RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578348.5

GGA3-205, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, human

TSL 2 BASIC

Gene GGA3, Length 2,251 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GGA3-205	ENST00000578348	OSTM1	Q86WC4	334 aa		11.75	□□□□□ -0.53
GGA3-205	ENST00000578348	KBTBD2	Q8IY47	623 aa		11.75	□□□□□ -0.53
GGA3-205	ENST00000578348	ULK2	Q8IYT8	1036 aa		11.75	□□□□□ -0.53
GGA3-205	ENST00000578348	B3GALNT2	Q8NCR0	500 aa		11.75	□□□□□ -0.53
GGA3-205	ENST00000578348	STKLD1	Q8NE28	680 aa		11.75	□□□□□ -0.53
GGA3-205	ENST00000578348	SPDYE1	Q8NFV5	336 aa	Predicted RBP	11.75	□□□□□ -0.53
GGA3-205	ENST00000578348	PPP1R14C	Q8TAE6	165 aa		11.75	□□□□□ -0.53
GGA3-205	ENST00000578348	SLC2A14	Q8TDB8	520 aa		11.75	□□□□□ -0.53
GGA3-205	ENST00000578348	MTBP	Q96DY7	904 aa		11.75	□□□□□ -0.53
GGA3-205	ENST00000578348	HNRNPAB	Q99729	332 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
GGA3-205	ENST00000578348	ZNF670	Q9BS34	389 aa		11.75	□□□□□ -0.53
GGA3-205	ENST00000578348	C11orf84	Q9BUA3	381 aa	Predicted RBP	11.75	□□□□□ -0.53
GGA3-205	ENST00000578348	B3GNT5	Q9BYG0	378 aa		11.75	□□□□□ -0.53
GGA3-205	ENST00000578348	KRT82	Q9NSB4	513 aa		11.75	□□□□□ -0.53
GGA3-205	ENST00000578348	FAM105A	Q9NUU6	356 aa		11.75	□□□□□ -0.53
GGA3-205	ENST00000578348	SCOC	Q9UIL1	159 aa		11.75	□□□□□ -0.53
GGA3-205	ENST00000578348	ST3GAL5	Q9UNP4	418 aa		11.75	□□□□□ -0.53
GGA3-205	ENST00000578348	PPAN-P2RY11	A0A0B4J1V8	794 aa	Predicted RBP	11.75	□□□□□ -0.53
GGA3-205	ENST00000578348	CIB2	O75838	187 aa		11.75	□□□□□ -0.53
GGA3-205	ENST00000578348	BPGM	P07738	259 aa		11.75	□□□□□ -0.53
GGA3-205	ENST00000578348	CRHR1	P34998	444 aa		11.75	□□□□□ -0.53
GGA3-205	ENST00000578348	HDAC4	P56524	1084 aa		11.75	□□□□□ -0.53
GGA3-205	ENST00000578348	STX3	Q13277	289 aa		11.75	□□□□□ -0.53
GGA3-205	ENST00000578348	THEMIS2	Q5TEJ8	643 aa		11.75	□□□□□ -0.53
GGA3-205	ENST00000578348	C6orf163	Q5TEZ5	329 aa		11.75	□□□□□ -0.53
GGA3-205	ENST00000578348	RNF220	Q5VTB9	566 aa		11.75	□□□□□ -0.53
GGA3-205	ENST00000578348	SERINC5	Q86VE9	423 aa		11.75	□□□□□ -0.53
GGA3-205	ENST00000578348	SLC25A41	Q8N5S1	370 aa		11.75	□□□□□ -0.53
GGA3-205	ENST00000578348	CENPI	Q92674	756 aa	Predicted RBP	11.75	□□□□□ -0.53
GGA3-205	ENST00000578348	APBB2	Q92870	758 aa		11.75	□□□□□ -0.53
GGA3-205	ENST00000578348	LRRC39	Q96DD0	335 aa		11.75	□□□□□ -0.53
GGA3-205	ENST00000578348	SIGLEC10	Q96LC7	697 aa		11.75	□□□□□ -0.53
GGA3-205	ENST00000578348	PANX3	Q96QZ0	392 aa		11.75	□□□□□ -0.53
GGA3-205	ENST00000578348	TSC22D3	Q99576	134 aa		11.75	□□□□□ -0.53
GGA3-205	ENST00000578348	ZNF184	Q99676	751 aa	Predicted RBP	11.75	□□□□□ -0.53
GGA3-205	ENST00000578348	EBNA1BP2	Q99848	306 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
GGA3-205	ENST00000578348	CCDC106	Q9BWC9	280 aa		11.75	□□□□□ -0.53
GGA3-205	ENST00000578348	SENP6	Q9GZR1	1112 aa	Predicted RBP	11.75	□□□□□ -0.53
GGA3-205	ENST00000578348	MKS1	Q9NXB0	559 aa		11.75	□□□□□ -0.53
GGA3-205	ENST00000578348	PLA2G4C	Q9UP65	541 aa		11.75	□□□□□ -0.53
GGA3-205	ENST00000578348	FAM159B	A6NKW6	160 aa		11.74	□□□□□ -0.53
GGA3-205	ENST00000578348	MEI4	A8MW99	385 aa		11.74	□□□□□ -0.53
GGA3-205	ENST00000578348		F8W8V4	182 aa		11.74	□□□□□ -0.53
GGA3-205	ENST00000578348	SEPT4	O43236	478 aa		11.74	□□□□□ -0.53
GGA3-205	ENST00000578348	SNN	O75324	88 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
GGA3-205	ENST00000578348	TM7SF2	O76062	418 aa		11.74	□□□□□ -0.53
GGA3-205	ENST00000578348	SNUPN	O95149	360 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
GGA3-205	ENST00000578348	PGK1	P00558	417 aa		11.74	□□□□□ -0.53
GGA3-205	ENST00000578348	LCP1	P13796	627 aa		11.74	□□□□□ -0.53
GGA3-205	ENST00000578348	CYP2F1	P24903	491 aa		11.74	□□□□□ -0.53
