RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563333.1

SNAP23-205, Transcript of synaptosome associated protein 23, human

TSL 2

Gene SNAP23, Length 862 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNAP23-205	ENST00000563333	TCRBV5S1A1T	A0A578	114 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNAP23-205	ENST00000563333	ALDOA	P04075	364 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SNAP23-205	ENST00000563333	LDHC	P07864	332 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNAP23-205	ENST00000563333	HNRNPC	P07910	306 aa	Known RBP eCLIP	4.97	□□□□□ -1.61
SNAP23-205	ENST00000563333	DLD	P09622	509 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SNAP23-205	ENST00000563333	SFPQ	P23246	707 aa	Known RBP eCLIP	4.97	□□□□□ -1.61
SNAP23-205	ENST00000563333	CYP3A7	P24462	503 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNAP23-205	ENST00000563333	MAPK4	P31152	587 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNAP23-205	ENST00000563333	IDUA	P35475	653 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNAP23-205	ENST00000563333	PGM1	P36871	562 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNAP23-205	ENST00000563333	PTPN9	P43378	593 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNAP23-205	ENST00000563333	HARS2	P49590	506 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SNAP23-205	ENST00000563333	ZBTB16	Q05516	673 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNAP23-205	ENST00000563333	CBFB	Q13951	182 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNAP23-205	ENST00000563333	ZNF169	Q14929	603 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SNAP23-205	ENST00000563333	TOMM20	Q15388	145 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNAP23-205	ENST00000563333	HYI	Q5T013	277 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNAP23-205	ENST00000563333	FAM69A	Q5T7M9	428 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNAP23-205	ENST00000563333	HAUS3	Q68CZ6	603 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNAP23-205	ENST00000563333	RTL10	Q7L3V2	364 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNAP23-205	ENST00000563333	SFTPA1	Q8IWL2	248 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNAP23-205	ENST00000563333	SCN4B	Q8IWT1	228 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNAP23-205	ENST00000563333	LAS2	Q8IYD9	372 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNAP23-205	ENST00000563333	EXD3	Q8N9H8	876 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNAP23-205	ENST00000563333	IP6K1	Q92551	441 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNAP23-205	ENST00000563333	APOPT1	Q96IL0	206 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNAP23-205	ENST00000563333	HNRNPUL1	Q9BUJ2	856 aa	Known RBP eCLIP	4.97	□□□□□ -1.61
SNAP23-205	ENST00000563333	CINP	Q9BW66	212 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SNAP23-205	ENST00000563333	PRDM13	Q9H4Q3	707 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNAP23-205	ENST00000563333	CYP4F11	Q9HBI6	524 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNAP23-205	ENST00000563333	PCDHB16	Q9NRJ7	776 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNAP23-205	ENST00000563333	IRAK4	Q9NWZ3	460 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNAP23-205	ENST00000563333	SH3BP4	Q9P0V3	963 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNAP23-205	ENST00000563333	TMEM98	Q9Y2Y6	226 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNAP23-205	ENST00000563333	CYP46A1	Q9Y6A2	500 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNAP23-205	ENST00000563333		A6NCN8	305 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNAP23-205	ENST00000563333	SMIM22	K7EJ46	135 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNAP23-205	ENST00000563333	RRH	O14718	337 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNAP23-205	ENST00000563333	SYN3	O14994	580 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNAP23-205	ENST00000563333	RTN3	O95197	1032 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SNAP23-205	ENST00000563333	WEE2	P0C1S8	567 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNAP23-205	ENST00000563333	RFPL3S	P0C7P2	107 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNAP23-205	ENST00000563333	TGM1	P22735	817 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNAP23-205	ENST00000563333	SLC8A1	P32418	973 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNAP23-205	ENST00000563333	DDIT3	P35638	169 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNAP23-205	ENST00000563333	VAMP2	P63027	116 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNAP23-205	ENST00000563333	IRX6	P78412	446 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SNAP23-205	ENST00000563333	CFHR3	Q02985	330 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNAP23-205	ENST00000563333	THOC5	Q13769	683 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SNAP23-205	ENST00000563333	