RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498524.5

ANKRD28-213, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 2

Gene ANKRD28, Length 4,289 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-213ENST00000498524 RPA1P27694 616 aa4.05□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 NBL1P41271 181 aa4.05□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 STT3AP46977 705 aa4.05□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 AP2B1P63010 937 aa4.05□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 HYAL1Q12794 435 aa4.05□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 ORC1Q13415 861 aa4.05□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 LPIN1Q14693 890 aa4.05□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP4.05□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 C2orf27AQ580R0 203 aa4.05□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa4.05□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa4.05□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 LYSMD4Q5XG99 296 aa4.05□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa4.05□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 MZT2BQ6NZ67 158 aa4.05□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 C6orf89Q6UWU4 347 aa4.05□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 MAEAQ7L5Y9 396 aa4.05□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP4.05□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 CLEC10AQ8IUN9 316 aa4.05□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP4.05□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 KIRREL3Q8IZU9 778 aa4.05□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 DCLK2Q8N568 766 aa4.05□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 TNIP2Q8NFZ5 429 aa4.05□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 MIPOL1Q8TD10 442 aa4.05□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP4.05□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 PIGOQ8TEQ8 1089 aa4.05□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 PARD3BQ8TEW8 1205 aa4.05□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 GIMAP1Q8WWP7 306 aa4.05□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 OTUB2Q96DC9 234 aa4.05□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 DTNBP1Q96EV8 351 aa4.05□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 MCRS1Q96EZ8 462 aa4.05□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 TBATAQ96M53 351 aa4.05□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 FGD4Q96M96 766 aa4.05□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa4.05□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa4.05□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 TUFT1Q9NNX1 390 aa4.05□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 IL17RBQ9NRM6 502 aa4.05□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 ABCF3Q9NUQ8 709 aa4.05□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 WHRNQ9P202 907 aa4.05□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 MYH2Q9UKX2 1941 aa4.05□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 VSTM5A8MXK1 200 aa4.05□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 SLC30A4O14863 429 aa4.05□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 CYTH3O43739 400 aa4.05□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 CCDC22O60826 627 aa4.05□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 BAG2O95816 211 aa4.05□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 ITGB1P05556 798 aa4.05□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 GSTA2P09210 222 aa4.05□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 TRIM49P0CI25 452 aa4.05□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 TRIM49CP0CI26 452 aa4.05□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 MYBP10242 640 aa4.05□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 PLS3P13797 630 aa4.05□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 COMTP21964 271 aa4.05□□□□□ -1.76
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ANKRD28-213ENST00000498524 TAF6P49848 677 aa4.05□□□□□ -1.76
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ANKRD28-213ENST00000498524 LLGL1Q15334 1064 aa4.05□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 TRADDQ15628 312 aa4.05□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 FAM180BQ6P0A1 224 aa4.05□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 USP17L6PQ6QN14 398 aa4.05□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 OLFML1Q6UWY5 402 aa4.05□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 RASGEF1CQ8N431 466 aa4.05□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 SUSD6Q92537 303 aa4.05□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP4.05□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 CCDC127Q96BQ5 260 aa4.05□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 CFAP36Q96G28 342 aa4.05□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 HES6Q96HZ4 224 aa4.05□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 RILPQ96NA2 401 aa4.05□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 THAP2Q9H0W7 228 aa4.05□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP4.05□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 Q9H521 79 aa4.05□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 SAYSD1Q9NPB0 183 aa4.05□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 OSGEPQ9NPF4 335 aa4.05□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 DEC1Q9P2X7 70 aa4.05□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 ZNF180Q9UJW8 692 aa4.05□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 SLC6A14Q9UN76 642 aa4.05□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 A0A0G2JND7 137 aa4.04□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP4.04□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 NDUFB5O43674 189 aa4.04□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP4.04□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 ZNF623O75123 536 aa4.04□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 KATNA1O75449 491 aa4.04□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP4.04□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP4.04□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 INHBAP08476 426 aa4.04□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 VHLP40337 213 aa4.04□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 VAMP7P51809 220 aa4.04□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 BPIFB3P59826 476 aa4.04□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP4.04□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 CUL3Q13618 768 aa4.04□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 CCINQ13939 588 aa4.04□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 ACAP1Q15027 740 aa4.04□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 DUOXA1Q1HG43 343 aa4.04□□□□□ -1.76
ANKRD28-213ENST00000498524 FAM46CQ5VWP2 391 aa4.04□□□□□ -1.76
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