RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000431803.2

CDC42-IT1-201, CDC42 intronic transcript 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CDC42-IT1, Length 692 nt, Biotype sense intronic.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42-IT1-201ENST00000431803 STK32AQ8WU08 396 aa9.77□□□□□ -0.85
CDC42-IT1-201ENST00000431803 GOLGA1Q92805 767 aa9.77□□□□□ -0.85
CDC42-IT1-201ENST00000431803 MYEOVQ96EZ4 313 aa9.77□□□□□ -0.85
CDC42-IT1-201ENST00000431803 MYO19Q96H55 970 aa9.77□□□□□ -0.85
CDC42-IT1-201ENST00000431803 SLC39A13Q96H72 371 aa9.77□□□□□ -0.85
CDC42-IT1-201ENST00000431803 SERPINB11Q96P15 392 aa9.77□□□□□ -0.85
CDC42-IT1-201ENST00000431803 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
CDC42-IT1-201ENST00000431803 LHX5Q9H2C1 402 aa9.77□□□□□ -0.85
CDC42-IT1-201ENST00000431803 PRSS16Q9NQE7 514 aa9.77□□□□□ -0.85
CDC42-IT1-201ENST00000431803 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
CDC42-IT1-201ENST00000431803 TLR6Q9Y2C9 796 aa9.77□□□□□ -0.85
CDC42-IT1-201ENST00000431803 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa9.77□□□□□ -0.85
CDC42-IT1-201ENST00000431803 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP9.77□□□□□ -0.85
CDC42-IT1-201ENST00000431803 NUMA1Q14980 2115 aa9.76□□□□□ -0.85
CDC42-IT1-201ENST00000431803 FAM221BA6H8Z2 402 aa9.76□□□□□ -0.85
CDC42-IT1-201ENST00000431803 TMEM8BA6NDV4 472 aa9.76□□□□□ -0.85
CDC42-IT1-201ENST00000431803 H0Y626 953 aa9.76□□□□□ -0.85
CDC42-IT1-201ENST00000431803 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
CDC42-IT1-201ENST00000431803 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
CDC42-IT1-201ENST00000431803 SH3BP5O60239 455 aa9.76□□□□□ -0.85
CDC42-IT1-201ENST00000431803 TBL1XO60907 577 aa9.76□□□□□ -0.85
CDC42-IT1-201ENST00000431803 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
CDC42-IT1-201ENST00000431803 TRIM16O95361 564 aa9.76□□□□□ -0.85
CDC42-IT1-201ENST00000431803 IGLV3-25P01717 112 aa9.76□□□□□ -0.85
CDC42-IT1-201ENST00000431803 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
CDC42-IT1-201ENST00000431803 ZNF883P0CG24 379 aa9.76□□□□□ -0.85
CDC42-IT1-201ENST00000431803 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
CDC42-IT1-201ENST00000431803 ACSL1P33121 698 aa9.76□□□□□ -0.85
CDC42-IT1-201ENST00000431803 ACADSBP45954 432 aa9.76□□□□□ -0.85
CDC42-IT1-201ENST00000431803 STX17P56962 302 aa9.76□□□□□ -0.85
CDC42-IT1-201ENST00000431803 RPS14P62263 151 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
CDC42-IT1-201ENST00000431803 BNC1Q01954 994 aa9.76□□□□□ -0.85
CDC42-IT1-201ENST00000431803 ARID5BQ14865 1188 aa9.76□□□□□ -0.85
CDC42-IT1-201ENST00000431803 DENND1BQ6P3S1 775 aa9.76□□□□□ -0.85
CDC42-IT1-201ENST00000431803 TAC4Q86UU9 113 aa9.76□□□□□ -0.85
CDC42-IT1-201ENST00000431803 FAM124AQ86V42 546 aa9.76□□□□□ -0.85
CDC42-IT1-201ENST00000431803 NAXDQ8IW45 347 aa9.76□□□□□ -0.85
CDC42-IT1-201ENST00000431803 MFN1Q8IWA4 741 aa9.76□□□□□ -0.85
CDC42-IT1-201ENST00000431803 ZNF366Q8N895 744 aa9.76□□□□□ -0.85
CDC42-IT1-201ENST00000431803 FIBINQ8TAL6 211 aa9.76□□□□□ -0.85
CDC42-IT1-201ENST00000431803 TTC17Q96AE7 1141 aa9.76□□□□□ -0.85
CDC42-IT1-201ENST00000431803 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
CDC42-IT1-201ENST00000431803 CAMK1GQ96NX5 476 aa9.76□□□□□ -0.85
CDC42-IT1-201ENST00000431803 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
CDC42-IT1-201ENST00000431803 TRIM62Q9BVG3 475 aa9.76□□□□□ -0.85
CDC42-IT1-201ENST00000431803 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
CDC42-IT1-201ENST00000431803 MIS12Q9H081 205 aa9.76□□□□□ -0.85
CDC42-IT1-201ENST00000431803 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
CDC42-IT1-201ENST00000431803 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
CDC42-IT1-201ENST00000431803 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
