RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362913.1

SNORD56.1-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 56, humanhuman

BASIC

Gene SNORD56, Length 68 nt, Biotype snoRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD56.1-201ENST00000362913 ESX1Q8N693 406 aa2.9□□□□□ -1.95
SNORD56.1-201ENST00000362913 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP2.9□□□□□ -1.95
SNORD56.1-201ENST00000362913 C8orf58Q8NAV2 365 aa2.9□□□□□ -1.95
SNORD56.1-201ENST00000362913 OR52N4Q8NGI2 321 aa2.9□□□□□ -1.95
SNORD56.1-201ENST00000362913 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa2.9□□□□□ -1.95
SNORD56.1-201ENST00000362913 CLEC4CQ8WTT0 213 aa2.9□□□□□ -1.95
SNORD56.1-201ENST00000362913 ZFPM2Q8WW38 1151 aa2.9□□□□□ -1.95
SNORD56.1-201ENST00000362913 NCSTNQ92542 709 aa2.9□□□□□ -1.95
SNORD56.1-201ENST00000362913 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP2.9□□□□□ -1.95
SNORD56.1-201ENST00000362913 MPP4Q96JB8 637 aa2.9□□□□□ -1.95
SNORD56.1-201ENST00000362913 GPR78Q96P69 363 aa2.9□□□□□ -1.95
SNORD56.1-201ENST00000362913 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP2.9□□□□□ -1.95
SNORD56.1-201ENST00000362913 GPR63Q9BZJ6 419 aa2.9□□□□□ -1.95
SNORD56.1-201ENST00000362913 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP2.9□□□□□ -1.95
SNORD56.1-201ENST00000362913 TAOK3Q9H2K8 898 aa2.9□□□□□ -1.95
SNORD56.1-201ENST00000362913 TXNRD2Q9NNW7 524 aa2.9□□□□□ -1.95
SNORD56.1-201ENST00000362913 UBN1Q9NPG3 1134 aa2.9□□□□□ -1.95
SNORD56.1-201ENST00000362913 GGA3Q9NZ52 723 aa2.9□□□□□ -1.95
SNORD56.1-201ENST00000362913 TBX20Q9UMR3 447 aa2.9□□□□□ -1.95
SNORD56.1-201ENST00000362913 RCE1Q9Y256 329 aa2.9□□□□□ -1.95
SNORD56.1-201ENST00000362913 DTX4Q9Y2E6 619 aa2.9□□□□□ -1.95
SNORD56.1-201ENST00000362913 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP2.9□□□□□ -1.95
SNORD56.1-201ENST00000362913 LMTK3Q96Q04 1460 aa2.9□□□□□ -1.95
SNORD56.1-201ENST00000362913 NPIPB13A6NJU9 1138 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD56.1-201ENST00000362913 C16orf96A6NNT2 1141 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD56.1-201ENST00000362913 NPIPB5A8MRT5 1133 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD56.1-201ENST00000362913 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
SNORD56.1-201ENST00000362913 KCNJ18B7U540 433 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD56.1-201ENST00000362913 TISP43B9A030 160 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD56.1-201ENST00000362913 NPIPB4C9JG80 1138 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD56.1-201ENST00000362913 J3KRW8 73 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD56.1-201ENST00000362913 SMIM22K7EJ46 135 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD56.1-201ENST00000362913 DSCR3O14972 297 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD56.1-201ENST00000362913 INPPL1O15357 1258 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD56.1-201ENST00000362913 KLK10O43240 276 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD56.1-201ENST00000362913 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
SNORD56.1-201ENST00000362913 TULP3O75386 442 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD56.1-201ENST00000362913 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
SNORD56.1-201ENST00000362913 AGR2O95994 175 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD56.1-201ENST00000362913 SLPIP03973 132 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD56.1-201ENST00000362913 TUBB4AP04350 444 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD56.1-201ENST00000362913 CSF1P09603 554 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD56.1-201ENST00000362913 CYP2D6P10635 497 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD56.1-201ENST00000362913 CYP4B1P13584 511 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD56.1-201ENST00000362913 PKMP14618 531 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
SNORD56.1-201ENST00000362913 TFEBP19484 476 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD56.1-201ENST00000362913 RPS6KB1P23443 525 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD56.1-201ENST00000362913 PRPH2P23942 346 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD56.1-201ENST00000362913 CNTFP26441 200 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD56.1-201ENST00000362913 GSTM2P28161 218 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD56.1-201ENST00000362913 ELF1P32519 619 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD56.1-201ENST00000362913 IDUAP35475 653 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD56.1-201ENST00000362913 PGM1P36871 562 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD56.1-201ENST00000362913 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