TBRG1	Q3YBR2	411 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNAP23-205	ENST00000563333	SPATS1	Q496A3	300 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNAP23-205	ENST00000563333	ZNF667	Q5HYK9	610 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNAP23-205	ENST00000563333	PLAC9	Q5JTB6	97 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNAP23-205	ENST00000563333	LIPM	Q5VYY2	423 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNAP23-205	ENST00000563333	ANKRD16	Q6P6B7	361 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNAP23-205	ENST00000563333	SLC39A5	Q6ZMH5	540 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNAP23-205	ENST00000563333	DCDC5	Q6ZRR9	648 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNAP23-205	ENST00000563333	MDGA2	Q7Z553	956 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNAP23-205	ENST00000563333	R3HCC1L	Q7Z5L2	792 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SNAP23-205	ENST00000563333	WDR53	Q7Z5U6	358 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SNAP23-205	ENST00000563333	ZSCAN2	Q7Z7L9	614 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SNAP23-205	ENST00000563333	MON1A	Q86VX9	555 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNAP23-205	ENST00000563333	ULK2	Q8IYT8	1036 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNAP23-205	ENST00000563333		Q8N1X5	172 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNAP23-205	ENST00000563333	TDRD7	Q8NHU6	1098 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SNAP23-205	ENST00000563333	NEU4	Q8WWR8	484 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SNAP23-205	ENST00000563333	HDAC2	Q92769	488 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SNAP23-205	ENST00000563333	HS6ST2	Q96MM7	605 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNAP23-205	ENST00000563333	PPP1R10	Q96QC0	940 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SNAP23-205	ENST00000563333	ADGRE3	Q9BY15	652 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNAP23-205	ENST00000563333	SEMA4B	Q9NPR2	832 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SNAP23-205	ENST00000563333	SLC22A11	Q9NSA0	550 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNAP23-205	ENST00000563333	RXFP3	Q9NSD7	469 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNAP23-205	ENST00000563333	SEMA5B	Q9P283	1151 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNAP23-205	ENST00000563333	ORC3	Q9UBD5	711 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SNAP23-205	ENST00000563333	GDA	Q9Y2T3	454 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNAP23-205	ENST00000563333	HEMK1	Q9Y5R4	338 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SNAP23-205	ENST00000563333	SH2D7	A6NKC9	451 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SNAP23-205	ENST00000563333		H3BNC9	293 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNAP23-205	ENST00000563333	TNPO2	O14787	897 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SNAP23-205	ENST00000563333	LDLRAD4	O15165	306 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNAP23-205	ENST00000563333	ANP32C	O43423	234 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNAP23-205	ENST00000563333	CNTN5	O94779	1100 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNAP23-205	ENST00000563333	GFPT2	O94808	682 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNAP23-205	ENST00000563333	ADH4	P08319	380 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNAP23-205	ENST00000563333	MYCL	P12524	364 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SNAP23-205	ENST00000563333	IGFBP2	P18065	325 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNAP23-205	ENST00000563333	PRKCH	P24723	683 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNAP23-205	ENST00000563333	DUSP1	P28562	367 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNAP23-205	ENST00000563333	PCP4	P48539	62 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNAP23-205	ENST00000563333	DCAF7	P61962	342 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNAP23-205	ENST00000563333	RPP30	P78346	268 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SNAP23-205	ENST00000563333	KCNB1	Q14721	858 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNAP23-205	ENST00000563333	GPR68	Q15743	365 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNAP23-205	ENST00000563333	CNGA3	Q16281	694 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNAP23-205	ENST00000563333	RUNDC3A	Q59EK9	446 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNAP23-205	ENST00000563333	AARS2	Q5JTZ9	985 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SNAP23-205	ENST00000563333	MTHFD1L	Q6UB35	978 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNAP23-205	ENST00000563333	DBX2	Q6ZNG2	339 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNAP23-205	ENST00000563333	PCGF5	Q86SE9	256 aa		4.95	□□□□□ -1.62

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