RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488734.5

GIGYF2-241, Transcript of GRB10 interacting GYF protein 2, humanhuman

TSL 3

Gene GIGYF2, Length 796 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIGYF2-241ENST00000488734 BRF2Q9HAW0 419 aa5.7□□□□□ -1.5
GIGYF2-241ENST00000488734 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
GIGYF2-241ENST00000488734 MOCS1Q9NZB8 636 aa5.7□□□□□ -1.5
GIGYF2-241ENST00000488734 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
GIGYF2-241ENST00000488734 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
GIGYF2-241ENST00000488734 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
GIGYF2-241ENST00000488734 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa5.7□□□□□ -1.5
GIGYF2-241ENST00000488734 PSAT1Q9Y617 370 aa5.7□□□□□ -1.5
GIGYF2-241ENST00000488734 NRXN2Q9P2S2 1712 aa5.7□□□□□ -1.5
GIGYF2-241ENST00000488734 SLX4Q8IY92 1834 aa5.69□□□□□ -1.5
GIGYF2-241ENST00000488734 RTL1A6NKG5 1358 aa5.69□□□□□ -1.5
GIGYF2-241ENST00000488734 INSRP06213 1382 aa5.69□□□□□ -1.5
GIGYF2-241ENST00000488734 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa5.69□□□□□ -1.5
GIGYF2-241ENST00000488734 NDC80O14777 642 aa5.69□□□□□ -1.5
GIGYF2-241ENST00000488734 CAPN9O14815 690 aa5.69□□□□□ -1.5
GIGYF2-241ENST00000488734 VILLO15195 856 aa5.69□□□□□ -1.5
GIGYF2-241ENST00000488734 SLU7O95391 586 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
GIGYF2-241ENST00000488734 ANXA1P04083 346 aa5.69□□□□□ -1.5
GIGYF2-241ENST00000488734 IL1R1P14778 569 aa5.69□□□□□ -1.5
GIGYF2-241ENST00000488734 NPPBP16860 134 aa5.69□□□□□ -1.5
GIGYF2-241ENST00000488734 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
GIGYF2-241ENST00000488734 KRT2P35908 639 aa5.69□□□□□ -1.5
GIGYF2-241ENST00000488734 GZMKP49863 264 aa5.69□□□□□ -1.5
GIGYF2-241ENST00000488734 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
GIGYF2-241ENST00000488734 RAC3P60763 192 aa5.69□□□□□ -1.5
GIGYF2-241ENST00000488734 LRRC74AQ0VAA2 488 aa5.69□□□□□ -1.5
GIGYF2-241ENST00000488734 SP140Q13342 867 aa5.69□□□□□ -1.5
GIGYF2-241ENST00000488734 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
GIGYF2-241ENST00000488734 ZNF124Q15973 351 aa5.69□□□□□ -1.5
GIGYF2-241ENST00000488734 WSCD2Q2TBF2 565 aa5.69□□□□□ -1.5
GIGYF2-241ENST00000488734 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
GIGYF2-241ENST00000488734 RRAGBQ5VZM2 374 aa5.69□□□□□ -1.5
GIGYF2-241ENST00000488734 AFMIDQ63HM1 303 aa5.69□□□□□ -1.5
GIGYF2-241ENST00000488734 IYDQ6PHW0 289 aa5.69□□□□□ -1.5
GIGYF2-241ENST00000488734 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa5.69□□□□□ -1.5
GIGYF2-241ENST00000488734 UNC13DQ70J99 1090 aa5.69□□□□□ -1.5
GIGYF2-241ENST00000488734 MICU3Q86XE3 530 aa5.69□□□□□ -1.5
GIGYF2-241ENST00000488734 EGFL6Q8IUX8 553 aa5.69□□□□□ -1.5
GIGYF2-241ENST00000488734 TAGAPQ8N103 731 aa5.69□□□□□ -1.5
GIGYF2-241ENST00000488734 GPC2Q8N158 579 aa5.69□□□□□ -1.5
GIGYF2-241ENST00000488734 TMEM57Q8N5G2 664 aa5.69□□□□□ -1.5
GIGYF2-241ENST00000488734 ZNF540Q8NDQ6 660 aa5.69□□□□□ -1.5
GIGYF2-241ENST00000488734 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa5.69□□□□□ -1.5
GIGYF2-241ENST00000488734 CUL5Q93034 780 aa5.69□□□□□ -1.5
GIGYF2-241ENST00000488734 PTP4A1Q93096 173 aa5.69□□□□□ -1.5
GIGYF2-241ENST00000488734 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
GIGYF2-241ENST00000488734 RTKNQ9BST9 563 aa5.69□□□□□ -1.5
GIGYF2-241ENST00000488734 MAGEB5Q9BZ81 275 aa5.69□□□□□ -1.5
GIGYF2-241ENST00000488734 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
