RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262605.8

TTPAL-201, Transcript of alpha tocopherol transfer protein like, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTPAL, Length 6,212 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAL-201ENST00000262605 CYTH4Q9UIA0 394 aa10.57□□□□□ -0.72
TTPAL-201ENST00000262605 STK25O00506 426 aa10.57□□□□□ -0.72
TTPAL-201ENST00000262605 VAPBO95292 243 aa10.57□□□□□ -0.72
TTPAL-201ENST00000262605 MMP13P45452 471 aa10.57□□□□□ -0.72
TTPAL-201ENST00000262605 VEGFBP49765 207 aa10.57□□□□□ -0.72
TTPAL-201ENST00000262605 CDH17Q12864 832 aa10.57□□□□□ -0.72
TTPAL-201ENST00000262605 PARP6Q2NL67 630 aa10.57□□□□□ -0.72
TTPAL-201ENST00000262605 ZNF697Q5TEC3 545 aa10.57□□□□□ -0.72
TTPAL-201ENST00000262605 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa10.57□□□□□ -0.72
TTPAL-201ENST00000262605 KIF2BQ8N4N8 673 aa10.57□□□□□ -0.72
TTPAL-201ENST00000262605 FIBCD1Q8N539 461 aa10.57□□□□□ -0.72
TTPAL-201ENST00000262605 ERP27Q96DN0 273 aa10.57□□□□□ -0.72
TTPAL-201ENST00000262605 MCRS1Q96EZ8 462 aa10.57□□□□□ -0.72
TTPAL-201ENST00000262605 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP10.57□□□□□ -0.72
TTPAL-201ENST00000262605 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP10.57□□□□□ -0.72
TTPAL-201ENST00000262605 MIOSQ9NXC5 875 aa10.57□□□□□ -0.72
TTPAL-201ENST00000262605 PSD3Q9NYI0 1048 aa10.57□□□□□ -0.72
TTPAL-201ENST00000262605 PCDHB8Q9UN66 801 aa10.57□□□□□ -0.72
TTPAL-201ENST00000262605 NRP1O14786 923 aa10.57□□□□□ -0.72
TTPAL-201ENST00000262605 STX7O15400 261 aaKnown RBP10.57□□□□□ -0.72
TTPAL-201ENST00000262605 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP10.57□□□□□ -0.72
TTPAL-201ENST00000262605 HADHAP40939 763 aa10.57□□□□□ -0.72
TTPAL-201ENST00000262605 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP10.57□□□□□ -0.72
TTPAL-201ENST00000262605 AUHQ13825 339 aaKnown RBP10.57□□□□□ -0.72
TTPAL-201ENST00000262605 STRADAQ7RTN6 431 aa10.57□□□□□ -0.72
TTPAL-201ENST00000262605 TCP10LQ8TDR4 215 aa10.57□□□□□ -0.72
TTPAL-201ENST00000262605 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa10.57□□□□□ -0.72
TTPAL-201ENST00000262605 TMEM209Q96SK2 561 aa10.57□□□□□ -0.72
TTPAL-201ENST00000262605 CYP4F12Q9HCS2 524 aa10.57□□□□□ -0.72
TTPAL-201ENST00000262605 SYBUQ9NX95 663 aa10.57□□□□□ -0.72
TTPAL-201ENST00000262605 ADRA1BP35368 520 aa10.57□□□□□ -0.72
TTPAL-201ENST00000262605 TLE2Q04725 743 aa10.57□□□□□ -0.72
TTPAL-201ENST00000262605 ARHGEF7Q14155 803 aa10.57□□□□□ -0.72
TTPAL-201ENST00000262605 SH2D4BQ5SQS7 431 aa10.57□□□□□ -0.72
TTPAL-201ENST00000262605 RFWD3Q6PCD5 774 aa10.57□□□□□ -0.72
TTPAL-201ENST00000262605 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP10.57□□□□□ -0.72
TTPAL-201ENST00000262605 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP10.57□□□□□ -0.72
TTPAL-201ENST00000262605 CIPCQ9C0C6 399 aa10.57□□□□□ -0.72
TTPAL-201ENST00000262605 SLC24A2Q9UI40 661 aa10.57□□□□□ -0.72
TTPAL-201ENST00000262605 A0A0U1RQF3 1178 aa10.56□□□□□ -0.72
TTPAL-201ENST00000262605 C9IYK1 514 aa10.56□□□□□ -0.72
TTPAL-201ENST00000262605 CHEK2O96017 543 aa10.56□□□□□ -0.72
TTPAL-201ENST00000262605 OTOP3Q7RTS5 596 aa10.56□□□□□ -0.72
TTPAL-201ENST00000262605 CALML6Q8TD86 181 aa10.56□□□□□ -0.72
TTPAL-201ENST00000262605 MAGEB18Q96M61 343 aa10.56□□□□□ -0.72
TTPAL-201ENST00000262605 CERS4Q9HA82 394 aa10.56□□□□□ -0.72
TTPAL-201ENST00000262605 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa10.56□□□□□ -0.72
TTPAL-201ENST00000262605 C2orf81A6NN90 581 aa10.56□□□□□ -0.72
