RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319942.7

RABGGTB-201, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTB, Length 1,496 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-201ENST00000319942 PAGE1O75459 146 aa10.42□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 GCATO75600 419 aa10.42□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 SOAT2O75908 522 aa10.42□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 FGF18O76093 207 aa10.42□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 LRIG2O94898 1065 aa10.42□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 VNN2O95498 520 aa10.42□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 MYZAPP0CAP1 466 aa10.42□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 SRGAP2BP0DMP2 458 aa10.42□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 RBL1P28749 1068 aa10.42□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP10.42□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 EPHB3P54753 998 aa10.42□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 GDF10P55107 478 aa10.42□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 GBE1Q04446 702 aa10.42□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 EFEMP1Q12805 493 aa10.42□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP10.42□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 TMEM240Q5SV17 173 aa10.42□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 DENND2CQ68D51 928 aa10.42□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa10.42□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP10.42□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 LRRC31Q6UY01 552 aa10.42□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa10.42□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 RELL1Q8IUW5 271 aa10.42□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP10.42□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa10.42□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 GLIS1Q8NBF1 620 aa10.42□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 CCNYQ8ND76 341 aa10.42□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 RTP4Q96DX8 246 aa10.42□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP10.42□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 ZIM3Q96PE6 472 aa10.42□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP10.42□□□□□ -0.744e-8■■■■■ 42.2
RABGGTB-201ENST00000319942 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP10.42□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 CCDC77Q9BR77 488 aa10.42□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 HTATIP2Q9BUP3 242 aa10.42□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP10.42□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 ADAM7Q9H2U9 754 aa10.42□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 CRISPLD1Q9H336 500 aa10.42□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 SEMA4AQ9H3S1 761 aa10.42□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 C10orf88Q9H8K7 445 aa10.42□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa10.42□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa10.42□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 MARCH2Q9P0N8 246 aa10.42□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 NUDT5Q9UKK9 219 aa10.42□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 HTTP42858 3142 aa10.41□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 CENPFP49454 3210 aa10.41□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 FAM72CH0Y354 149 aa10.41□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 AGPSO00116 658 aa10.41□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 DCLK1O15075 740 aa10.41□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 TP73O15350 636 aa10.41□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP10.41□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa10.41□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 OAS2P29728 719 aaKnown RBP10.41□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 ARL4CP56559 192 aa10.41□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 BASP1P80723 227 aaKnown RBP10.41□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 COG7P83436 770 aa10.41□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 CBX1P83916 185 aa10.41□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 PLD1Q13393 1074 aa10.41□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC29A2Q14542 456 aa10.41□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP10.41□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 CEP85LQ5SZL2 805 aa10.41□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 FAM72AQ5TYM5 149 aa10.41□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 RASIP1Q5U651 963 aa10.41□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 FAM72DQ6L9T8 149 aa10.41□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP10.41□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 FOXR1Q6PIV2 292 aa10.41□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa10.41□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 CENPUQ71F23 418 aa10.41□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 PRUNE1Q86TP1 453 aa10.41□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 ITIH5Q86UX2 942 aa10.41□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 FAM72BQ86X60 149 aa10.41□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 LRRC49Q8IUZ0 686 aa10.41□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 TCEAL8Q8IYN2 117 aa10.41□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 PDIK1LQ8N165 341 aa10.41□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 HTR3CQ8WXA8 447 aa10.41□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 HERVK_113Q902F9 699 aa10.41□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP10.41□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC39A13Q96H72 371 aa10.41□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 BTN2A3PQ96KV6 586 aa10.41□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP10.41□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 NACA2Q9H009 215 aa10.41□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 KLC2Q9H0B6 622 aa10.41□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 RXFP1Q9HBX9 757 aa10.41□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 ETNK2Q9NVF9 386 aa10.41□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP10.41□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 OSER1Q9NX31 292 aa10.41□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP10.41□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 RWDD3Q9Y3V2 267 aa10.41□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa10.4□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC12A8A0AV02 714 aa10.4□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 CHADO15335 359 aa10.4□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP10.4□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 MSI1O43347 362 aaKnown RBP10.4□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 TLR5O60602 858 aa10.4□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 SEC24AO95486 1093 aa10.4□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 CXCL14O95715 111 aa10.4□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 TTC4O95801 387 aa10.4□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 SYF2O95926 243 aaKnown RBP10.4□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 NUDT17P0C025 328 aa10.4□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 CTSAP10619 480 aa10.4□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP10.4□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 ATF6P18850 670 aa10.4□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.5 ms