RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000618610.1

PTPRT-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 3,230 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-211ENST00000618610 FEM1CQ96JP0 617 aa8.41□□□□□ -1.06
PTPRT-211ENST00000618610 C7orf26Q96N11 449 aa8.41□□□□□ -1.06
PTPRT-211ENST00000618610 RNF38Q9H0F5 515 aa8.41□□□□□ -1.06
PTPRT-211ENST00000618610 RNPEPQ9H4A4 650 aa8.41□□□□□ -1.06
PTPRT-211ENST00000618610 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
PTPRT-211ENST00000618610 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
PTPRT-211ENST00000618610 H3BNH8 94 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPRT-211ENST00000618610 SULT1C4O75897 302 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPRT-211ENST00000618610 MCF2P10911 925 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPRT-211ENST00000618610 HMGCS2P54868 508 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPRT-211ENST00000618610 UGCGQ16739 394 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPRT-211ENST00000618610 SMTNL2Q2TAL5 461 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPRT-211ENST00000618610 MGAT5BQ3V5L5 792 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPRT-211ENST00000618610 ACAD10Q6JQN1 1059 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPRT-211ENST00000618610 LDHDQ86WU2 507 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPRT-211ENST00000618610 KIAA2013Q8IYS2 634 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPRT-211ENST00000618610 CHURC1Q8WUH1 139 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPRT-211ENST00000618610 FAR2Q96K12 515 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPRT-211ENST00000618610 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
PTPRT-211ENST00000618610 SLC2A11Q9BYW1 496 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPRT-211ENST00000618610 BCAP29Q9UHQ4 241 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPRT-211ENST00000618610 PLLPQ9Y342 182 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPRT-211ENST00000618610 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
PTPRT-211ENST00000618610 SNX13Q9Y5W8 968 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPRT-211ENST00000618610 KRT75O95678 551 aa8.4□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 GZMAP12544 262 aa8.4□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 CPA3P15088 417 aa8.4□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 IDH3AP50213 366 aa8.4□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 SLC15A2Q16348 729 aa8.4□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 ZNF618Q5T7W0 954 aa8.4□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa8.4□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 CYP2R1Q6VVX0 501 aa8.4□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa8.4□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 SNX32Q86XE0 403 aa8.4□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 MCF2L2Q86YR7 1114 aa8.4□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 CXorf38Q8TB03 319 aa8.4□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa8.4□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 KCNH7Q9NS40 1196 aa8.4□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 KLQ9UEF7 1012 aa8.4□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa8.4□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 POLIQ9UNA4 740 aa8.4□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 CARD8Q9Y2G2 431 aa8.4□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 ZHX2Q9Y6X8 837 aa8.4□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 SAC3D1A6NKF1 404 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 SOBPA7XYQ1 873 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 DDHD2O94830 711 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 MAP3K6O95382 1288 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 MAGP20916 626 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 PRDX6P30041 224 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 CLK3P49761 638 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 PSMC5P62195 406 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 SLC18A2Q05940 514 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP8.39□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 CEACAM7Q14002 265 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 E2F2Q14209 437 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 CIAPIN1Q6FI81 312 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 SH2D5Q6ZV89 423 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 PIWIL3Q7Z3Z3 882 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 HEATR4Q86WZ0 1026 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 RHOT1Q8IXI2 618 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 PEX5LQ8IYB4 626 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 FAM71AQ8IYT1 594 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 OFCC1Q8IZS5 231 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 SLC4A11Q8NBS3 891 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 TAS1R2Q8TE23 839 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 TAAR1Q96RJ0 339 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 KCNK16Q96T55 309 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 PCDHAC1Q9H158 963 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 F5H423 210 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 BAIAP3O94812 1187 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 P4HBP07237 508 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 ADRB2P07550 413 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 ITGB5P18084 799 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 RFX1P22670 979 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 ARRB2P32121 409 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 RPL22P35268 128 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 QARSP47897 775 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 ZNF394Q53GI3 561 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 KCNT1Q5JUK3 1230 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 TICAM1Q8IUC6 712 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 MCOLN2Q8IZK6 566 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 FAM71DQ8N9W8 422 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 CGREF1Q99674 301 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 DHRS4Q9BTZ2 278 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 SLC4A5Q9BY07 1137 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 HIPK3Q9H422 1215 aa8.39□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.1 ms