RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538616.1

CD27-AS1-208, CD27 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene CD27-AS1, Length 657 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD27-AS1-208ENST00000538616 RPL34P49207 117 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
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CD27-AS1-208ENST00000538616 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa20.03■□□□□ 0.8
CD27-AS1-208ENST00000538616 IRGQQ8WZA9 623 aa20.03■□□□□ 0.8
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CD27-AS1-208ENST00000538616 WDR35Q9P2L0 1181 aa20.02■□□□□ 0.8
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CD27-AS1-208ENST00000538616 ZNF510Q9Y2H8 683 aa20.02■□□□□ 0.8
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CD27-AS1-208ENST00000538616 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
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CD27-AS1-208ENST00000538616 UCHL3P15374 230 aa20.01■□□□□ 0.79
CD27-AS1-208ENST00000538616 ACADSBP45954 432 aa20.01■□□□□ 0.79
CD27-AS1-208ENST00000538616 PDCLQ13371 301 aa20.01■□□□□ 0.79
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CD27-AS1-208ENST00000538616 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
CD27-AS1-208ENST00000538616 MEA1Q16626 185 aa20.01■□□□□ 0.79
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CD27-AS1-208ENST00000538616 AOPEPQ8N6M6 819 aa20.01■□□□□ 0.79
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CD27-AS1-208ENST00000538616 HSD3B7Q9H2F3 369 aa20■□□□□ 0.79
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CD27-AS1-208ENST00000538616 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
CD27-AS1-208ENST00000538616 PCDHGC3Q9UN70 934 aa20■□□□□ 0.79
CD27-AS1-208ENST00000538616 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
CD27-AS1-208ENST00000538616 METTL12A8MUP2 240 aa19.99■□□□□ 0.79
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CD27-AS1-208ENST00000538616 CHKAP35790 457 aa19.99■□□□□ 0.79
CD27-AS1-208ENST00000538616 HARS2P49590 506 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
CD27-AS1-208ENST00000538616 TAF5Q15542 800 aa19.99■□□□□ 0.79
CD27-AS1-208ENST00000538616 DCAF12L1Q5VU92 463 aa19.99■□□□□ 0.79
CD27-AS1-208ENST00000538616 FYB2Q5VWT5 728 aa19.99■□□□□ 0.79
CD27-AS1-208ENST00000538616 SYPL2Q5VXT5 272 aa19.99■□□□□ 0.79
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CD27-AS1-208ENST00000538616 ZNF843Q8N446 348 aa19.99■□□□□ 0.79
CD27-AS1-208ENST00000538616 NXPE2Q96DL1 559 aa19.99■□□□□ 0.79
CD27-AS1-208ENST00000538616 GANQ9H2C0 597 aa19.99■□□□□ 0.79
CD27-AS1-208ENST00000538616 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
CD27-AS1-208ENST00000538616 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa19.99■□□□□ 0.79
CD27-AS1-208ENST00000538616 FAM149AA5PLN7 773 aa19.98■□□□□ 0.79
CD27-AS1-208ENST00000538616 J3QKU1 62 aa19.98■□□□□ 0.79
CD27-AS1-208ENST00000538616 NPC1O15118 1278 aa19.98■□□□□ 0.79
CD27-AS1-208ENST00000538616 EPHB6O15197 1021 aa19.98■□□□□ 0.79
CD27-AS1-208ENST00000538616 TSPAN3O60637 253 aa19.98■□□□□ 0.79
CD27-AS1-208ENST00000538616 CISD3P0C7P0 127 aa19.98■□□□□ 0.79
CD27-AS1-208ENST00000538616 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP19.98■□□□□ 0.79
CD27-AS1-208ENST00000538616 KRT9P35527 623 aa19.98■□□□□ 0.79
CD27-AS1-208ENST00000538616 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP19.98■□□□□ 0.79
CD27-AS1-208ENST00000538616 GRK6P43250 576 aa19.98■□□□□ 0.79
CD27-AS1-208ENST00000538616 DGKGP49619 791 aa19.98■□□□□ 0.79
CD27-AS1-208ENST00000538616 PTPRNQ16849 979 aa19.98■□□□□ 0.79
CD27-AS1-208ENST00000538616 FKBP15Q5T1M5 1219 aa19.98■□□□□ 0.79
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