RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532321.1

CKAP5-211, Transcript of cytoskeleton associated protein 5, humanhuman

TSL 4

Gene CKAP5, Length 586 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5-211ENST00000532321 C1orf228Q6PIY5 440 aa5.5□□□□□ -1.53
CKAP5-211ENST00000532321 CENPUQ71F23 418 aa5.5□□□□□ -1.53
CKAP5-211ENST00000532321 TADA2BQ86TJ2 420 aa5.5□□□□□ -1.53
CKAP5-211ENST00000532321 FAM131BQ86XD5 332 aa5.5□□□□□ -1.53
CKAP5-211ENST00000532321 CEP57Q86XR8 500 aa5.5□□□□□ -1.53
CKAP5-211ENST00000532321 LRRC49Q8IUZ0 686 aa5.5□□□□□ -1.53
CKAP5-211ENST00000532321 PGBD3Q8N328 593 aa5.5□□□□□ -1.53
CKAP5-211ENST00000532321 ZNF276Q8N554 614 aa5.5□□□□□ -1.53
CKAP5-211ENST00000532321 LZTR1Q8N653 840 aa5.5□□□□□ -1.53
CKAP5-211ENST00000532321 PQLC3Q8N755 202 aa5.5□□□□□ -1.53
CKAP5-211ENST00000532321 GALNT6Q8NCL4 622 aa5.5□□□□□ -1.53
CKAP5-211ENST00000532321 PIK3R5Q8WYR1 880 aa5.5□□□□□ -1.53
CKAP5-211ENST00000532321 RNF34Q969K3 372 aa5.5□□□□□ -1.53
CKAP5-211ENST00000532321 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
CKAP5-211ENST00000532321 ABHD17AQ96GS6 310 aa5.5□□□□□ -1.53
CKAP5-211ENST00000532321 SCLYQ96I15 445 aa5.5□□□□□ -1.53
CKAP5-211ENST00000532321 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa5.5□□□□□ -1.53
CKAP5-211ENST00000532321 ZNF558Q96NG5 402 aa5.5□□□□□ -1.53
CKAP5-211ENST00000532321 SERPINB11Q96P15 392 aa5.5□□□□□ -1.53
CKAP5-211ENST00000532321 CSPG4P5Q96PW8 444 aa5.5□□□□□ -1.53
CKAP5-211ENST00000532321 HAPLN3Q96S86 360 aa5.5□□□□□ -1.53
CKAP5-211ENST00000532321 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
CKAP5-211ENST00000532321 TMEM121Q9BTD3 319 aa5.5□□□□□ -1.53
CKAP5-211ENST00000532321 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa5.5□□□□□ -1.53
CKAP5-211ENST00000532321 FAM204AQ9H8W3 233 aa5.5□□□□□ -1.53
CKAP5-211ENST00000532321 TMBIM4Q9HC24 238 aa5.5□□□□□ -1.53
CKAP5-211ENST00000532321 TMLHEQ9NVH6 421 aa5.5□□□□□ -1.53
CKAP5-211ENST00000532321 DDIT4Q9NX09 232 aa5.5□□□□□ -1.53
CKAP5-211ENST00000532321 MTMR10Q9NXD2 777 aa5.5□□□□□ -1.53
CKAP5-211ENST00000532321 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa5.5□□□□□ -1.53
CKAP5-211ENST00000532321 CLIC5Q9NZA1 410 aa5.5□□□□□ -1.53
CKAP5-211ENST00000532321 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
CKAP5-211ENST00000532321 VPS18Q9P253 973 aa5.5□□□□□ -1.53
CKAP5-211ENST00000532321 FNIP2Q9P278 1114 aa5.5□□□□□ -1.53
CKAP5-211ENST00000532321 DNAJB4Q9UDY4 337 aa5.5□□□□□ -1.53
CKAP5-211ENST00000532321 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa5.5□□□□□ -1.53
CKAP5-211ENST00000532321 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa5.5□□□□□ -1.53
CKAP5-211ENST00000532321 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa5.5□□□□□ -1.53
CKAP5-211ENST00000532321 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa5.5□□□□□ -1.53
CKAP5-211ENST00000532321 NFS1Q9Y697 457 aa5.5□□□□□ -1.53
CKAP5-211ENST00000532321 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
CKAP5-211ENST00000532321 TTC3P53804 2025 aa5.49□□□□□ -1.53
CKAP5-211ENST00000532321 FAM92AA1XBS5 289 aa5.49□□□□□ -1.53
CKAP5-211ENST00000532321 A6NJY4 79 aa5.49□□□□□ -1.53
CKAP5-211ENST00000532321 H3BQF6 201 aa5.49□□□□□ -1.53
CKAP5-211ENST00000532321 CHADO15335 359 aa5.49□□□□□ -1.53
CKAP5-211ENST00000532321 KCNN4O15554 427 aa5.49□□□□□ -1.53
CKAP5-211ENST00000532321 PSMD3O43242 534 aa5.49□□□□□ -1.53
CKAP5-211ENST00000532321 RIPK2O43353 540 aa5.49□□□□□ -1.53
