RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553920.5

RBM23-211, Transcript of RNA binding motif protein 23, humanhuman

TSL 3

Gene RBM23, Length 556 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM23-211ENST00000553920 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
RBM23-211ENST00000553920 DKK4Q9UBT3 224 aa8.45□□□□□ -1.06
RBM23-211ENST00000553920 PLA2G4CQ9UP65 541 aa8.45□□□□□ -1.06
RBM23-211ENST00000553920 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
RBM23-211ENST00000553920 CBX4O00257 560 aa8.44□□□□□ -1.06
RBM23-211ENST00000553920 TNFSF14O43557 240 aa8.44□□□□□ -1.06
RBM23-211ENST00000553920 PCDHGA12O60330 932 aa8.44□□□□□ -1.06
RBM23-211ENST00000553920 TBL1XO60907 577 aa8.44□□□□□ -1.06
RBM23-211ENST00000553920 SIN3BO75182 1162 aa8.44□□□□□ -1.06
RBM23-211ENST00000553920 LATS1O95835 1130 aa8.44□□□□□ -1.06
RBM23-211ENST00000553920 DNTTP04053 509 aa8.44□□□□□ -1.06
RBM23-211ENST00000553920 NEFHP12036 1026 aa8.44□□□□□ -1.06
RBM23-211ENST00000553920 LCP1P13796 627 aa8.44□□□□□ -1.06
RBM23-211ENST00000553920 PRCPP42785 496 aa8.44□□□□□ -1.06
RBM23-211ENST00000553920 RGS7P49802 495 aa8.44□□□□□ -1.06
RBM23-211ENST00000553920 BST2Q10589 180 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
RBM23-211ENST00000553920 LRMPQ12912 555 aa8.44□□□□□ -1.06
RBM23-211ENST00000553920 KCNJ12Q14500 433 aa8.44□□□□□ -1.06
RBM23-211ENST00000553920 E2F5Q15329 346 aa8.44□□□□□ -1.06
RBM23-211ENST00000553920 SGO2Q562F6 1265 aa8.44□□□□□ -1.06
RBM23-211ENST00000553920 FSCBQ5H9T9 825 aa8.44□□□□□ -1.06
RBM23-211ENST00000553920 DHRS13Q6UX07 377 aa8.44□□□□□ -1.06
RBM23-211ENST00000553920 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa8.44□□□□□ -1.06
RBM23-211ENST00000553920 SCML4Q8N228 414 aa8.44□□□□□ -1.06
RBM23-211ENST00000553920 TTC39CQ8N584 583 aa8.44□□□□□ -1.06
RBM23-211ENST00000553920 RNF139Q8WU17 664 aa8.44□□□□□ -1.06
RBM23-211ENST00000553920 SLC35F5Q8WV83 523 aa8.44□□□□□ -1.06
RBM23-211ENST00000553920 KAT5Q92993 513 aa8.44□□□□□ -1.06
RBM23-211ENST00000553920 IGSF8Q969P0 613 aa8.44□□□□□ -1.06
RBM23-211ENST00000553920 TTC17Q96AE7 1141 aa8.44□□□□□ -1.06
RBM23-211ENST00000553920 LRIG1Q96JA1 1093 aa8.44□□□□□ -1.06
RBM23-211ENST00000553920 SPATA32Q96LK8 384 aa8.44□□□□□ -1.06
RBM23-211ENST00000553920 SLC6A18Q96N87 628 aa8.44□□□□□ -1.06
RBM23-211ENST00000553920 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
RBM23-211ENST00000553920 SCUBE2Q9NQ36 999 aa8.44□□□□□ -1.06
RBM23-211ENST00000553920 CNGB3Q9NQW8 809 aa8.44□□□□□ -1.06
RBM23-211ENST00000553920 ABCC13Q9NSE7 274 aa8.44□□□□□ -1.06
RBM23-211ENST00000553920 ACACAQ13085 2346 aa8.44□□□□□ -1.06
RBM23-211ENST00000553920 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
RBM23-211ENST00000553920 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
RBM23-211ENST00000553920 A0A087WV48 116 aa8.43□□□□□ -1.06
RBM23-211ENST00000553920 A0A1B0GTQ1 180 aa8.43□□□□□ -1.06
RBM23-211ENST00000553920 A0A1W2PPC4 97 aa8.43□□□□□ -1.06
RBM23-211ENST00000553920 CETN3O15182 167 aa8.43□□□□□ -1.06
RBM23-211ENST00000553920 VILLO15195 856 aa8.43□□□□□ -1.06
RBM23-211ENST00000553920 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
RBM23-211ENST00000553920 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
RBM23-211ENST00000553920 ACSL4O60488 711 aa8.43□□□□□ -1.06
RBM23-211ENST00000553920 ZNF202O95125 648 aa8.43□□□□□ -1.06
