RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000390930.1

SNORD17-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 17, humanhuman

BASIC

Gene SNORD17, Length 237 nt, Biotype snoRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD17-201ENST00000390930 MAP7D1Q3KQU3 841 aa3.58□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 PITRM1Q5JRX3 1037 aa3.58□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 BRMS1LQ5PSV4 323 aa3.58□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 CCDC122Q5T0U0 273 aa3.58□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 MBLAC2Q68D91 279 aa3.58□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa3.58□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 DNAJC24Q6P3W2 148 aa3.58□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 CHST9Q7L1S5 443 aa3.58□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 STRADAQ7RTN6 431 aa3.58□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 TMC6Q7Z403 805 aa3.58□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa3.58□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 KBTBD6Q86V97 674 aa3.58□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 NLRP14Q86W24 1093 aa3.58□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 LONP2Q86WA8 852 aa3.58□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 MFN1Q8IWA4 741 aa3.58□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 TP53INP2Q8IXH6 220 aa3.58□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 DRC7Q8IY82 874 aa3.58□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 CARNMT1Q8N4J0 409 aa3.58□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 DCLK2Q8N568 766 aa3.58□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 MSANTD4Q8NCY6 345 aa3.58□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 OR8K1Q8NGG5 319 aa3.58□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 KCNV2Q8TDN2 545 aa3.58□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 RLN3Q8WXF3 142 aa3.58□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 RNF34Q969K3 372 aa3.58□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 ZNF653Q96CK0 615 aa3.58□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 FAM122AQ96E09 287 aa3.58□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 C1orf74Q96LT6 269 aa3.58□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 MCEEQ96PE7 176 aa3.58□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 HAPLN3Q96S86 360 aa3.58□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP3.58□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 TRIM62Q9BVG3 475 aa3.58□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 SELENOOQ9BVL4 669 aa3.58□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 SLC2A11Q9BYW1 496 aa3.58□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 TPSD1Q9BZJ3 242 aa3.58□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 SIK2Q9H0K1 926 aa3.58□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 OSBPL2Q9H1P3 480 aa3.58□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 EPC1Q9H2F5 836 aa3.58□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 WDCPQ9H6R7 721 aa3.58□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 ABHD10Q9NUJ1 306 aa3.58□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa3.58□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 MPP6Q9NZW5 540 aa3.58□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 MYO1AQ9UBC5 1043 aa3.58□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa3.58□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 FZD10Q9ULW2 581 aa3.58□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 STAP1Q9ULZ2 295 aa3.58□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 TFR2Q9UP52 801 aa3.58□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 SLC8A2Q9UPR5 921 aa3.58□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 INVSQ9Y283 1065 aa3.58□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa3.58□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa3.58□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP3.58□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 ACTL7AQ9Y615 435 aa3.58□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 STON1Q9Y6Q2 735 aa3.58□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa3.58□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 ZNF292O60281 2723 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 A0A0U1RQJ8 604 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 A0A1B0GVM2 712 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 RCCD1A6NED2 376 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 TCAF2A6NFQ2 919 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 TTC34A8MYJ7 566 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 C10orf142B7Z368 130 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 H0Y626 953 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 K7ERQ8 282 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 AXIN1O15169 862 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 TIMM44O43615 452 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 SNAP91O60641 907 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 SRGAP2O75044 1071 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 LRCH4O75427 683 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 ZMPSTE24O75844 475 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 LRIG2O94898 1065 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 APBB3O95704 486 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 DLDP09622 509 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 CCDC172P0C7W6 258 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 SLC2A3P11169 496 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 HOXB2P14652 356 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 VAV1P15498 845 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 FECHP22830 423 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 IL4RP24394 825 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 MIPP30301 263 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 P2RY2P41231 377 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 MRE11P49959 708 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 ARSEP51690 589 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 DGKEP52429 567 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 PLK1P53350 603 aa3.57□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.7 ms