RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000389993.7

PSME4-201, Transcript of proteasome activator subunit 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PSME4, Length 6,581 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME4-201ENST00000389993 MAN1C1Q9NR34 630 aa14.88□□□□□ -0.03
PSME4-201ENST00000389993 CRTAMO95727 393 aa14.88□□□□□ -0.03
PSME4-201ENST00000389993 ACRP10323 421 aa14.88□□□□□ -0.03
PSME4-201ENST00000389993 SEMG2Q02383 582 aa14.88□□□□□ -0.03
PSME4-201ENST00000389993 MAPRE2Q15555 327 aa14.88□□□□□ -0.03
PSME4-201ENST00000389993 RFWD3Q6PCD5 774 aa14.88□□□□□ -0.03
PSME4-201ENST00000389993 PHACTR4Q8IZ21 702 aa14.88□□□□□ -0.03
PSME4-201ENST00000389993 CMTM5Q96DZ9 223 aa14.88□□□□□ -0.03
PSME4-201ENST00000389993 SPATA16Q9BXB7 569 aa14.88□□□□□ -0.03
PSME4-201ENST00000389993 ZNF112Q9UJU3 913 aa14.88□□□□□ -0.03
PSME4-201ENST00000389993 A0A1W2PPM1 405 aa14.87□□□□□ -0.03
PSME4-201ENST00000389993 CFAP99D6REC4 459 aa14.87□□□□□ -0.03
PSME4-201ENST00000389993 NRLP54845 237 aa14.87□□□□□ -0.03
PSME4-201ENST00000389993 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
PSME4-201ENST00000389993 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
PSME4-201ENST00000389993 ADGRE3Q9BY15 652 aa14.87□□□□□ -0.03
PSME4-201ENST00000389993 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
PSME4-201ENST00000389993 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
PSME4-201ENST00000389993 ABCC13Q9NSE7 274 aa14.87□□□□□ -0.03
PSME4-201ENST00000389993 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
PSME4-201ENST00000389993 SCAMP1O15126 338 aa14.87□□□□□ -0.03
PSME4-201ENST00000389993 PFDN1O60925 122 aa14.87□□□□□ -0.03
PSME4-201ENST00000389993 SEL1L3Q68CR1 1132 aa14.87□□□□□ -0.03
PSME4-201ENST00000389993 PMF1Q6P1K2 205 aa14.87□□□□□ -0.03
PSME4-201ENST00000389993 OTOP3Q7RTS5 596 aa14.87□□□□□ -0.03
PSME4-201ENST00000389993 CENPKQ9BS16 269 aa14.87□□□□□ -0.03
PSME4-201ENST00000389993 FOXP3Q9BZS1 431 aa14.87□□□□□ -0.03
PSME4-201ENST00000389993 ALDH9A1P49189 494 aa14.87□□□□□ -0.03
PSME4-201ENST00000389993 MBTD1Q05BQ5 628 aa14.87□□□□□ -0.03
PSME4-201ENST00000389993 CDH17Q12864 832 aa14.87□□□□□ -0.03
PSME4-201ENST00000389993 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
PSME4-201ENST00000389993 AGKQ53H12 422 aa14.87□□□□□ -0.03
PSME4-201ENST00000389993 MYO1HQ8N1T3 1032 aa14.87□□□□□ -0.03
PSME4-201ENST00000389993 RAB42Q8N4Z0 105 aa14.87□□□□□ -0.03
PSME4-201ENST00000389993 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
PSME4-201ENST00000389993 CCL16O15467 120 aa14.87□□□□□ -0.03
PSME4-201ENST00000389993 GSSP48637 474 aa14.87□□□□□ -0.03
PSME4-201ENST00000389993 PIK3R5Q8WYR1 880 aa14.87□□□□□ -0.03
PSME4-201ENST00000389993 RNF157Q96PX1 679 aa14.87□□□□□ -0.03
PSME4-201ENST00000389993 SYBUQ9NX95 663 aa14.87□□□□□ -0.03
PSME4-201ENST00000389993 ABCC6O95255 1503 aa14.87□□□□□ -0.03
PSME4-201ENST00000389993 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
PSME4-201ENST00000389993 TMEM88BA6NKF7 163 aa14.87□□□□□ -0.03
PSME4-201ENST00000389993 BTN3A1O00481 513 aa14.87□□□□□ -0.03
PSME4-201ENST00000389993 KLHL2O95198 593 aa14.87□□□□□ -0.03
PSME4-201ENST00000389993 HDCP19113 662 aa14.87□□□□□ -0.03
PSME4-201ENST00000389993 CDC25CP30307 473 aa14.87□□□□□ -0.03
PSME4-201ENST00000389993 DMC1Q14565 340 aa14.87□□□□□ -0.03
PSME4-201ENST00000389993 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
