RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361543.3

SGMS1-201, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SGMS1, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-201ENST00000361543 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP7.92□□□□□ -1.14
SGMS1-201ENST00000361543 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP7.92□□□□□ -1.14
SGMS1-201ENST00000361543 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP7.92□□□□□ -1.14
SGMS1-201ENST00000361543 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP7.92□□□□□ -1.14
SGMS1-201ENST00000361543 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP7.92□□□□□ -1.14
SGMS1-201ENST00000361543 ERICH1Q86X53 443 aa7.92□□□□□ -1.14
SGMS1-201ENST00000361543 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP7.92□□□□□ -1.14
SGMS1-201ENST00000361543 XYLT1Q86Y38 959 aa7.92□□□□□ -1.14
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SGMS1-201ENST00000361543 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa7.92□□□□□ -1.14
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SGMS1-201ENST00000361543 TMEM74BQ9NUR3 256 aa7.92□□□□□ -1.14
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SGMS1-201ENST00000361543 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa7.92□□□□□ -1.14
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SGMS1-201ENST00000361543 M0QYT0 321 aa7.91□□□□□ -1.14
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SGMS1-201ENST00000361543 TTC17Q96AE7 1141 aa7.91□□□□□ -1.14
SGMS1-201ENST00000361543 C18orf8Q96DM3 657 aa7.91□□□□□ -1.14
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SGMS1-201ENST00000361543 PIGVQ9NUD9 493 aa7.91□□□□□ -1.14
SGMS1-201ENST00000361543 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP7.91□□□□□ -1.14
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SGMS1-201ENST00000361543 STAP1Q9ULZ2 295 aa7.91□□□□□ -1.14
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SGMS1-201ENST00000361543 ITIH6Q6UXX5 1313 aa7.9□□□□□ -1.14
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SGMS1-201ENST00000361543 MEI4A8MW99 385 aa7.9□□□□□ -1.14
SGMS1-201ENST00000361543 PAGE1O75459 146 aa7.9□□□□□ -1.14
SGMS1-201ENST00000361543 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP7.9□□□□□ -1.14
SGMS1-201ENST00000361543 SERPINF2P08697 491 aa7.9□□□□□ -1.14
SGMS1-201ENST00000361543 PDGFRAP16234 1089 aa7.9□□□□□ -1.14
SGMS1-201ENST00000361543 ENGP17813 658 aa7.9□□□□□ -1.14
SGMS1-201ENST00000361543 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP7.9□□□□□ -1.14
SGMS1-201ENST00000361543 SOX5P35711 763 aa7.9□□□□□ -1.14
SGMS1-201ENST00000361543 FLT3P36888 993 aa7.9□□□□□ -1.14
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