RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236192.11

VAMP4-201, Transcript of vesicle associated membrane protein 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene VAMP4, Length 5,159 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP4-201ENST00000236192 LEMD2Q8NC56 503 aa13.13□□□□□ -0.31
VAMP4-201ENST00000236192 OTULINQ96BN8 352 aa13.13□□□□□ -0.31
VAMP4-201ENST00000236192 C19orf60Q96EN9 201 aa13.13□□□□□ -0.31
VAMP4-201ENST00000236192 CD320Q9NPF0 282 aa13.13□□□□□ -0.31
VAMP4-201ENST00000236192 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
VAMP4-201ENST00000236192 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
VAMP4-201ENST00000236192 DHRS12A0PJE2 317 aa13.13□□□□□ -0.31
VAMP4-201ENST00000236192 TBX1O43435 398 aa13.13□□□□□ -0.31
VAMP4-201ENST00000236192 NUAK1O60285 661 aa13.13□□□□□ -0.31
VAMP4-201ENST00000236192 DNAJA2O60884 412 aa13.13□□□□□ -0.31
VAMP4-201ENST00000236192 MYCP01106 439 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
VAMP4-201ENST00000236192 NTRK1P04629 796 aa13.13□□□□□ -0.31
VAMP4-201ENST00000236192 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
VAMP4-201ENST00000236192 GABRB2P47870 512 aa13.13□□□□□ -0.31
VAMP4-201ENST00000236192 TROAPQ12815 778 aa13.13□□□□□ -0.31
VAMP4-201ENST00000236192 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
VAMP4-201ENST00000236192 C14orf80Q86SX3 495 aa13.13□□□□□ -0.31
VAMP4-201ENST00000236192 GPR180Q86V85 440 aa13.13□□□□□ -0.31
VAMP4-201ENST00000236192 VMP1Q96GC9 406 aa13.13□□□□□ -0.31
VAMP4-201ENST00000236192 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
VAMP4-201ENST00000236192 TAS2R14Q9NYV8 317 aa13.13□□□□□ -0.31
VAMP4-201ENST00000236192 MYO3AQ8NEV4 1616 aa13.13□□□□□ -0.31
VAMP4-201ENST00000236192 E5RI56 91 aa13.13□□□□□ -0.31
VAMP4-201ENST00000236192 ZW10O43264 779 aa13.13□□□□□ -0.31
VAMP4-201ENST00000236192 AQP9O43315 295 aa13.13□□□□□ -0.31
VAMP4-201ENST00000236192 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
VAMP4-201ENST00000236192 NOL4O94818 638 aa13.13□□□□□ -0.31
VAMP4-201ENST00000236192 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
VAMP4-201ENST00000236192 T-ENOLP0DO92 83 aa13.13□□□□□ -0.31
VAMP4-201ENST00000236192 PURAQ00577 322 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
VAMP4-201ENST00000236192 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
VAMP4-201ENST00000236192 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa13.13□□□□□ -0.31
VAMP4-201ENST00000236192 FKBP9P1Q75LS8 142 aa13.13□□□□□ -0.31
VAMP4-201ENST00000236192 HAUS6Q7Z4H7 955 aa13.13□□□□□ -0.31
VAMP4-201ENST00000236192 POLNQ7Z5Q5 900 aa13.13□□□□□ -0.31
VAMP4-201ENST00000236192 PHC2Q8IXK0 858 aa13.13□□□□□ -0.31
VAMP4-201ENST00000236192 RNF34Q969K3 372 aa13.13□□□□□ -0.31
VAMP4-201ENST00000236192 RNF145Q96MT1 663 aa13.13□□□□□ -0.31
VAMP4-201ENST00000236192 PRDM11Q9NQV5 511 aa13.13□□□□□ -0.31
VAMP4-201ENST00000236192 NR5A2O00482 541 aa13.12□□□□□ -0.31
VAMP4-201ENST00000236192 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
VAMP4-201ENST00000236192 VARSP26640 1264 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
VAMP4-201ENST00000236192 NAB1Q13506 487 aa13.12□□□□□ -0.31
VAMP4-201ENST00000236192 NFYCQ13952 458 aa13.12□□□□□ -0.31
VAMP4-201ENST00000236192 PLCL1Q15111 1095 aa13.12□□□□□ -0.31
VAMP4-201ENST00000236192 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa13.12□□□□□ -0.31
VAMP4-201ENST00000236192 PM20D2Q8IYS1 436 aa13.12□□□□□ -0.31
VAMP4-201ENST00000236192 OR8H3Q8N146 312 aa13.12□□□□□ -0.31
