP9-201ENST00000439890 TRGV11A0A075B6L2 103 aa6.23□□□□□ -1.41
NANOGP9-201ENST00000439890 SLC15A5A6NIM6 579 aa6.23□□□□□ -1.41
NANOGP9-201ENST00000439890 TBCAO75347 108 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
NANOGP9-201ENST00000439890 CCNE2O96020 404 aa6.23□□□□□ -1.41
NANOGP9-201ENST00000439890 SERPINC1P01008 464 aa6.23□□□□□ -1.41
NANOGP9-201ENST00000439890 AMY1AP04745 511 aa6.23□□□□□ -1.41
NANOGP9-201ENST00000439890 ADORA2AP29274 412 aa6.23□□□□□ -1.41
NANOGP9-201ENST00000439890 YWHABP31946 246 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
NANOGP9-201ENST00000439890 TM4SF4P48230 202 aa6.23□□□□□ -1.41
NANOGP9-201ENST00000439890 UBASH3AP57075 661 aa6.23□□□□□ -1.41
NANOGP9-201ENST00000439890 ACTR2P61160 394 aa6.23□□□□□ -1.41
NANOGP9-201ENST00000439890 NOMO3P69849 1222 aa6.23□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.7 ms