RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547052.1

BRF1-209, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, humanhuman

TSL 5

Gene BRF1, Length 771 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRF1-209ENST00000547052 MIPP30301 263 aa18.46■□□□□ 0.55
BRF1-209ENST00000547052 ETFBP38117 255 aa18.46■□□□□ 0.55
BRF1-209ENST00000547052 ARL4AP40617 200 aa18.46■□□□□ 0.55
BRF1-209ENST00000547052 RPS9P46781 194 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
BRF1-209ENST00000547052 TPI1P60174 286 aa18.46■□□□□ 0.55
BRF1-209ENST00000547052 RPS24P62847 133 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
BRF1-209ENST00000547052 OGDHQ02218 1023 aa18.46■□□□□ 0.55
BRF1-209ENST00000547052 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
BRF1-209ENST00000547052 SLC12A1Q13621 1099 aa18.46■□□□□ 0.55
BRF1-209ENST00000547052 DMC1Q14565 340 aa18.46■□□□□ 0.55
BRF1-209ENST00000547052 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
BRF1-209ENST00000547052 C6orf118Q5T5N4 469 aa18.46■□□□□ 0.55
BRF1-209ENST00000547052 FBXL22Q6P050 247 aa18.46■□□□□ 0.55
BRF1-209ENST00000547052 TXNDC11Q6PKC3 985 aa18.46■□□□□ 0.55
BRF1-209ENST00000547052 RAD9BQ6WBX8 426 aa18.46■□□□□ 0.55
BRF1-209ENST00000547052 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa18.46■□□□□ 0.55
BRF1-209ENST00000547052 CCDC185Q8N715 623 aa18.46■□□□□ 0.55
BRF1-209ENST00000547052 KCNV2Q8TDN2 545 aa18.46■□□□□ 0.55
BRF1-209ENST00000547052 CHFRQ96EP1 664 aa18.46■□□□□ 0.55
BRF1-209ENST00000547052 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
BRF1-209ENST00000547052 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa18.46■□□□□ 0.55
BRF1-209ENST00000547052 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
BRF1-209ENST00000547052 FZD10Q9ULW2 581 aa18.46■□□□□ 0.55
BRF1-209ENST00000547052 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa18.46■□□□□ 0.55
BRF1-209ENST00000547052 VCANP13611 3396 aa18.46■□□□□ 0.55
BRF1-209ENST00000547052 CHD5Q8TDI0 1954 aa18.46■□□□□ 0.55
BRF1-209ENST00000547052 SHROOM3Q8TF72 1996 aa18.46■□□□□ 0.55
BRF1-209ENST00000547052 A0A0C4DFX4 3053 aa18.46■□□□□ 0.54
BRF1-209ENST00000547052 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP18.45■□□□□ 0.54
BRF1-209ENST00000547052 KRT86O43790 486 aa18.45■□□□□ 0.54
BRF1-209ENST00000547052 CREB3O43889 395 aa18.45■□□□□ 0.54
BRF1-209ENST00000547052 LRCH4O75427 683 aa18.45■□□□□ 0.54
BRF1-209ENST00000547052 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
BRF1-209ENST00000547052 CCDC175P0C221 793 aa18.45■□□□□ 0.54
BRF1-209ENST00000547052 L1CAMP32004 1257 aa18.45■□□□□ 0.54
BRF1-209ENST00000547052 SLC6A11P48066 632 aa18.45■□□□□ 0.54
BRF1-209ENST00000547052 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
BRF1-209ENST00000547052 KRT81Q14533 505 aa18.45■□□□□ 0.54
BRF1-209ENST00000547052 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP18.45■□□□□ 0.54
BRF1-209ENST00000547052 FSTL4Q6MZW2 842 aa18.45■□□□□ 0.54
BRF1-209ENST00000547052 C12orf40Q86WS4 652 aa18.45■□□□□ 0.54
BRF1-209ENST00000547052 MAP7D3Q8IWC1 876 aa18.45■□□□□ 0.54
BRF1-209ENST00000547052 CFAP52Q8N1V2 620 aa18.45■□□□□ 0.54
BRF1-209ENST00000547052 FIBINQ8TAL6 211 aa18.45■□□□□ 0.54
BRF1-209ENST00000547052 TEKT4Q8WW24 435 aa18.45■□□□□ 0.54
BRF1-209ENST00000547052 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP18.45■□□□□ 0.54
BRF1-209ENST00000547052 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
BRF1-209ENST00000547052 ADAM33Q9BZ11 813 aa18.45■□□□□ 0.54