CKAP5-211ENST00000532321 GCATO75600 419 aa5.49□□□□□ -1.53
CKAP5-211ENST00000532321 SPAG6O75602 509 aa5.49□□□□□ -1.53
CKAP5-211ENST00000532321 IGLV3-25P01717 112 aa5.49□□□□□ -1.53
CKAP5-211ENST00000532321 GSTA2P09210 222 aa5.49□□□□□ -1.53
CKAP5-211ENST00000532321 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
CKAP5-211ENST00000532321 CPB1P15086 417 aa5.49□□□□□ -1.53
CKAP5-211ENST00000532321 RAG1P15918 1043 aa5.49□□□□□ -1.53
CKAP5-211ENST00000532321 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
CKAP5-211ENST00000532321 LAG3P18627 525 aa5.49□□□□□ -1.53
CKAP5-211ENST00000532321 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
CKAP5-211ENST00000532321 AMPD1P23109 780 aa5.49□□□□□ -1.53
CKAP5-211ENST00000532321 YWHAQP27348 245 aa5.49□□□□□ -1.53
CKAP5-211ENST00000532321 CCR1P32246 355 aa5.49□□□□□ -1.53
CKAP5-211ENST00000532321 PHBP35232 272 aa5.49□□□□□ -1.53
CKAP5-211ENST00000532321 PPM1AP35813 382 aa5.49□□□□□ -1.53
CKAP5-211ENST00000532321 FDFT1P37268 417 aa5.49□□□□□ -1.53
CKAP5-211ENST00000532321 MAGEA4P43358 317 aa5.49□□□□□ -1.53
CKAP5-211ENST00000532321 MAGEA6P43360 314 aa5.49□□□□□ -1.53
CKAP5-211ENST00000532321 GLUD2P49448 558 aa5.49□□□□□ -1.53
CKAP5-211ENST00000532321 VPS41P49754 854 aa5.49□□□□□ -1.53
CKAP5-211ENST00000532321 CACNA2D1P54289 1103 aa5.49□□□□□ -1.53
CKAP5-211ENST00000532321 TPI1P60174 286 aa5.49□□□□□ -1.53
CKAP5-211ENST00000532321 CTBSQ01459 385 aa5.49□□□□□ -1.53
CKAP5-211ENST00000532321 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
CKAP5-211ENST00000532321 CREMQ03060 361 aa5.49□□□□□ -1.53
CKAP5-211ENST00000532321 SLC29A2Q14542 456 aa5.49□□□□□ -1.53
CKAP5-211ENST00000532321 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
CKAP5-211ENST00000532321 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
CKAP5-211ENST00000532321 CA9Q16790 459 aa5.49□□□□□ -1.53
CKAP5-211ENST00000532321 KRT71Q3SY84 523 aa5.49□□□□□ -1.53
CKAP5-211ENST00000532321 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
CKAP5-211ENST00000532321 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
CKAP5-211ENST00000532321 SLC8B1Q6J4K2 584 aa5.49□□□□□ -1.53
CKAP5-211ENST00000532321 MFSD5Q6N075 450 aa5.49□□□□□ -1.53
CKAP5-211ENST00000532321 KIAA1841Q6NSI8 718 aa5.49□□□□□ -1.53
CKAP5-211ENST00000532321 MSANTD2Q6P1R3 559 aa5.49□□□□□ -1.53
CKAP5-211ENST00000532321 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa5.49□□□□□ -1.53
CKAP5-211ENST00000532321 RFX8Q6ZV50 586 aa5.49□□□□□ -1.53
CKAP5-211ENST00000532321 HFE2Q6ZVN8 426 aa5.49□□□□□ -1.53
CKAP5-211ENST00000532321 BHLHA9Q7RTU4 235 aa5.49□□□□□ -1.53
CKAP5-211ENST00000532321 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa5.49□□□□□ -1.53
CKAP5-211ENST00000532321 DEFB128Q7Z7B8 93 aa5.49□□□□□ -1.53
CKAP5-211ENST00000532321 CCDC25Q86WR0 208 aa5.49□□□□□ -1.53
CKAP5-211ENST00000532321 UNC45BQ8IWX7 931 aa5.49□□□□□ -1.53
CKAP5-211ENST00000532321 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
CKAP5-211ENST00000532321 PDIK1LQ8N165 341 aa5.49□□□□□ -1.53
CKAP5-211ENST00000532321 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
CKAP5-211ENST00000532321 CCDC185Q8N715 623 aa5.49□□□□□ -1.53
CKAP5-211ENST00000532321 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa5.49□□□□□ -1.53
CKAP5-211ENST00000532321 FAM71DQ8N9W8 422 aa5.49□□□□□ -1.53
CKAP5-211ENST00000532321 PDZD8Q8NEN9 1154 aa5.49□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22 ms