CDC42-IT1-201ENST00000431803 KLK13Q9UKR3 277 aa9.76□□□□□ -0.85
CDC42-IT1-201ENST00000431803 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
CDC42-IT1-201ENST00000431803 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa9.76□□□□□ -0.85
CDC42-IT1-201ENST00000431803 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
CDC42-IT1-201ENST00000431803 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa9.76□□□□□ -0.85
CDC42-IT1-201ENST00000431803 KNL1Q8NG31 2342 aa9.75□□□□□ -0.85
CDC42-IT1-201ENST00000431803 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
CDC42-IT1-201ENST00000431803 CBFA2T3O75081 653 aa9.75□□□□□ -0.85
CDC42-IT1-201ENST00000431803 ASLP04424 464 aa9.75□□□□□ -0.85
CDC42-IT1-201ENST00000431803 KRT5P13647 590 aa9.75□□□□□ -0.85
CDC42-IT1-201ENST00000431803 CSKP41240 450 aa9.75□□□□□ -0.85
CDC42-IT1-201ENST00000431803 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
CDC42-IT1-201ENST00000431803 RPS24P62847 133 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
CDC42-IT1-201ENST00000431803 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
CDC42-IT1-201ENST00000431803 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
CDC42-IT1-201ENST00000431803 ZNF423Q2M1K9 1284 aa9.75□□□□□ -0.85
CDC42-IT1-201ENST00000431803 MS4A13Q5J8X5 152 aa9.75□□□□□ -0.85
CDC42-IT1-201ENST00000431803 SYPL2Q5VXT5 272 aa9.75□□□□□ -0.85
CDC42-IT1-201ENST00000431803 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
CDC42-IT1-201ENST00000431803 TRIM65Q6PJ69 517 aa9.75□□□□□ -0.85
CDC42-IT1-201ENST00000431803 IL27RAQ6UWB1 636 aa9.75□□□□□ -0.85
CDC42-IT1-201ENST00000431803 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa9.75□□□□□ -0.85
CDC42-IT1-201ENST00000431803 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
CDC42-IT1-201ENST00000431803 GLRX5Q86SX6 157 aa9.75□□□□□ -0.85
CDC42-IT1-201ENST00000431803 TMEM110Q86TL2 294 aa9.75□□□□□ -0.85
CDC42-IT1-201ENST00000431803 KDM1BQ8NB78 822 aa9.75□□□□□ -0.85
CDC42-IT1-201ENST00000431803 ADAM32Q8TC27 787 aa9.75□□□□□ -0.85
CDC42-IT1-201ENST00000431803 ZNF606Q8WXB4 792 aa9.75□□□□□ -0.85
CDC42-IT1-201ENST00000431803 FAM149B1Q96BN6 582 aa9.75□□□□□ -0.85
CDC42-IT1-201ENST00000431803 MRGPRX3Q96LB0 322 aa9.75□□□□□ -0.85
CDC42-IT1-201ENST00000431803 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa9.75□□□□□ -0.85
CDC42-IT1-201ENST00000431803 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
CDC42-IT1-201ENST00000431803 IL21RQ9HBE5 538 aa9.75□□□□□ -0.85
CDC42-IT1-201ENST00000431803 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
CDC42-IT1-201ENST00000431803 OSGEPQ9NPF4 335 aa9.75□□□□□ -0.85
CDC42-IT1-201ENST00000431803 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa9.75□□□□□ -0.85
CDC42-IT1-201ENST00000431803 ST7Q9NRC1 585 aa9.75□□□□□ -0.85
CDC42-IT1-201ENST00000431803 STIM2Q9P246 746 aa9.75□□□□□ -0.85
CDC42-IT1-201ENST00000431803 CYTH4Q9UIA0 394 aa9.75□□□□□ -0.85
CDC42-IT1-201ENST00000431803 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
CDC42-IT1-201ENST00000431803 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa9.75□□□□□ -0.85
CDC42-IT1-201ENST00000431803 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
CDC42-IT1-201ENST00000431803 MSRB2Q9Y3D2 182 aa9.75□□□□□ -0.85
CDC42-IT1-201ENST00000431803 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa9.75□□□□□ -0.85
CDC42-IT1-201ENST00000431803 LOC400499M0QZD8 3231 aa9.75□□□□□ -0.85
CDC42-IT1-201ENST00000431803 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
CDC42-IT1-201ENST00000431803 BECN2A8MW95 431 aa9.74□□□□□ -0.85
CDC42-IT1-201ENST00000431803 C10orf142B7Z368 130 aa9.74□□□□□ -0.85
CDC42-IT1-201ENST00000431803 E5RJQ4 531 aa9.74□□□□□ -0.85
CDC42-IT1-201ENST00000431803 MED7O43513 233 aa9.74□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.4 ms