RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504440.1

NPHP3-AS1-202, NPHP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NPHP3-AS1, Length 2,507 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 UNC5BQ8IZJ1 945 aa6.8□□□□□ -1.32
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 MPP5Q8N3R9 675 aa6.8□□□□□ -1.32
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 LILRB2Q8N423 598 aa6.8□□□□□ -1.32
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 IL22RA1Q8N6P7 574 aa6.8□□□□□ -1.32
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SH3TC2Q8TF17 1288 aa6.8□□□□□ -1.32
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SLC44A1Q8WWI5 657 aa6.8□□□□□ -1.32
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 NLRP4Q96MN2 994 aa6.8□□□□□ -1.32
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CYTH2Q99418 400 aa6.8□□□□□ -1.32
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 MMP19Q99542 508 aa6.8□□□□□ -1.32
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TEX13BQ9BXU2 312 aa6.8□□□□□ -1.32
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 VPS11Q9H270 941 aa6.8□□□□□ -1.32
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PIDD1Q9HB75 910 aa6.8□□□□□ -1.32
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 USP29Q9HBJ7 922 aa6.8□□□□□ -1.32
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 GGA3Q9NZ52 723 aa6.8□□□□□ -1.32
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SLC17A6Q9P2U8 582 aa6.8□□□□□ -1.32
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa6.8□□□□□ -1.32
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa6.8□□□□□ -1.32
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 HEY1Q9Y5J3 304 aa6.8□□□□□ -1.32
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa6.8□□□□□ -1.32
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CAPN9O14815 690 aa6.8□□□□□ -1.32
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 MCF2LO15068 1137 aa6.8□□□□□ -1.32
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TM9SF1O15321 606 aa6.8□□□□□ -1.32
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 KCNN4O15554 427 aa6.8□□□□□ -1.32
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 MAFO75444 373 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ARIH2O95376 493 aa6.8□□□□□ -1.32
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ENO1P06733 434 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 INHBAP08476 426 aa6.8□□□□□ -1.32
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 KRT7P08729 469 aa6.8□□□□□ -1.32
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ATP6V1C1P21283 382 aa6.8□□□□□ -1.32
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 IL4RP24394 825 aa6.8□□□□□ -1.32
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 RBL1P28749 1068 aa6.8□□□□□ -1.32
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 GRIA1P42261 906 aa6.8□□□□□ -1.32
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 RGS7P49802 495 aa6.8□□□□□ -1.32
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 RASSF2P50749 326 aa6.8□□□□□ -1.32
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SLC18A2Q05940 514 aa6.8□□□□□ -1.32
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 KCNJ11Q14654 390 aa6.8□□□□□ -1.32
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CA9Q16790 459 aa6.8□□□□□ -1.32
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 HSDL1Q3SXM5 330 aa6.8□□□□□ -1.32
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ELOA3BQ3SY89 546 aa6.8□□□□□ -1.32
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SNX30Q5VWJ9 437 aa6.8□□□□□ -1.32
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SCYL2Q6P3W7 929 aa6.8□□□□□ -1.32
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 POLNQ7Z5Q5 900 aa6.8□□□□□ -1.32
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 KBTBD2Q8IY47 623 aa6.8□□□□□ -1.32
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP6.8□□□□□ -1.32
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 VPS52Q8N1B4 723 aa6.8□□□□□ -1.32
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 C12orf29Q8N999 325 aa6.8□□□□□ -1.32
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ELOA3Q8NG57 546 aa6.8□□□□□ -1.32
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CCDC110Q8TBZ0 833 aa6.8□□□□□ -1.32
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 GPBAR1Q8TDU6 330 aa6.8□□□□□ -1.32
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 DNAJC9Q8WXX5 260 aa6.8□□□□□ -1.32
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ZNF333Q96JL9 665 aa6.8□□□□□ -1.32
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CDHR1Q96JP9 859 aa6.8□□□□□ -1.32
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa6.8□□□□□ -1.32
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SAR1AQ9NR31 198 aa6.8□□□□□ -1.32
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PICK1Q9NRD5 415 aa6.8□□□□□ -1.32
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TTLL3Q9Y4R7 772 aa6.8□□□□□ -1.32
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CORINQ9Y5Q5 1042 aa6.8□□□□□ -1.32
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 LACTBL1A8MY62 500 aa6.79□□□□□ -1.32
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa6.79□□□□□ -1.32
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 LINC01387J3KSC0 135 aa6.79□□□□□ -1.32
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa6.79□□□□□ -1.32
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 M0QYV0 167 aa6.79□□□□□ -1.32
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CCDC22O60826 627 aa6.79□□□□□ -1.32
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 APOC2P02655 101 aa6.79□□□□□ -1.32
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 HMGCRP04035 888 aa6.79□□□□□ -1.32
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ITGB3P05106 788 aa6.79□□□□□ -1.32
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CLCN3P51790 818 aa6.79□□□□□ -1.32
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ROR1Q01973 937 aa6.79□□□□□ -1.32
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TAP1Q03518 808 aa6.79□□□□□ -1.32
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 KDSRQ06136 332 aa6.79□□□□□ -1.32
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 GRIK3Q13003 919 aa6.79□□□□□ -1.32
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 INPP5AQ14642 412 aa6.79□□□□□ -1.32
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CCDC6Q16204 474 aa6.79□□□□□ -1.32
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa6.79□□□□□ -1.32
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 RXFP2Q8WXD0 754 aa6.79□□□□□ -1.32
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 COPS5Q92905 334 aa6.79□□□□□ -1.32
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 APOPT1Q96IL0 206 aa6.79□□□□□ -1.32
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ADPGKQ9BRR6 497 aa6.79□□□□□ -1.32
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CXCL16Q9H2A7 254 aa6.79□□□□□ -1.32
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 DCLRE1BQ9H816 532 aa6.79□□□□□ -1.32
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 NRBP2Q9NSY0 501 aa6.79□□□□□ -1.32
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa6.79□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.1 ms