GGA3-205	ENST00000578348	TKT	P29401	623 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
GGA3-205	ENST00000578348	MAGEA6	P43360	314 aa		11.74	□□□□□ -0.53
GGA3-205	ENST00000578348	GBE1	Q04446	702 aa		11.74	□□□□□ -0.53
GGA3-205	ENST00000578348	MGAT3	Q09327	533 aa		11.74	□□□□□ -0.53
GGA3-205	ENST00000578348	EFHC1	Q5JVL4	640 aa		11.74	□□□□□ -0.53
GGA3-205	ENST00000578348	C1orf146	Q5VVC0	180 aa		11.74	□□□□□ -0.53
GGA3-205	ENST00000578348	NET1	Q7Z628	596 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
GGA3-205	ENST00000578348	UNC5B	Q8IZJ1	945 aa		11.74	□□□□□ -0.53
GGA3-205	ENST00000578348	SLC17A6	Q9P2U8	582 aa		11.74	□□□□□ -0.53
GGA3-205	ENST00000578348	SLC7A8	Q9UHI5	535 aa		11.74	□□□□□ -0.53
GGA3-205	ENST00000578348	ANGPTL2	Q9UKU9	493 aa		11.74	□□□□□ -0.53
GGA3-205	ENST00000578348	NR2E3	Q9Y5X4	410 aa		11.74	□□□□□ -0.53
GGA3-205	ENST00000578348	GABRD	O14764	452 aa		11.74	□□□□□ -0.53
GGA3-205	ENST00000578348	LYPLA1	O75608	230 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
GGA3-205	ENST00000578348	SERPINA6	P08185	405 aa		11.74	□□□□□ -0.53
GGA3-205	ENST00000578348	ANPEP	P15144	967 aa		11.74	□□□□□ -0.53
GGA3-205	ENST00000578348	TFE3	P19532	575 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
GGA3-205	ENST00000578348	MAGEA3	P43357	314 aa		11.74	□□□□□ -0.53
GGA3-205	ENST00000578348	CBLB	Q13191	982 aa		11.74	□□□□□ -0.53
GGA3-205	ENST00000578348	TRMT5	Q32P41	509 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
GGA3-205	ENST00000578348	DNAL1	Q4LDG9	190 aa		11.74	□□□□□ -0.53
GGA3-205	ENST00000578348	C16orf46	Q6P387	395 aa		11.74	□□□□□ -0.53
GGA3-205	ENST00000578348	CASC4	Q6P4E1	433 aa		11.74	□□□□□ -0.53
GGA3-205	ENST00000578348	CDKL3	Q8IVW4	592 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
GGA3-205	ENST00000578348	MCU	Q8NE86	351 aa		11.74	□□□□□ -0.53
GGA3-205	ENST00000578348	CLEC4C	Q8WTT0	213 aa		11.74	□□□□□ -0.53
GGA3-205	ENST00000578348	ZFP42	Q96MM3	310 aa		11.74	□□□□□ -0.53
GGA3-205	ENST00000578348	TTC1	Q99614	292 aa		11.74	□□□□□ -0.53
GGA3-205	ENST00000578348	DUSP16	Q9BY84	665 aa		11.74	□□□□□ -0.53
GGA3-205	ENST00000578348	MAGEB5	Q9BZ81	275 aa		11.74	□□□□□ -0.53
GGA3-205	ENST00000578348	TSPYL2	Q9H2G4	693 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
GGA3-205	ENST00000578348	NRDE2	Q9H7Z3	1164 aa		11.74	□□□□□ -0.53
GGA3-205	ENST00000578348	XAB2	Q9HCS7	855 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
GGA3-205	ENST00000578348	FASTKD2	Q9NYY8	710 aa	Known RBP eCLIP	11.74	□□□□□ -0.53
GGA3-205	ENST00000578348	CPSF2	Q9P2I0	782 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
GGA3-205	ENST00000578348	GABRQ	Q9UN88	632 aa		11.74	□□□□□ -0.53
GGA3-205	ENST00000578348	GIT1	Q9Y2X7	761 aa		11.74	□□□□□ -0.53
GGA3-205	ENST00000578348	PCDHA11	Q9Y5I1	949 aa		11.74	□□□□□ -0.53
GGA3-205	ENST00000578348	GPR182	O15218	404 aa		11.73	□□□□□ -0.53
GGA3-205	ENST00000578348	BIRC5	O15392	142 aa		11.73	□□□□□ -0.53
GGA3-205	ENST00000578348	BAG2	O95816	211 aa		11.73	□□□□□ -0.53
GGA3-205	ENST00000578348	CHRNA1	P02708	482 aa		11.73	□□□□□ -0.53
GGA3-205	ENST00000578348	GSTA2	P09210	222 aa		11.73	□□□□□ -0.53
GGA3-205	ENST00000578348	PTPN1	P18031	435 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
GGA3-205	ENST00000578348	MLH1	P40692	756 aa		11.73	□□□□□ -0.53
GGA3-205	ENST00000578348	FLT3LG	P49771	235 aa		11.73	□□□□□ -0.53
GGA3-205	ENST00000578348	ATXN1	P54253	815 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
GGA3-205	ENST00000578348	CRADD	P78560	199 aa		11.73	□□□□□ -0.53
GGA3-205	ENST00000578348	SLC10A2	Q12908	348 aa	Predicted RBP	11.73	□□□□□ -0.53
GGA3-205	ENST00000578348	SMAD1	Q15797	465 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53

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