GIGYF2-241ENST00000488734 SMURF2Q9HAU4 748 aa5.69□□□□□ -1.5
GIGYF2-241ENST00000488734 IL23AQ9NPF7 189 aa5.69□□□□□ -1.5
GIGYF2-241ENST00000488734 DECR2Q9NUI1 292 aa5.69□□□□□ -1.5
GIGYF2-241ENST00000488734 LPAR3Q9UBY5 353 aa5.69□□□□□ -1.5
GIGYF2-241ENST00000488734 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa5.69□□□□□ -1.5
GIGYF2-241ENST00000488734 PCDHA6Q9UN73 950 aa5.69□□□□□ -1.5
GIGYF2-241ENST00000488734 DUSP12Q9UNI6 340 aa5.69□□□□□ -1.5
GIGYF2-241ENST00000488734 DTNAQ9Y4J8 743 aa5.69□□□□□ -1.5
GIGYF2-241ENST00000488734 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
GIGYF2-241ENST00000488734 CENPFP49454 3210 aa5.69□□□□□ -1.5
GIGYF2-241ENST00000488734 CEP290O15078 2479 aa5.69□□□□□ -1.5
GIGYF2-241ENST00000488734 CARMIL3Q8ND23 1372 aa5.68□□□□□ -1.5
GIGYF2-241ENST00000488734 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa5.68□□□□□ -1.5
GIGYF2-241ENST00000488734 PMS2P1A4D2B8 440 aa5.68□□□□□ -1.5
GIGYF2-241ENST00000488734 ERVV-2B6SEH9 535 aa5.68□□□□□ -1.5
GIGYF2-241ENST00000488734 PTGES3LE9PB15 166 aa5.68□□□□□ -1.5
GIGYF2-241ENST00000488734 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
GIGYF2-241ENST00000488734 F2RL2O00254 374 aa5.68□□□□□ -1.5
GIGYF2-241ENST00000488734 TEX33O43247 280 aa5.68□□□□□ -1.5
GIGYF2-241ENST00000488734 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
GIGYF2-241ENST00000488734 F9P00740 461 aa5.68□□□□□ -1.5
GIGYF2-241ENST00000488734 AFPP02771 609 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
GIGYF2-241ENST00000488734 RAP2AP10114 183 aa5.68□□□□□ -1.5
GIGYF2-241ENST00000488734 PRDX5P30044 214 aa5.68□□□□□ -1.5
GIGYF2-241ENST00000488734 THPOP40225 353 aa5.68□□□□□ -1.5
GIGYF2-241ENST00000488734 RGS2P41220 211 aa5.68□□□□□ -1.5
GIGYF2-241ENST00000488734 ALDH1A3P47895 512 aa5.68□□□□□ -1.5
GIGYF2-241ENST00000488734 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
GIGYF2-241ENST00000488734 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa5.68□□□□□ -1.5
GIGYF2-241ENST00000488734 NT5DC1Q5TFE4 455 aa5.68□□□□□ -1.5
GIGYF2-241ENST00000488734 KLHL24Q6TFL4 600 aa5.68□□□□□ -1.5
GIGYF2-241ENST00000488734 CRTC1Q6UUV9 634 aa5.68□□□□□ -1.5
GIGYF2-241ENST00000488734 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
GIGYF2-241ENST00000488734 ZNF804AQ7Z570 1209 aa5.68□□□□□ -1.5
GIGYF2-241ENST00000488734 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa5.68□□□□□ -1.5
GIGYF2-241ENST00000488734 LURAP1LQ8IV03 231 aa5.68□□□□□ -1.5
GIGYF2-241ENST00000488734 GALNT4Q8N4A0 578 aa5.68□□□□□ -1.5
GIGYF2-241ENST00000488734 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa5.68□□□□□ -1.5
GIGYF2-241ENST00000488734 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa5.68□□□□□ -1.5
GIGYF2-241ENST00000488734 SHCBP1Q8NEM2 672 aa5.68□□□□□ -1.5
GIGYF2-241ENST00000488734 DENND1AQ8TEH3 1009 aa5.68□□□□□ -1.5
GIGYF2-241ENST00000488734 KIF1BPQ96EK5 621 aa5.68□□□□□ -1.5
GIGYF2-241ENST00000488734 CABS1Q96KC9 395 aa5.68□□□□□ -1.5
GIGYF2-241ENST00000488734 SNX27Q96L92 541 aa5.68□□□□□ -1.5
GIGYF2-241ENST00000488734 MYOCQ99972 504 aa5.68□□□□□ -1.5
GIGYF2-241ENST00000488734 TCF25Q9BQ70 676 aa5.68□□□□□ -1.5
GIGYF2-241ENST00000488734 FSD1Q9BTV5 496 aa5.68□□□□□ -1.5
GIGYF2-241ENST00000488734 ACAT2Q9BWD1 397 aa5.68□□□□□ -1.5
GIGYF2-241ENST00000488734 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
GIGYF2-241ENST00000488734 DNAI2Q9GZS0 605 aa5.68□□□□□ -1.5
GIGYF2-241ENST00000488734 USP44Q9H0E7 712 aa5.68□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.7 ms