RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000281171.8

PTPRO-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type O, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRO, Length 5,301 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRO-201ENST00000281171 PYDC2Q56P42 97 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 UXS1Q8NBZ7 420 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 RNF149Q8NC42 400 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 ERLEC1Q96DZ1 483 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 TAS2R1Q9NYW7 299 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 ITSN1Q15811 1721 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 ARHGEF33A8MVX0 844 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 TRIM38O00635 465 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 ZNF197O14709 1029 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 UGT1A9O60656 530 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 CYBBP04839 570 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 UGT1A6P19224 532 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 UGT1A1P22309 533 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 UGT1A4P22310 534 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 UGT1A3P35503 534 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 UGT1A5P35504 534 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 KRT33BQ14525 404 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 CCNG2Q16589 344 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 CENPSQ8N2Z9 138 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 THAP2Q9H0W7 228 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 UGT1A7Q9HAW7 530 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 UGT1A10Q9HAW8 530 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 UGT1A8Q9HAW9 530 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 NR5A2O00482 541 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 ATP9BO43861 1147 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 PRKAA1Q13131 559 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 MTMR2Q13614 643 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 PLEKHO2Q8TD55 490 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 TBC1D14Q9P2M4 693 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 NUP50Q9UKX7 468 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 CSPG5O95196 566 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 DHFRP00374 187 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 COX4I1P13073 169 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 IFI30P13284 250 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 EMC2Q15006 297 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 USP49Q70CQ1 688 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 RNF145Q96MT1 663 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 ERAP1Q9NZ08 941 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 SHOC2Q9UQ13 582 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 USP20Q9Y2K6 914 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 STIP1P31948 543 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 SLC26A2P50443 739 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 CDC16Q13042 620 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 NADK2Q4G0N4 442 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 LDLRAP1Q5SW96 308 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 CAMKK1Q8N5S9 505 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 TBC1D19Q8N5T2 526 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 ACMSDQ8TDX5 336 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 ATG4AQ8WYN0 398 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 ELMO2Q96JJ3 720 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 ANAPC2Q9UJX6 822 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 STON1Q9Y6Q2 735 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 OXCT1P55809 520 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 RAB2BQ8WUD1 216 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 PDGFRBP09619 1106 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 CYP2C9P11712 490 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 GARTP22102 1010 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 NME5P56597 212 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 SNX7Q9UNH6 387 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 SALL1Q9NSC2 1324 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 IQGAP1P46940 1657 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 ISPDA4D126 451 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 F5H423 210 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 PRKAA2P54646 552 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 DRG2P55039 364 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 SREBF2Q12772 1141 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 ZNF235Q14590 738 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 BHLHB9Q6PI77 547 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 FBXL16Q8N461 479 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 LINC00116Q8NCU8 138 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 DMRTB1Q96MA1 342 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 SLC25A23Q9BV35 468 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 E2F8A0AVK6 867 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 OR2B6P58173 313 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 GLRA4Q5JXX5 417 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 SULT1C3Q6IMI6 304 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 PID1Q7Z2X4 250 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.2 ms