VAMP4-201ENST00000236192 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
VAMP4-201ENST00000236192 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa13.12□□□□□ -0.31
VAMP4-201ENST00000236192 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP13.12□□□□□ -0.31
VAMP4-201ENST00000236192 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
VAMP4-201ENST00000236192 TMCO6Q96DC7 493 aa13.12□□□□□ -0.31
VAMP4-201ENST00000236192 ZNF577Q9BSK1 485 aa13.12□□□□□ -0.31
VAMP4-201ENST00000236192 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
VAMP4-201ENST00000236192 COMMD8Q9NX08 183 aa13.12□□□□□ -0.31
VAMP4-201ENST00000236192 ANKMY1Q9P2S6 941 aa13.12□□□□□ -0.31
VAMP4-201ENST00000236192 NUDT5Q9UKK9 219 aa13.12□□□□□ -0.31
VAMP4-201ENST00000236192 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
VAMP4-201ENST00000236192 GTF2H1P32780 548 aa13.12□□□□□ -0.31
VAMP4-201ENST00000236192 BNIP2Q12982 314 aa13.12□□□□□ -0.31
VAMP4-201ENST00000236192 CYP1B1Q16678 543 aa13.12□□□□□ -0.31
VAMP4-201ENST00000236192 HMBOX1Q6NT76 420 aa13.12□□□□□ -0.31
VAMP4-201ENST00000236192 FAM122CQ6P4D5 195 aa13.12□□□□□ -0.31
VAMP4-201ENST00000236192 ITIH5Q86UX2 942 aa13.12□□□□□ -0.31
VAMP4-201ENST00000236192 KATNAL2Q8IYT4 538 aa13.12□□□□□ -0.31
VAMP4-201ENST00000236192 SLC15A4Q8N697 577 aa13.12□□□□□ -0.31
VAMP4-201ENST00000236192 CHPT1Q8WUD6 406 aa13.12□□□□□ -0.31
VAMP4-201ENST00000236192 AMNQ9BXJ7 453 aa13.12□□□□□ -0.31
VAMP4-201ENST00000236192 KLHL31Q9H511 634 aa13.12□□□□□ -0.31
VAMP4-201ENST00000236192 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
VAMP4-201ENST00000236192 H3BNH8 94 aa13.12□□□□□ -0.31
VAMP4-201ENST00000236192 SPATA31D3P0C874 917 aa13.12□□□□□ -0.31
VAMP4-201ENST00000236192 RRM2P31350 389 aa13.12□□□□□ -0.31
VAMP4-201ENST00000236192 FAM45BPQ6NSW5 357 aa13.12□□□□□ -0.31
VAMP4-201ENST00000236192 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa13.12□□□□□ -0.31
VAMP4-201ENST00000236192 THAP5Q7Z6K1 395 aa13.12□□□□□ -0.31
VAMP4-201ENST00000236192 EID3Q8N140 333 aa13.12□□□□□ -0.31
VAMP4-201ENST00000236192 CBR4Q8N4T8 237 aa13.12□□□□□ -0.31
VAMP4-201ENST00000236192 LRRC17Q8N6Y2 441 aa13.12□□□□□ -0.31
VAMP4-201ENST00000236192 NSMCE2Q96MF7 247 aa13.12□□□□□ -0.31
VAMP4-201ENST00000236192 TOR3AQ9H497 397 aa13.12□□□□□ -0.31
VAMP4-201ENST00000236192 SLA2Q9H6Q3 261 aa13.12□□□□□ -0.31
VAMP4-201ENST00000236192 KCNMB3Q9NPA1 279 aa13.12□□□□□ -0.31
VAMP4-201ENST00000236192 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
VAMP4-201ENST00000236192 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
VAMP4-201ENST00000236192 MPOP05164 745 aa13.12□□□□□ -0.31
VAMP4-201ENST00000236192 CYP1A2P05177 515 aa13.12□□□□□ -0.31
VAMP4-201ENST00000236192 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa13.12□□□□□ -0.31
VAMP4-201ENST00000236192 SLC5A2P31639 672 aa13.12□□□□□ -0.31
VAMP4-201ENST00000236192 CAPGP40121 348 aa13.12□□□□□ -0.31
VAMP4-201ENST00000236192 CDK18Q07002 472 aa13.12□□□□□ -0.31
VAMP4-201ENST00000236192 UGP2Q16851 508 aa13.12□□□□□ -0.31
VAMP4-201ENST00000236192 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa13.12□□□□□ -0.31
VAMP4-201ENST00000236192 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
VAMP4-201ENST00000236192 XKRXQ6PP77 449 aa13.12□□□□□ -0.31
VAMP4-201ENST00000236192 GALNT7Q86SF2 657 aa13.12□□□□□ -0.31
VAMP4-201ENST00000236192 EMC1Q8N766 993 aa13.12□□□□□ -0.31
VAMP4-201ENST00000236192 TUBA1CQ9BQE3 449 aa13.12□□□□□ -0.31
VAMP4-201ENST00000236192 ZNF304Q9HCX3 659 aa13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.1 ms