BRF1-209ENST00000547052 TRIM7Q9C029 511 aa18.45■□□□□ 0.54
BRF1-209ENST00000547052 OSGEPQ9NPF4 335 aa18.45■□□□□ 0.54
BRF1-209ENST00000547052 GGA2Q9UJY4 613 aa18.45■□□□□ 0.54
BRF1-209ENST00000547052 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP18.45■□□□□ 0.54
BRF1-209ENST00000547052 H3BRJ5 948 aa18.44■□□□□ 0.54
BRF1-209ENST00000547052 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
BRF1-209ENST00000547052 EGFP01133 1207 aa18.44■□□□□ 0.54
BRF1-209ENST00000547052 RHOCP08134 193 aa18.44■□□□□ 0.54
BRF1-209ENST00000547052 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
BRF1-209ENST00000547052 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
BRF1-209ENST00000547052 OR1E1P30953 314 aa18.44■□□□□ 0.54
BRF1-209ENST00000547052 GJC1P36383 396 aa18.44■□□□□ 0.54
BRF1-209ENST00000547052 NUBP1P53384 320 aa18.44■□□□□ 0.54
BRF1-209ENST00000547052 SULT2A1Q06520 285 aa18.44■□□□□ 0.54
BRF1-209ENST00000547052 CCDC173Q0VFZ6 552 aa18.44■□□□□ 0.54
BRF1-209ENST00000547052 TCEAL1Q15170 157 aa18.44■□□□□ 0.54
BRF1-209ENST00000547052 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP18.44■□□□□ 0.54
BRF1-209ENST00000547052 IER5LQ5T953 404 aa18.44■□□□□ 0.54
BRF1-209ENST00000547052 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
BRF1-209ENST00000547052 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP18.44■□□□□ 0.54
BRF1-209ENST00000547052 TMEM139Q8IV31 216 aa18.44■□□□□ 0.54
BRF1-209ENST00000547052 CCDC105Q8IYK2 499 aa18.44■□□□□ 0.54
BRF1-209ENST00000547052 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
BRF1-209ENST00000547052 ACRBPQ8NEB7 543 aa18.44■□□□□ 0.54
BRF1-209ENST00000547052 HSPH1Q92598 858 aa18.44■□□□□ 0.54
BRF1-209ENST00000547052 BTBD6Q96KE9 485 aa18.44■□□□□ 0.54
BRF1-209ENST00000547052 PRRX2Q99811 253 aa18.44■□□□□ 0.54
BRF1-209ENST00000547052 CIPCQ9C0C6 399 aa18.44■□□□□ 0.54
BRF1-209ENST00000547052 MUC3BQ9H195 1237 aa18.44■□□□□ 0.54
BRF1-209ENST00000547052 ABCB8Q9NUT2 735 aa18.44■□□□□ 0.54
BRF1-209ENST00000547052 PLA2G4CQ9UP65 541 aa18.44■□□□□ 0.54
BRF1-209ENST00000547052 SLC8A2Q9UPR5 921 aa18.44■□□□□ 0.54
BRF1-209ENST00000547052 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP18.43■□□□□ 0.54
BRF1-209ENST00000547052 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa18.43■□□□□ 0.54
BRF1-209ENST00000547052 BTNL10A8MVZ5 291 aa18.43■□□□□ 0.54
BRF1-209ENST00000547052 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP18.43■□□□□ 0.54
BRF1-209ENST00000547052 DCNP07585 359 aaKnown RBP18.43■□□□□ 0.54
BRF1-209ENST00000547052 EPHB2P29323 1055 aa18.43■□□□□ 0.54
BRF1-209ENST00000547052 GGCXP38435 758 aa18.43■□□□□ 0.54
BRF1-209ENST00000547052 NNMTP40261 264 aa18.43■□□□□ 0.54
BRF1-209ENST00000547052 HADHBP55084 474 aaKnown RBP18.43■□□□□ 0.54
BRF1-209ENST00000547052 SEC13P55735 322 aa18.43■□□□□ 0.54
BRF1-209ENST00000547052 ST8SIA6P61647 398 aa18.43■□□□□ 0.54
BRF1-209ENST00000547052 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa18.43■□□□□ 0.54
BRF1-209ENST00000547052 CCINQ13939 588 aa18.43■□□□□ 0.54
BRF1-209ENST00000547052 GAB4Q2WGN9 574 aa18.43■□□□□ 0.54
BRF1-209ENST00000547052 ZNF783Q6ZMS7 281 aa18.43■□□□□ 0.54
BRF1-209ENST00000547052 SYCE1Q8N0S2 351 aa18.43■□□□□ 0.54
BRF1-209ENST00000547052 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP18.43■□□□□ 0.54
BRF1-209ENST00000547052 CLDN23Q96B33 292 aa18.43■□□□□ 0.54
BRF1-209ENST00000547052 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP18.43■□□□□ 0.54
BRF1-209ENST00000547052 CHRDQ9H2X0 955 aa18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.9 ms