RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551253.5

CS-225, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 676 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-225ENST00000551253 TCEA3O75764 348 aa7.45□□□□□ -1.22
CS-225ENST00000551253 IL18RAPO95256 599 aa7.45□□□□□ -1.22
CS-225ENST00000551253 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
CS-225ENST00000551253 SMC2O95347 1197 aa7.45□□□□□ -1.22
CS-225ENST00000551253 CSH1P0DML2 217 aa7.45□□□□□ -1.22
CS-225ENST00000551253 CSH2P0DML3 217 aa7.45□□□□□ -1.22
CS-225ENST00000551253 FECHP22830 423 aa7.45□□□□□ -1.22
CS-225ENST00000551253 UGT1A5P35504 534 aa7.45□□□□□ -1.22
CS-225ENST00000551253 HARS2P49590 506 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
CS-225ENST00000551253 PDE6CP51160 858 aa7.45□□□□□ -1.22
CS-225ENST00000551253 GUCY2FP51841 1108 aa7.45□□□□□ -1.22
CS-225ENST00000551253 NXPH1P58417 271 aa7.45□□□□□ -1.22
CS-225ENST00000551253 SMARCB1Q12824 385 aa7.45□□□□□ -1.22
CS-225ENST00000551253 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
CS-225ENST00000551253 SEPT6Q14141 434 aa7.45□□□□□ -1.22
CS-225ENST00000551253 SLC39A12Q504Y0 691 aa7.45□□□□□ -1.22
CS-225ENST00000551253 COBLL1Q53SF7 1204 aa7.45□□□□□ -1.22
CS-225ENST00000551253 LY6G5CQ5SRR4 150 aa7.45□□□□□ -1.22
CS-225ENST00000551253 C9orf57Q5W0N0 161 aa7.45□□□□□ -1.22
CS-225ENST00000551253 BRSK2Q8IWQ3 736 aa7.45□□□□□ -1.22
CS-225ENST00000551253 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
CS-225ENST00000551253 FBXO39Q8N4B4 442 aa7.45□□□□□ -1.22
CS-225ENST00000551253 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa7.45□□□□□ -1.22
CS-225ENST00000551253 TPCN2Q8NHX9 752 aa7.45□□□□□ -1.22
CS-225ENST00000551253 GOLGA5Q8TBA6 731 aa7.45□□□□□ -1.22
CS-225ENST00000551253 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
CS-225ENST00000551253 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
CS-225ENST00000551253 SMARCE1Q969G3 411 aa7.45□□□□□ -1.22
CS-225ENST00000551253 ARRDC3Q96B67 414 aa7.45□□□□□ -1.22
CS-225ENST00000551253 SAAL1Q96ER3 474 aa7.45□□□□□ -1.22
CS-225ENST00000551253 GBP4Q96PP9 640 aa7.45□□□□□ -1.22
CS-225ENST00000551253 GSDMAQ96QA5 445 aa7.45□□□□□ -1.22
CS-225ENST00000551253 FAM213AQ9BRX8 229 aa7.45□□□□□ -1.22
CS-225ENST00000551253 SGPP1Q9BX95 441 aa7.45□□□□□ -1.22
CS-225ENST00000551253 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
CS-225ENST00000551253 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa7.45□□□□□ -1.22
CS-225ENST00000551253 KCTD10Q9H3F6 313 aa7.45□□□□□ -1.22
CS-225ENST00000551253 PCIF1Q9H4Z3 704 aa7.45□□□□□ -1.22
CS-225ENST00000551253 USP29Q9HBJ7 922 aa7.45□□□□□ -1.22
CS-225ENST00000551253 KIAA1586Q9HCI6 787 aa7.45□□□□□ -1.22
CS-225ENST00000551253 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa7.45□□□□□ -1.22
CS-225ENST00000551253 RMND1Q9NWS8 449 aa7.45□□□□□ -1.22
CS-225ENST00000551253 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
CS-225ENST00000551253 DSEQ9UL01 958 aa7.45□□□□□ -1.22
CS-225ENST00000551253 STON1Q9Y6Q2 735 aa7.45□□□□□ -1.22
CS-225ENST00000551253 A0A1W2PR77 199 aa7.44□□□□□ -1.22
CS-225ENST00000551253 GOLGA8IPA6NC78 632 aa7.44□□□□□ -1.22
CS-225ENST00000551253 C2orf78A6NCI8 922 aa7.44□□□□□ -1.22
