RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380075.6

TRIM54-202, Transcript of tripartite motif containing 54, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRIM54, Length 1,967 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54-202ENST00000380075 TIGD5Q53EQ6 642 aa22.11■■□□□ 1.13
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TRIM54-202ENST00000380075 TRIM55Q9BYV6 548 aa22.11■■□□□ 1.13
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TRIM54-202ENST00000380075 PLLPQ9Y342 182 aa22.11■■□□□ 1.13
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TRIM54-202ENST00000380075 MYLK2Q9H1R3 596 aa22.1■■□□□ 1.13
TRIM54-202ENST00000380075 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa22.1■■□□□ 1.13
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TRIM54-202ENST00000380075 A0A0U1RQF3 1178 aa22.1■■□□□ 1.13
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TRIM54-202ENST00000380075 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa22.1■■□□□ 1.13
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TRIM54-202ENST00000380075 COLEC11Q9BWP8 271 aa22.1■■□□□ 1.13
TRIM54-202ENST00000380075 FGBP02675 491 aa22.09■■□□□ 1.13
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TRIM54-202ENST00000380075 PSMB4P28070 264 aa22.09■■□□□ 1.13
TRIM54-202ENST00000380075 SERPINB6P35237 376 aa22.09■■□□□ 1.13
TRIM54-202ENST00000380075 CXCR3P49682 368 aa22.09■■□□□ 1.13
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TRIM54-202ENST00000380075 BHLHA9Q7RTU4 235 aa22.09■■□□□ 1.13
TRIM54-202ENST00000380075 ACMSDQ8TDX5 336 aa22.09■■□□□ 1.13
TRIM54-202ENST00000380075 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
TRIM54-202ENST00000380075 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
TRIM54-202ENST00000380075 WDR27A2RRH5 827 aa22.08■■□□□ 1.13
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TRIM54-202ENST00000380075 PID1Q7Z2X4 250 aa22.08■■□□□ 1.12
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TRIM54-202ENST00000380075 KCNJ2P63252 427 aa22.07■■□□□ 1.12
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