RBM23-211ENST00000553920 VDRP11473 427 aa8.43□□□□□ -1.06
RBM23-211ENST00000553920 CD19P15391 556 aa8.43□□□□□ -1.06
RBM23-211ENST00000553920 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
RBM23-211ENST00000553920 CSKP41240 450 aa8.43□□□□□ -1.06
RBM23-211ENST00000553920 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
RBM23-211ENST00000553920 GRK6P43250 576 aa8.43□□□□□ -1.06
RBM23-211ENST00000553920 CCT8P50990 548 aa8.43□□□□□ -1.06
RBM23-211ENST00000553920 GALCP54803 685 aa8.43□□□□□ -1.06
RBM23-211ENST00000553920 SLC8A3P57103 927 aa8.43□□□□□ -1.06
RBM23-211ENST00000553920 ZNF445P59923 1031 aa8.43□□□□□ -1.06
RBM23-211ENST00000553920 RPS24P62847 133 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
RBM23-211ENST00000553920 ZBTB16Q05516 673 aa8.43□□□□□ -1.06
RBM23-211ENST00000553920 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
RBM23-211ENST00000553920 TEAD4Q15561 434 aa8.43□□□□□ -1.06
RBM23-211ENST00000553920 CCDC157Q569K6 752 aa8.43□□□□□ -1.06
RBM23-211ENST00000553920 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
RBM23-211ENST00000553920 MPP7Q5T2T1 576 aa8.43□□□□□ -1.06
RBM23-211ENST00000553920 C9orf64Q5T6V5 341 aa8.43□□□□□ -1.06
RBM23-211ENST00000553920 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
RBM23-211ENST00000553920 KIAA0895LQ68EN5 471 aa8.43□□□□□ -1.06
RBM23-211ENST00000553920 ANKRD40Q6AI12 368 aa8.43□□□□□ -1.06
RBM23-211ENST00000553920 LCLAT1Q6UWP7 414 aa8.43□□□□□ -1.06
RBM23-211ENST00000553920 GATAD2AQ86YP4 633 aa8.43□□□□□ -1.06
RBM23-211ENST00000553920 HSCBQ8IWL3 235 aa8.43□□□□□ -1.06
RBM23-211ENST00000553920 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
RBM23-211ENST00000553920 FIBINQ8TAL6 211 aa8.43□□□□□ -1.06
RBM23-211ENST00000553920 SLC35C1Q96A29 364 aa8.43□□□□□ -1.06
RBM23-211ENST00000553920 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
RBM23-211ENST00000553920 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
RBM23-211ENST00000553920 FAM129BQ96TA1 746 aa8.43□□□□□ -1.06
RBM23-211ENST00000553920 DNAI2Q9GZS0 605 aa8.43□□□□□ -1.06
RBM23-211ENST00000553920 NEUROG2Q9H2A3 272 aa8.43□□□□□ -1.06
RBM23-211ENST00000553920 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
RBM23-211ENST00000553920 SGK2Q9HBY8 427 aa8.43□□□□□ -1.06
RBM23-211ENST00000553920 STIM2Q9P246 746 aa8.43□□□□□ -1.06
RBM23-211ENST00000553920 HESX1Q9UBX0 185 aa8.43□□□□□ -1.06
RBM23-211ENST00000553920 SUN2Q9UH99 717 aa8.43□□□□□ -1.06
RBM23-211ENST00000553920 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
RBM23-211ENST00000553920 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
RBM23-211ENST00000553920 URB1O60287 2271 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
RBM23-211ENST00000553920 A0A1W2PP55 124 aa8.42□□□□□ -1.06
RBM23-211ENST00000553920 A0A1W2PQ27 194 aa8.42□□□□□ -1.06
RBM23-211ENST00000553920 A0A1W2PQ64 194 aa8.42□□□□□ -1.06
RBM23-211ENST00000553920 A0A1W2PR77 199 aa8.42□□□□□ -1.06
RBM23-211ENST00000553920 TRIM49BA6NDI0 452 aa8.42□□□□□ -1.06
RBM23-211ENST00000553920 FAM47DPA6NHR8 397 aa8.42□□□□□ -1.06
RBM23-211ENST00000553920 TTC34A8MYJ7 566 aa8.42□□□□□ -1.06
RBM23-211ENST00000553920 MID1O15344 667 aa8.42□□□□□ -1.06
RBM23-211ENST00000553920 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
RBM23-211ENST00000553920 CCDC172P0C7W6 258 aa8.42□□□□□ -1.06
RBM23-211ENST00000553920 SETSIPP0DME0 302 aa8.42□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.9 ms