RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517316.1

IGHVII-40-1-201, Transcript of immunoglobulin heavy variable (II)-40-1 (pseudogene), humanhuman

BASIC

Gene IGHVII-40-1, Length 58 nt, Biotype IG V pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP1.14□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP1.14□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 KAT2BQ92831 832 aa1.14□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP1.14□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP1.14□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FAM227BQ96M60 508 aa1.14□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP1.14□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 HTATIP2Q9BUP3 242 aa1.14□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP1.14□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 B3GNT5Q9BYG0 378 aa1.14□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TASP1Q9H6P5 420 aa1.14□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP1.14□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 HDAC9Q9UKV0 1011 aa1.14□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CAPN11Q9UMQ6 739 aa1.14□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GAB2Q9UQC2 676 aa1.14□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RAI2Q9Y5P3 530 aa1.14□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa1.13□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 AQP7P3A6NL99 342 aa1.13□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 A6NNZ2 444 aa1.13□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TULP2O00295 520 aa1.13□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LIASO43766 372 aa1.13□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SNX2O60749 519 aa1.13□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 OFD1O75665 1012 aa1.13□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TUSC2O75896 110 aa1.13□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CNTN5O94779 1100 aa1.13□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FGF5P12034 268 aa1.13□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CHRNB2P17787 502 aa1.13□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GM2AP17900 193 aa1.13□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 THPOP40225 353 aa1.13□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TROAPQ12815 778 aa1.13□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PKP1Q13835 747 aa1.13□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 KIF19Q2TAC6 998 aa1.13□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP1.13□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP1.13□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TMEM196Q5HYL7 178 aa1.13□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TTC39AQ5SRH9 613 aa1.13□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LCE1CQ5T751 118 aa1.13□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LCE1BQ5T7P3 118 aa1.13□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DCAF12L2Q5VW00 463 aa1.13□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa1.13□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TMEM71Q6P5X7 295 aa1.13□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LRIG3Q6UXM1 1119 aa1.13□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa1.13□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 UNC13DQ70J99 1090 aa1.13□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa1.13□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 IL17RCQ8NAC3 791 aa1.13□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 OR52L2PQ8NGH6 319 aa1.13□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 IP6K1Q92551 441 aa1.13□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP1.13□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 IGSF21Q96ID5 467 aa1.13□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa1.13□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP1.13□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TMX1Q9H3N1 280 aa1.13□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FAM83DQ9H4H8 585 aa1.13□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZNF304Q9HCX3 659 aa1.13□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TXNRD2Q9NNW7 524 aa1.13□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP1.13□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP1.13□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 IP6K2Q9UHH9 426 aa1.13□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP1.13□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP1.12□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa1.12□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP1.12□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LINC01553A4QN01 128 aa1.12□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DPPA5A6NC42 116 aa1.12□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GAGE12JA6NER3 117 aa1.12□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CAPN8A6NHC0 703 aa1.12□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PRAC2D3DTV9 90 aa1.12□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa1.12□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 F8W8V4 182 aa1.12□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DHHO43323 396 aa1.12□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP1.12□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SOX30O94993 753 aa1.12□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PEPDP12955 493 aa1.12□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MATN1P21941 496 aa1.12□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SLC8A1P32418 973 aa1.12□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TNFSF8P32971 234 aa1.12□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NOVP48745 357 aa1.12□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CARSP49589 748 aaKnown RBP1.12□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ATP12AP54707 1039 aa1.12□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SLC37A1P57057 533 aa1.12□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 KRTAP10-1P60331 282 aa1.12□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZP1P60852 638 aa1.12□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TUBA1BP68363 451 aa1.12□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FMO1Q01740 532 aa1.12□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 BFSP2Q13515 415 aa1.12□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PLCB4Q15147 1175 aa1.12□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP1.12□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RETSATQ6NUM9 610 aa1.12□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ACSM6Q6P461 480 aa1.12□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SUSD1Q6UWL2 747 aa1.12□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DSTYKQ6XUX3 929 aa1.12□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MAEAQ7L5Y9 396 aa1.12□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MDGA2Q7Z553 956 aa1.12□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FJX1Q86VR8 437 aa1.12□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa1.12□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP1.12□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa1.12□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SLC35G2Q8TBE7 412 aa1.12□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP1.12□□□□□ -2.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.9 ms