RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438547.6

SEMA4D-211, Transcript of semaphorin 4D, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SEMA4D, Length 4,824 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4D-211ENST00000438547 RNPEPQ9H4A4 650 aa11.4□□□□□ -0.58
SEMA4D-211ENST00000438547 POMKQ9H5K3 350 aa11.4□□□□□ -0.58
SEMA4D-211ENST00000438547 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa11.4□□□□□ -0.58
SEMA4D-211ENST00000438547 FAM198AQ9UFP1 575 aa11.4□□□□□ -0.58
SEMA4D-211ENST00000438547 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa11.4□□□□□ -0.58
SEMA4D-211ENST00000438547 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa11.4□□□□□ -0.58
SEMA4D-211ENST00000438547 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa11.4□□□□□ -0.58
SEMA4D-211ENST00000438547 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP11.4□□□□□ -0.58
SEMA4D-211ENST00000438547 SERPINA6P08185 405 aa11.4□□□□□ -0.58
SEMA4D-211ENST00000438547 ITGALP20701 1170 aa11.4□□□□□ -0.58
SEMA4D-211ENST00000438547 PSMB4P28070 264 aa11.4□□□□□ -0.58
SEMA4D-211ENST00000438547 LRPAP1P30533 357 aa11.4□□□□□ -0.58
SEMA4D-211ENST00000438547 CNTN2Q02246 1040 aa11.4□□□□□ -0.58
SEMA4D-211ENST00000438547 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.58
SEMA4D-211ENST00000438547 FAM126BQ8IXS8 530 aa11.4□□□□□ -0.58
SEMA4D-211ENST00000438547 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.58
SEMA4D-211ENST00000438547 OSBPL7Q9BZF2 842 aa11.4□□□□□ -0.58
SEMA4D-211ENST00000438547 DPY30Q9C005 99 aa11.4□□□□□ -0.58
SEMA4D-211ENST00000438547 ACTR8Q9H981 624 aa11.4□□□□□ -0.58
SEMA4D-211ENST00000438547 CLIC5Q9NZA1 410 aa11.4□□□□□ -0.58
SEMA4D-211ENST00000438547 MCM8Q9UJA3 840 aa11.4□□□□□ -0.58
SEMA4D-211ENST00000438547 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa11.4□□□□□ -0.58
SEMA4D-211ENST00000438547 DNM1LO00429 736 aa11.39□□□□□ -0.59
SEMA4D-211ENST00000438547 GPR182O15218 404 aa11.39□□□□□ -0.59
SEMA4D-211ENST00000438547 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
SEMA4D-211ENST00000438547 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
SEMA4D-211ENST00000438547 AKAP5P24588 427 aa11.39□□□□□ -0.59
SEMA4D-211ENST00000438547 C21orf59P57076 290 aa11.39□□□□□ -0.59
SEMA4D-211ENST00000438547 BNIP1Q12981 228 aa11.39□□□□□ -0.59
SEMA4D-211ENST00000438547 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
SEMA4D-211ENST00000438547 SLC27A1Q6PCB7 646 aa11.39□□□□□ -0.59
SEMA4D-211ENST00000438547 ULK2Q8IYT8 1036 aa11.39□□□□□ -0.59
SEMA4D-211ENST00000438547 FBXW8Q8N3Y1 598 aa11.39□□□□□ -0.59
SEMA4D-211ENST00000438547 KREMEN1Q96MU8 473 aa11.39□□□□□ -0.59
SEMA4D-211ENST00000438547 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
SEMA4D-211ENST00000438547 SCUBE2Q9NQ36 999 aa11.39□□□□□ -0.59
SEMA4D-211ENST00000438547 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
SEMA4D-211ENST00000438547 SETD4Q9NVD3 440 aa11.39□□□□□ -0.59
SEMA4D-211ENST00000438547 NMRK1Q9NWW6 199 aa11.39□□□□□ -0.59
SEMA4D-211ENST00000438547 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
SEMA4D-211ENST00000438547 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP11.39□□□□□ -0.59
SEMA4D-211ENST00000438547 ITGB5P18084 799 aa11.39□□□□□ -0.59
SEMA4D-211ENST00000438547 POU1F1P28069 291 aa11.39□□□□□ -0.59
SEMA4D-211ENST00000438547 RPL5P46777 297 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
SEMA4D-211ENST00000438547 SCNN1BP51168 640 aa11.39□□□□□ -0.59
SEMA4D-211ENST00000438547 WASHC5Q12768 1159 aa11.39□□□□□ -0.59
SEMA4D-211ENST00000438547 NEPROQ6NW34 567 aa11.39□□□□□ -0.59