CS-225ENST00000551253 ZNF233A6NK53 670 aa7.44□□□□□ -1.22
CS-225ENST00000551253 GOLGA8JA6NMD2 632 aa7.44□□□□□ -1.22
CS-225ENST00000551253 PRRT4C9JH25 899 aa7.44□□□□□ -1.22
CS-225ENST00000551253 K7EM74 188 aa7.44□□□□□ -1.22
CS-225ENST00000551253 PIRO00625 290 aa7.44□□□□□ -1.22
CS-225ENST00000551253 PDXKO00764 312 aa7.44□□□□□ -1.22
CS-225ENST00000551253 TRIM24O15164 1050 aa7.44□□□□□ -1.22
CS-225ENST00000551253 CLIC2O15247 247 aa7.44□□□□□ -1.22
CS-225ENST00000551253 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
CS-225ENST00000551253 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
CS-225ENST00000551253 CNTN5O94779 1100 aa7.44□□□□□ -1.22
CS-225ENST00000551253 IGHV4-34P06331 123 aa7.44□□□□□ -1.22
CS-225ENST00000551253 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
CS-225ENST00000551253 NR1D1P20393 614 aa7.44□□□□□ -1.22
CS-225ENST00000551253 COPAP53621 1224 aa7.44□□□□□ -1.22
CS-225ENST00000551253 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
CS-225ENST00000551253 TMEM132DQ14C87 1099 aa7.44□□□□□ -1.22
CS-225ENST00000551253 SURF1Q15526 300 aa7.44□□□□□ -1.22
CS-225ENST00000551253 NFIL3Q16649 462 aa7.44□□□□□ -1.22
CS-225ENST00000551253 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa7.44□□□□□ -1.22
CS-225ENST00000551253 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
CS-225ENST00000551253 JADE1Q6IE81 842 aa7.44□□□□□ -1.22
CS-225ENST00000551253 ASB18Q6ZVZ8 466 aa7.44□□□□□ -1.22
CS-225ENST00000551253 ZFAND4Q86XD8 727 aa7.44□□□□□ -1.22
CS-225ENST00000551253 SLC9A9Q8IVB4 645 aa7.44□□□□□ -1.22
CS-225ENST00000551253 XXYLT1Q8NBI6 393 aa7.44□□□□□ -1.22
CS-225ENST00000551253 OR10T2Q8NGX3 314 aa7.44□□□□□ -1.22
CS-225ENST00000551253 IFI44Q8TCB0 444 aa7.44□□□□□ -1.22
CS-225ENST00000551253 SPPL2BQ8TCT7 592 aa7.44□□□□□ -1.22
CS-225ENST00000551253 FAM212AQ96EL1 285 aa7.44□□□□□ -1.22
CS-225ENST00000551253 APOLD1Q96LR9 279 aa7.44□□□□□ -1.22
CS-225ENST00000551253 MYRFLQ96LU7 910 aa7.44□□□□□ -1.22
CS-225ENST00000551253 SLC29A3Q9BZD2 475 aa7.44□□□□□ -1.22
CS-225ENST00000551253 BTBD1Q9H0C5 482 aa7.44□□□□□ -1.22
CS-225ENST00000551253 EVA1BQ9NVM1 165 aa7.44□□□□□ -1.22
CS-225ENST00000551253 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
CS-225ENST00000551253 TBC1D14Q9P2M4 693 aa7.44□□□□□ -1.22
CS-225ENST00000551253 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa7.44□□□□□ -1.22
CS-225ENST00000551253 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa7.44□□□□□ -1.22
CS-225ENST00000551253 CROCCQ5TZA2 2017 aa7.44□□□□□ -1.22
CS-225ENST00000551253 PLXNA2O75051 1894 aa7.43□□□□□ -1.22
CS-225ENST00000551253 A0A1W2PQC6 194 aa7.43□□□□□ -1.22
CS-225ENST00000551253 CALUO43852 315 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
CS-225ENST00000551253 SDC3O75056 442 aa7.43□□□□□ -1.22
CS-225ENST00000551253 FOSL1P15407 271 aa7.43□□□□□ -1.22
CS-225ENST00000551253 BPIP17213 487 aa7.43□□□□□ -1.22
CS-225ENST00000551253 PFKLP17858 780 aa7.43□□□□□ -1.22
CS-225ENST00000551253 CLCN1P35523 988 aa7.43□□□□□ -1.22
CS-225ENST00000551253 CYP2J2P51589 502 aa7.43□□□□□ -1.22
CS-225ENST00000551253 ART1P52961 327 aa7.43□□□□□ -1.22
CS-225ENST00000551253 WNT7BP56706 349 aa7.43□□□□□ -1.22
CS-225ENST00000551253 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.3 ms