TTPAL-201ENST00000262605 TLL1O43897 1013 aa10.56□□□□□ -0.72
TTPAL-201ENST00000262605 DAOAP59103 153 aa10.56□□□□□ -0.72
TTPAL-201ENST00000262605 MPP3Q13368 585 aa10.56□□□□□ -0.72
TTPAL-201ENST00000262605 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP10.56□□□□□ -0.72
TTPAL-201ENST00000262605 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP10.56□□□□□ -0.72
TTPAL-201ENST00000262605 FGD4Q96M96 766 aa10.56□□□□□ -0.72
TTPAL-201ENST00000262605 ZYG11BQ9C0D3 744 aa10.56□□□□□ -0.72
TTPAL-201ENST00000262605 TBL1XO60907 577 aa10.56□□□□□ -0.72
TTPAL-201ENST00000262605 SRP72O76094 671 aaKnown RBP10.56□□□□□ -0.72
TTPAL-201ENST00000262605 EOMESO95936 686 aa10.56□□□□□ -0.72
TTPAL-201ENST00000262605 PIRTP0C851 137 aa10.56□□□□□ -0.72
TTPAL-201ENST00000262605 PROZP22891 400 aa10.56□□□□□ -0.72
TTPAL-201ENST00000262605 SERPINB8P50452 374 aa10.56□□□□□ -0.72
TTPAL-201ENST00000262605 RENBPP51606 427 aa10.56□□□□□ -0.72
TTPAL-201ENST00000262605 KRT33BQ14525 404 aa10.56□□□□□ -0.72
TTPAL-201ENST00000262605 WDTC1Q8N5D0 677 aa10.56□□□□□ -0.72
TTPAL-201ENST00000262605 MAB21L3Q8N8X9 362 aa10.56□□□□□ -0.72
TTPAL-201ENST00000262605 FNIP1Q8TF40 1166 aa10.56□□□□□ -0.72
TTPAL-201ENST00000262605 TEKT4Q8WW24 435 aa10.56□□□□□ -0.72
TTPAL-201ENST00000262605 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP10.56□□□□□ -0.72
TTPAL-201ENST00000262605 TRHDEQ9UKU6 1024 aa10.56□□□□□ -0.72
TTPAL-201ENST00000262605 FZD10Q9ULW2 581 aa10.56□□□□□ -0.72
TTPAL-201ENST00000262605 PRR23AA6NEV1 266 aa10.56□□□□□ -0.72
TTPAL-201ENST00000262605 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP10.56□□□□□ -0.72
TTPAL-201ENST00000262605 ASMTLO95671 621 aa10.56□□□□□ -0.72
TTPAL-201ENST00000262605 CXCL14O95715 111 aa10.56□□□□□ -0.72
TTPAL-201ENST00000262605 HDCP19113 662 aa10.56□□□□□ -0.72
TTPAL-201ENST00000262605 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP10.56□□□□□ -0.72
TTPAL-201ENST00000262605 MGAT5Q09328 741 aa10.56□□□□□ -0.72
TTPAL-201ENST00000262605 ARHGAP17Q68EM7 881 aa10.56□□□□□ -0.72
TTPAL-201ENST00000262605 ZNF280BQ86YH2 543 aa10.56□□□□□ -0.72
TTPAL-201ENST00000262605 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP10.56□□□□□ -0.72
TTPAL-201ENST00000262605 APBB2Q92870 758 aa10.56□□□□□ -0.72
TTPAL-201ENST00000262605 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP10.56□□□□□ -0.72
TTPAL-201ENST00000262605 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa10.56□□□□□ -0.72
TTPAL-201ENST00000262605 DNAJB4Q9UDY4 337 aa10.56□□□□□ -0.72
TTPAL-201ENST00000262605 SLC25A13Q9UJS0 675 aa10.56□□□□□ -0.72
TTPAL-201ENST00000262605 OR6C75A6NL08 312 aa10.56□□□□□ -0.72
TTPAL-201ENST00000262605 TBX18O95935 607 aa10.56□□□□□ -0.72
TTPAL-201ENST00000262605 KCNE1P15382 129 aa10.56□□□□□ -0.72
TTPAL-201ENST00000262605 CPA2P48052 419 aa10.56□□□□□ -0.72
TTPAL-201ENST00000262605 NECAB2Q7Z6G3 386 aa10.56□□□□□ -0.72
TTPAL-201ENST00000262605 MFN1Q8IWA4 741 aa10.56□□□□□ -0.72
TTPAL-201ENST00000262605 FUKQ8N0W3 1084 aa10.56□□□□□ -0.72
TTPAL-201ENST00000262605 GRAMD1AQ96CP6 724 aa10.56□□□□□ -0.72
TTPAL-201ENST00000262605 TSPAN17Q96FV3 270 aa10.56□□□□□ -0.72
TTPAL-201ENST00000262605 DCUN1D1Q96GG9 259 aa10.56□□□□□ -0.72
TTPAL-201ENST00000262605 CCDC160A6NGH7 325 aa10.55□□□□□ -0.72
TTPAL-201ENST00000262605 CCL16O15467 120 aa10.55□□□□□ -0.72
TTPAL-201ENST00000262605 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP10.55□□□□□ -0.72
TTPAL-201ENST00000262605 FAM155BO75949 473 aa10.55□□□□□ -0.72
TTPAL-201ENST00000262605 ITGB6P18564 788 aa10.55□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.9 ms