RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000268049.11

USP3-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene USP3, Length 5,311 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-201ENST00000268049 SLC36A4Q6YBV0 504 aa7.99□□□□□ -1.13
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USP3-201ENST00000268049 GALNT4Q8N4A0 578 aa7.99□□□□□ -1.13
USP3-201ENST00000268049 FOXJ1Q92949 421 aa7.99□□□□□ -1.13
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USP3-201ENST00000268049 GORASP1Q9BQQ3 440 aa7.99□□□□□ -1.13
USP3-201ENST00000268049 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
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USP3-201ENST00000268049 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa7.99□□□□□ -1.13
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USP3-201ENST00000268049 FAM117AQ9C073 453 aa7.99□□□□□ -1.13
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USP3-201ENST00000268049 ANAPC7Q9UJX3 599 aa7.99□□□□□ -1.13
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USP3-201ENST00000268049 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
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USP3-201ENST00000268049 A0A1W2PQY0 241 aa7.99□□□□□ -1.13
USP3-201ENST00000268049 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
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USP3-201ENST00000268049 TRIM49CP0CI26 452 aa7.99□□□□□ -1.13
USP3-201ENST00000268049 COX7A2P14406 83 aa7.99□□□□□ -1.13
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USP3-201ENST00000268049 KDM7AQ6ZMT4 941 aa7.99□□□□□ -1.13
USP3-201ENST00000268049 LGI2Q8N0V4 545 aa7.99□□□□□ -1.13
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USP3-201ENST00000268049 ZNF555Q8NEP9 628 aa7.99□□□□□ -1.13
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USP3-201ENST00000268049 INPPL1O15357 1258 aa7.98□□□□□ -1.13
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USP3-201ENST00000268049 HTRA3P83110 453 aa7.98□□□□□ -1.13
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