SNORD56.1-201ENST00000362913 SOX2P48431 317 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD56.1-201ENST00000362913 MVDP53602 400 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD56.1-201ENST00000362913 SHC2P98077 582 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD56.1-201ENST00000362913 TFF2Q03403 129 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD56.1-201ENST00000362913 FOXF2Q12947 444 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD56.1-201ENST00000362913 SEMA3AQ14563 771 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD56.1-201ENST00000362913 GXYLT1Q4G148 440 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD56.1-201ENST00000362913 C10orf76Q5T2E6 689 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD56.1-201ENST00000362913 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
SNORD56.1-201ENST00000362913 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
SNORD56.1-201ENST00000362913 ZNF788Q6ZQV5 615 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD56.1-201ENST00000362913 TMEM200AQ86VY9 491 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD56.1-201ENST00000362913 RHPN2Q8IUC4 686 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD56.1-201ENST00000362913 SCN4BQ8IWT1 228 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD56.1-201ENST00000362913 EXD3Q8N9H8 876 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD56.1-201ENST00000362913 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
SNORD56.1-201ENST00000362913 PIGKQ92643 395 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD56.1-201ENST00000362913 HTRA1Q92743 480 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD56.1-201ENST00000362913 HVCN1Q96D96 273 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD56.1-201ENST00000362913 CLMNQ96JQ2 1002 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD56.1-201ENST00000362913 FCRL5Q96RD9 977 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD56.1-201ENST00000362913 CD180Q99467 661 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD56.1-201ENST00000362913 FAM118BQ9BPY3 351 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD56.1-201ENST00000362913 TRIM31Q9BZY9 425 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD56.1-201ENST00000362913 ZHX3Q9H4I2 956 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD56.1-201ENST00000362913 RMI1Q9H9A7 625 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD56.1-201ENST00000362913 THAP1Q9NVV9 213 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD56.1-201ENST00000362913 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD56.1-201ENST00000362913 KLQ9UEF7 1012 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD56.1-201ENST00000362913 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
SNORD56.1-201ENST00000362913 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
SNORD56.1-201ENST00000362913 SLC25A13Q9UJS0 675 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD56.1-201ENST00000362913 TNFSF13BQ9Y275 285 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD56.1-201ENST00000362913 PKP3Q9Y446 797 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD56.1-201ENST00000362913 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa2.88□□□□□ -1.95
SNORD56.1-201ENST00000362913 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP2.88□□□□□ -1.95
SNORD56.1-201ENST00000362913 GAGE10A6NGK3 116 aa2.88□□□□□ -1.95
SNORD56.1-201ENST00000362913 LRRC3CA6NJW4 275 aa2.88□□□□□ -1.95
SNORD56.1-201ENST00000362913 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP2.88□□□□□ -1.95
SNORD56.1-201ENST00000362913 PEX12O00623 359 aa2.88□□□□□ -1.95
SNORD56.1-201ENST00000362913 RRHO14718 337 aa2.88□□□□□ -1.95
SNORD56.1-201ENST00000362913 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
SNORD56.1-201ENST00000362913 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
SNORD56.1-201ENST00000362913 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
SNORD56.1-201ENST00000362913 NUDT3O95989 172 aa2.88□□□□□ -1.95
SNORD56.1-201ENST00000362913 PLAUP00749 431 aa2.88□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49 ms