SEMA4D-211ENST00000438547 TTC7BQ86TV6 843 aa11.39□□□□□ -0.59
SEMA4D-211ENST00000438547 OR5B17Q8NGF7 314 aa11.39□□□□□ -0.59
SEMA4D-211ENST00000438547 CASP10Q92851 521 aa11.39□□□□□ -0.59
SEMA4D-211ENST00000438547 ROGDIQ9GZN7 287 aa11.39□□□□□ -0.59
SEMA4D-211ENST00000438547 IL22Q9GZX6 179 aa11.39□□□□□ -0.59
SEMA4D-211ENST00000438547 ELOVL6Q9H5J4 265 aa11.39□□□□□ -0.59
SEMA4D-211ENST00000438547 PARVBQ9HBI1 364 aa11.39□□□□□ -0.59
SEMA4D-211ENST00000438547 HPS4Q9NQG7 708 aa11.39□□□□□ -0.59
SEMA4D-211ENST00000438547 SLC17A7Q9P2U7 560 aa11.39□□□□□ -0.59
SEMA4D-211ENST00000438547 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa11.39□□□□□ -0.59
SEMA4D-211ENST00000438547 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa11.39□□□□□ -0.59
SEMA4D-211ENST00000438547 RGSL1A5PLK6 1076 aa11.39□□□□□ -0.59
SEMA4D-211ENST00000438547 CCDC154A6NI56 674 aa11.39□□□□□ -0.59
SEMA4D-211ENST00000438547 UPP2O95045 317 aa11.39□□□□□ -0.59
SEMA4D-211ENST00000438547 PARNO95453 639 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
SEMA4D-211ENST00000438547 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP11.39□□□□□ -0.59
SEMA4D-211ENST00000438547 TUBP50607 506 aa11.39□□□□□ -0.59
SEMA4D-211ENST00000438547 PWP1Q13610 501 aa11.39□□□□□ -0.59
SEMA4D-211ENST00000438547 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
SEMA4D-211ENST00000438547 CAMK1DQ8IU85 385 aa11.39□□□□□ -0.59
SEMA4D-211ENST00000438547 MAGEC3Q8TD91 643 aa11.39□□□□□ -0.59
SEMA4D-211ENST00000438547 MBOAT7Q96N66 472 aa11.39□□□□□ -0.59
SEMA4D-211ENST00000438547 TBL1YQ9BQ87 522 aa11.39□□□□□ -0.59
SEMA4D-211ENST00000438547 UBXN6Q9BZV1 441 aa11.39□□□□□ -0.59
SEMA4D-211ENST00000438547 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa11.39□□□□□ -0.59
SEMA4D-211ENST00000438547 GIMAP4Q9NUV9 329 aa11.39□□□□□ -0.59
SEMA4D-211ENST00000438547 TAS2R13Q9NYV9 303 aa11.39□□□□□ -0.59
SEMA4D-211ENST00000438547 USE1Q9NZ43 259 aa11.39□□□□□ -0.59
SEMA4D-211ENST00000438547 DAPK2Q9UIK4 370 aa11.39□□□□□ -0.59
SEMA4D-211ENST00000438547 DSEQ9UL01 958 aa11.39□□□□□ -0.59
SEMA4D-211ENST00000438547 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
SEMA4D-211ENST00000438547 BIRC5O15392 142 aa11.39□□□□□ -0.59
SEMA4D-211ENST00000438547 RASSF9O75901 435 aa11.39□□□□□ -0.59
SEMA4D-211ENST00000438547 ENDOD1O94919 500 aa11.39□□□□□ -0.59
SEMA4D-211ENST00000438547 ZNF286BP0CG31 522 aa11.39□□□□□ -0.59
SEMA4D-211ENST00000438547 FECHP22830 423 aa11.39□□□□□ -0.59
SEMA4D-211ENST00000438547 THPOP40225 353 aa11.39□□□□□ -0.59
SEMA4D-211ENST00000438547 CCNG1P51959 295 aa11.39□□□□□ -0.59
SEMA4D-211ENST00000438547 KCTD21Q4G0X4 260 aa11.39□□□□□ -0.59
SEMA4D-211ENST00000438547 ECHDC2Q86YB7 292 aa11.39□□□□□ -0.59
SEMA4D-211ENST00000438547 C12orf56Q8IXR9 622 aa11.39□□□□□ -0.59
SEMA4D-211ENST00000438547 FITM2Q8N6M3 262 aa11.39□□□□□ -0.59
SEMA4D-211ENST00000438547 METTL6Q8TCB7 284 aa11.39□□□□□ -0.59
SEMA4D-211ENST00000438547 PHF21AQ96BD5 680 aa11.39□□□□□ -0.59
SEMA4D-211ENST00000438547 ARL8BQ9NVJ2 186 aa11.39□□□□□ -0.59
SEMA4D-211ENST00000438547 LIMD1Q9UGP4 676 aa11.39□□□□□ -0.59
SEMA4D-211ENST00000438547 TMCC3Q9ULS5 477 aa11.39□□□□□ -0.59
SEMA4D-211ENST00000438547 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa11.38□□□□□ -0.59
SEMA4D-211ENST00000438547 FGFR3P22607 806 aa11.38□□□□□ -0.59
SEMA4D-211ENST00000438547 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP11.38□□□□□ -0.59
SEMA4D-211ENST00000438547 BNIPLQ7Z465 357 aa11.38□□□□□ -0.59
SEMA4D-211ENST00000438547 ARPINQ7Z6K5 226 aa11.38□□□□□ -0.59
SEMA4D-211ENST00000438547 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.4 ms