PSME4-201ENST00000389993 RRM2BQ7LG56 351 aa14.87□□□□□ -0.03
PSME4-201ENST00000389993 ANKRD52Q8NB46 1076 aa14.87□□□□□ -0.03
PSME4-201ENST00000389993 HES6Q96HZ4 224 aa14.87□□□□□ -0.03
PSME4-201ENST00000389993 VCPIP1Q96JH7 1222 aa14.87□□□□□ -0.03
PSME4-201ENST00000389993 CNDP1Q96KN2 507 aa14.87□□□□□ -0.03
PSME4-201ENST00000389993 CYP2S1Q96SQ9 504 aa14.87□□□□□ -0.03
PSME4-201ENST00000389993 ECSITQ9BQ95 431 aa14.87□□□□□ -0.03
PSME4-201ENST00000389993 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
PSME4-201ENST00000389993 MGEA5O60502 916 aa14.86□□□□□ -0.03
PSME4-201ENST00000389993 CRHR2Q13324 411 aa14.86□□□□□ -0.03
PSME4-201ENST00000389993 C16orf89Q6UX73 402 aa14.86□□□□□ -0.03
PSME4-201ENST00000389993 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
PSME4-201ENST00000389993 TSC22D3Q99576 134 aa14.86□□□□□ -0.03
PSME4-201ENST00000389993 NFKBIZQ9BYH8 718 aa14.86□□□□□ -0.03
PSME4-201ENST00000389993 ALG9Q9H6U8 611 aa14.86□□□□□ -0.03
PSME4-201ENST00000389993 TIMM44O43615 452 aa14.86□□□□□ -0.03
PSME4-201ENST00000389993 PLCL1Q15111 1095 aa14.86□□□□□ -0.03
PSME4-201ENST00000389993 LINGO4Q6UY18 593 aa14.86□□□□□ -0.03
PSME4-201ENST00000389993 CEP19Q96LK0 163 aa14.86□□□□□ -0.03
PSME4-201ENST00000389993 SNX8Q9Y5X2 465 aa14.86□□□□□ -0.03
PSME4-201ENST00000389993 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa14.86□□□□□ -0.03
PSME4-201ENST00000389993 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
PSME4-201ENST00000389993 CCNB1P14635 433 aa14.86□□□□□ -0.03
PSME4-201ENST00000389993 PGAM1P18669 254 aa14.86□□□□□ -0.03
PSME4-201ENST00000389993 SERPINB3P29508 390 aa14.86□□□□□ -0.03
PSME4-201ENST00000389993 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
PSME4-201ENST00000389993 SLC45A4Q5BKX6 768 aa14.86□□□□□ -0.03
PSME4-201ENST00000389993 UNC5AQ6ZN44 842 aa14.86□□□□□ -0.03
PSME4-201ENST00000389993 FAM35AQ86V20 835 aa14.86□□□□□ -0.03
PSME4-201ENST00000389993 ZNF614Q8N883 585 aa14.86□□□□□ -0.03
PSME4-201ENST00000389993 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
PSME4-201ENST00000389993 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
PSME4-201ENST00000389993 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
PSME4-201ENST00000389993 DUOX1Q9NRD9 1551 aa14.86□□□□□ -0.03
PSME4-201ENST00000389993 DOT1LQ8TEK3 1739 aa14.86□□□□□ -0.03
PSME4-201ENST00000389993 CD151P48509 253 aa14.86□□□□□ -0.03
PSME4-201ENST00000389993 ALLCQ8N6M5 410 aa14.86□□□□□ -0.03
PSME4-201ENST00000389993 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
PSME4-201ENST00000389993 HIPK3Q9H422 1215 aa14.86□□□□□ -0.03
PSME4-201ENST00000389993 MID1IP1Q9NPA3 183 aa14.86□□□□□ -0.03
PSME4-201ENST00000389993 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa14.86□□□□□ -0.03
PSME4-201ENST00000389993 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
PSME4-201ENST00000389993 FKTNO75072 461 aa14.86□□□□□ -0.03
PSME4-201ENST00000389993 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
PSME4-201ENST00000389993 RAP1GDS1P52306 607 aa14.86□□□□□ -0.03
PSME4-201ENST00000389993 PRR23CQ6ZRP0 262 aa14.86□□□□□ -0.03
PSME4-201ENST00000389993 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
PSME4-201ENST00000389993 CCDC185Q8N715 623 aa14.86□□□□□ -0.03
PSME4-201ENST00000389993 SERAC1Q96JX3 654 aa14.86□□□□□ -0.03
PSME4-201ENST00000389993 NOD2Q9HC29 1040 aa14.86□□□□□ -0.03
PSME4-201ENST00000389993 ITM2BQ9Y287 266 aa14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.3 ms