RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532751.1

PTPRK-222, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 4

Gene PTPRK, Length 563 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-222ENST00000532751 EBF1Q9UH73 591 aa22.68■■□□□ 1.22
PTPRK-222ENST00000532751 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa22.68■■□□□ 1.22
PTPRK-222ENST00000532751 EML5Q05BV3 1969 aa22.67■■□□□ 1.22
PTPRK-222ENST00000532751 A0A1B0GVM2 712 aa22.67■■□□□ 1.22
PTPRK-222ENST00000532751 TCAF2A6NFQ2 919 aa22.67■■□□□ 1.22
PTPRK-222ENST00000532751 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
PTPRK-222ENST00000532751 MOCS3O95396 460 aa22.67■■□□□ 1.22
PTPRK-222ENST00000532751 MYBL1P10243 752 aa22.67■■□□□ 1.22
PTPRK-222ENST00000532751 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
PTPRK-222ENST00000532751 CD70P32970 193 aa22.67■■□□□ 1.22
PTPRK-222ENST00000532751 LRRC31Q6UY01 552 aa22.67■■□□□ 1.22
PTPRK-222ENST00000532751 DRC7Q8IY82 874 aa22.67■■□□□ 1.22
PTPRK-222ENST00000532751 FAM172AQ8WUF8 416 aa22.67■■□□□ 1.22
PTPRK-222ENST00000532751 C1orf74Q96LT6 269 aa22.67■■□□□ 1.22
PTPRK-222ENST00000532751 HAPLN3Q96S86 360 aa22.67■■□□□ 1.22
PTPRK-222ENST00000532751 ACOX2Q99424 681 aa22.67■■□□□ 1.22
PTPRK-222ENST00000532751 GABRG3Q99928 467 aa22.67■■□□□ 1.22
PTPRK-222ENST00000532751 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
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PTPRK-222ENST00000532751 OXCT1P55809 520 aa22.66■■□□□ 1.22
PTPRK-222ENST00000532751 LMAN2Q12907 356 aa22.66■■□□□ 1.22
PTPRK-222ENST00000532751 STARD3Q14849 445 aa22.66■■□□□ 1.22
PTPRK-222ENST00000532751 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa22.66■■□□□ 1.22
PTPRK-222ENST00000532751 TMEM215Q68D42 235 aa22.66■■□□□ 1.22
PTPRK-222ENST00000532751 MBLAC2Q68D91 279 aa22.66■■□□□ 1.22
PTPRK-222ENST00000532751 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa22.66■■□□□ 1.22
PTPRK-222ENST00000532751 ANO7Q6IWH7 933 aa22.66■■□□□ 1.22
PTPRK-222ENST00000532751 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
PTPRK-222ENST00000532751 OR8K1Q8NGG5 319 aa22.66■■□□□ 1.22
PTPRK-222ENST00000532751 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
PTPRK-222ENST00000532751 ZNF653Q96CK0 615 aa22.66■■□□□ 1.22
PTPRK-222ENST00000532751 RBSNQ9H1K0 784 aa22.66■■□□□ 1.22
PTPRK-222ENST00000532751 ISCUQ9H1K1 167 aa22.66■■□□□ 1.22
PTPRK-222ENST00000532751 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa22.66■■□□□ 1.22
PTPRK-222ENST00000532751 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP22.66■■□□□ 1.22
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PTPRK-222ENST00000532751 PLA2G4CQ9UP65 541 aa22.66■■□□□ 1.22
PTPRK-222ENST00000532751 STON1Q9Y6Q2 735 aa22.66■■□□□ 1.22
PTPRK-222ENST00000532751 SCINQ9Y6U3 715 aa22.66■■□□□ 1.22
PTPRK-222ENST00000532751 DOCK4Q8N1I0 1966 aa22.65■■□□□ 1.22
PTPRK-222ENST00000532751 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa22.65■■□□□ 1.22
PTPRK-222ENST00000532751 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
PTPRK-222ENST00000532751 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
PTPRK-222ENST00000532751 MAMLD1Q13495 774 aa22.65■■□□□ 1.22
PTPRK-222ENST00000532751 SLC12A1Q13621 1099 aa22.65■■□□□ 1.22
PTPRK-222ENST00000532751 ZNF234Q14588 700 aa22.65■■□□□ 1.22
PTPRK-222ENST00000532751 C5orf22Q49AR2 442 aa22.65■■□□□ 1.22
PTPRK-222ENST00000532751 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa22.65■■□□□ 1.22
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PTPRK-222ENST00000532751 EPC1Q9H2F5 836 aa22.65■■□□□ 1.22
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PTPRK-222ENST00000532751 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
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PTPRK-222ENST00000532751 CLDN11O75508 207 aa22.64■■□□□ 1.21
PTPRK-222ENST00000532751 IL12RB1P42701 662 aa22.64■■□□□ 1.21
PTPRK-222ENST00000532751 MRE11P49959 708 aa22.64■■□□□ 1.21
PTPRK-222ENST00000532751 CDH4P55283 916 aa22.64■■□□□ 1.21
PTPRK-222ENST00000532751 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
PTPRK-222ENST00000532751 CEP68Q76N32 757 aa22.64■■□□□ 1.21
PTPRK-222ENST00000532751 C14orf80Q86SX3 495 aa22.64■■□□□ 1.21
PTPRK-222ENST00000532751 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
PTPRK-222ENST00000532751 PGBD3Q8N328 593 aa22.64■■□□□ 1.21
PTPRK-222ENST00000532751 SORCS1Q8WY21 1168 aa22.64■■□□□ 1.21
PTPRK-222ENST00000532751 LMLNQ96KR4 655 aa22.64■■□□□ 1.21
PTPRK-222ENST00000532751 DNAJC7Q99615 494 aa22.64■■□□□ 1.21
PTPRK-222ENST00000532751 CNPY3Q9BT09 278 aa22.64■■□□□ 1.21
PTPRK-222ENST00000532751 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
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PTPRK-222ENST00000532751 PRR23AA6NEV1 266 aa22.63■■□□□ 1.21
PTPRK-222ENST00000532751 WASH3PC4AMC7 463 aa22.63■■□□□ 1.21
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PTPRK-222ENST00000532751 RPP40O75818 363 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
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PTPRK-222ENST00000532751 DLDP09622 509 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
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PTPRK-222ENST00000532751 HDAC4P56524 1084 aa22.63■■□□□ 1.21
PTPRK-222ENST00000532751 ENPP2Q13822 863 aa22.63■■□□□ 1.21
PTPRK-222ENST00000532751 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
PTPRK-222ENST00000532751 FUT11Q495W5 492 aa22.63■■□□□ 1.21
PTPRK-222ENST00000532751 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
PTPRK-222ENST00000532751 FSCBQ5H9T9 825 aa22.63■■□□□ 1.21
PTPRK-222ENST00000532751 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa22.63■■□□□ 1.21
PTPRK-222ENST00000532751 PRR23BQ6ZRT6 265 aa22.63■■□□□ 1.21
PTPRK-222ENST00000532751 TMC6Q7Z403 805 aa22.63■■□□□ 1.21
PTPRK-222ENST00000532751 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
PTPRK-222ENST00000532751 DNAAF5Q86Y56 855 aa22.63■■□□□ 1.21
PTPRK-222ENST00000532751 CNGA4Q8IV77 575 aa22.63■■□□□ 1.21
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