RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318988.10

CTDNEP1-201, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-201ENST00000318988 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP28.2■■■□□ 2.1
CTDNEP1-201ENST00000318988 MMGT1Q8N4V1 131 aa28.2■■■□□ 2.1
CTDNEP1-201ENST00000318988 BPIFB1Q8TDL5 484 aa28.2■■■□□ 2.1
CTDNEP1-201ENST00000318988 DDI1Q8WTU0 396 aa28.2■■■□□ 2.1
CTDNEP1-201ENST00000318988 MYEOVQ96EZ4 313 aa28.2■■■□□ 2.1
CTDNEP1-201ENST00000318988 CCDC114Q96M63 670 aa28.2■■■□□ 2.1
CTDNEP1-201ENST00000318988 DNPEPQ9ULA0 475 aa28.2■■■□□ 2.1
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF148Q9UQR1 794 aa28.2■■■□□ 2.1
CTDNEP1-201ENST00000318988 A0A1B0GVM2 712 aa28.19■■■□□ 2.1
CTDNEP1-201ENST00000318988 TCAF2A6NFQ2 919 aa28.19■■■□□ 2.1
CTDNEP1-201ENST00000318988 EFCAB8A8MWE9 144 aa28.19■■■□□ 2.1
CTDNEP1-201ENST00000318988 NCAM2O15394 837 aa28.19■■■□□ 2.1
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CTDNEP1-201ENST00000318988 MX2P20592 715 aa28.19■■■□□ 2.1
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR1E1P30953 314 aa28.19■■■□□ 2.1
CTDNEP1-201ENST00000318988 MAPKAPK2P49137 400 aa28.19■■■□□ 2.1
CTDNEP1-201ENST00000318988 IRAK1P51617 712 aa28.19■■■□□ 2.1
CTDNEP1-201ENST00000318988 LMNB2Q03252 620 aa28.19■■■□□ 2.1
CTDNEP1-201ENST00000318988 PDK1Q15118 436 aa28.19■■■□□ 2.1
CTDNEP1-201ENST00000318988 TEX35Q5T0J7 233 aa28.19■■■□□ 2.1
CTDNEP1-201ENST00000318988 ARTNQ5T4W7 220 aa28.19■■■□□ 2.1
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CTDNEP1-201ENST00000318988 CHST9Q7L1S5 443 aa28.19■■■□□ 2.1
CTDNEP1-201ENST00000318988 OTOP3Q7RTS5 596 aa28.19■■■□□ 2.1
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CTDNEP1-201ENST00000318988 LRRN4CLQ8ND94 238 aa28.19■■■□□ 2.1
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CTDNEP1-201ENST00000318988 GRK7Q8WTQ7 553 aa28.19■■■□□ 2.1
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CTDNEP1-201ENST00000318988 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP28.18■■■□□ 2.1
CTDNEP1-201ENST00000318988 MAP3K6O95382 1288 aa28.18■■■□□ 2.1
CTDNEP1-201ENST00000318988 RBP3P10745 1247 aa28.18■■■□□ 2.1
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP28.18■■■□□ 2.1
CTDNEP1-201ENST00000318988 XRCC4Q13426 336 aa28.18■■■□□ 2.1
CTDNEP1-201ENST00000318988 C8orf74Q6P047 294 aa28.18■■■□□ 2.1
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CTDNEP1-201ENST00000318988 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP28.18■■■□□ 2.1
CTDNEP1-201ENST00000318988 ATL2Q8NHH9 583 aa28.18■■■□□ 2.1
CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC35B2Q8TB61 432 aa28.18■■■□□ 2.1
CTDNEP1-201ENST00000318988 SUSD6Q92537 303 aa28.18■■■□□ 2.1
CTDNEP1-201ENST00000318988 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP28.18■■■□□ 2.1
CTDNEP1-201ENST00000318988 LAMP2P13473 410 aa28.18■■■□□ 2.1
CTDNEP1-201ENST00000318988 IFNAR2P48551 515 aa28.18■■■□□ 2.1
CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP28.18■■■□□ 2.1
CTDNEP1-201ENST00000318988 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP28.18■■■□□ 2.1
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CTDNEP1-201ENST00000318988 GSTA5Q7RTV2 222 aa28.18■■■□□ 2.1
CTDNEP1-201ENST00000318988 MAATS1Q7Z4T9 603 aa28.18■■■□□ 2.1
CTDNEP1-201ENST00000318988 NPWQ8N729 165 aa28.18■■■□□ 2.1
CTDNEP1-201ENST00000318988 HLA-CQ95604 372 aa28.18■■■□□ 2.1
CTDNEP1-201ENST00000318988 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP28.18■■■□□ 2.1
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CTDNEP1-201ENST00000318988 NDST2P52849 883 aa28.17■■■□□ 2.1
CTDNEP1-201ENST00000318988 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP28.17■■■□□ 2.1
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CTDNEP1-201ENST00000318988 AMACRQ9UHK6 382 aa28.17■■■□□ 2.1
CTDNEP1-201ENST00000318988 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP28.17■■■□□ 2.1
CTDNEP1-201ENST00000318988 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP28.16■■■□□ 2.1
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CTDNEP1-201ENST00000318988 DR1Q01658 176 aa28.16■■■□□ 2.1
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CTDNEP1-201ENST00000318988 C6orf118Q5T5N4 469 aa28.16■■■□□ 2.1
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CTDNEP1-201ENST00000318988 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP28.16■■■□□ 2.1
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CTDNEP1-201ENST00000318988 H0Y626 953 aa28.15■■■□□ 2.1
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CTDNEP1-201ENST00000318988 NETO2Q8NC67 525 aa28.15■■■□□ 2.1
CTDNEP1-201ENST00000318988 RSAD2Q8WXG1 361 aa28.15■■■□□ 2.1
CTDNEP1-201ENST00000318988 OLFM3Q96PB7 478 aa28.15■■■□□ 2.1
CTDNEP1-201ENST00000318988 LINC00597Q9H2U6 94 aa28.15■■■□□ 2.1
CTDNEP1-201ENST00000318988 NDFIP2Q9NV92 336 aa28.15■■■□□ 2.1
CTDNEP1-201ENST00000318988 GRXCR2A6NFK2 248 aa28.14■■■□□ 2.1
CTDNEP1-201ENST00000318988 ARHGAP42A6NI28 874 aa28.14■■■□□ 2.1
CTDNEP1-201ENST00000318988 SGK1O00141 431 aa28.14■■■□□ 2.1
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP28.14■■■□□ 2.1
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