RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481115.2

PKP4-211, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 5

Gene PKP4, Length 884 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-211ENST00000481115 ATG16L1Q676U5 607 aa7.36□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 CTRB2Q6GPI1 263 aa7.36□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 UNC5AQ6ZN44 842 aa7.36□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 IDO2Q6ZQW0 420 aa7.36□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 NLRX1Q86UT6 975 aa7.36□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 DGKHQ86XP1 1220 aa7.36□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 LACC1Q8IV20 430 aa7.36□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 FAM20CQ8IXL6 584 aa7.36□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 ZNF276Q8N554 614 aa7.36□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 MAGEB6Q8N7X4 407 aa7.36□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 LSMEM1Q8N8F7 131 aa7.36□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 KIAA0895Q8NCT3 520 aa7.36□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 PDZD8Q8NEN9 1154 aa7.36□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 GRPEL2Q8TAA5 225 aa7.36□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 TRIB2Q92519 343 aa7.36□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 GLG1Q92896 1179 aa7.36□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 CLIP3Q96DZ5 547 aa7.36□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 DCUN1D1Q96GG9 259 aa7.36□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 SNX18Q96RF0 628 aa7.36□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 SERPINI1Q99574 410 aa7.36□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa7.36□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 PACSIN1Q9BY11 444 aa7.36□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 RAB34Q9BZG1 259 aa7.36□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa7.36□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 TRIM31Q9BZY9 425 aa7.36□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 OR2B2Q9GZK3 357 aa7.36□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 SP140LQ9H930 580 aa7.36□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 KCNK13Q9HB14 408 aa7.36□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 MAN1C1Q9NR34 630 aa7.36□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 ARHGEF4Q9NR80 690 aa7.36□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 MRGBPQ9NV56 204 aa7.36□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 MKS1Q9NXB0 559 aa7.36□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 NPAP1Q9NZP6 1156 aa7.36□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 POLLQ9UGP5 575 aa7.36□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa7.36□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 AP4B1Q9Y6B7 739 aa7.36□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 ZNF804BA4D1E1 1349 aa7.35□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 FLT1P17948 1338 aa7.35□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa7.35□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 ISPDA4D126 451 aa7.35□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 LRRIQ4A6NIV6 560 aa7.35□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 H3BNH8 94 aa7.35□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 SLC22A2O15244 555 aa7.35□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 SPINT1O43278 529 aa7.35□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 RFPL1O75677 317 aa7.35□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 CRTAMO95727 393 aa7.35□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 CRYZL1O95825 349 aa7.35□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa7.35□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 POLR2MP0CAP2 368 aa7.35□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 RBP3P10745 1247 aa7.35□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 SCG2P13521 617 aa7.35□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 UCHL3P15374 230 aa7.35□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 CREB1P16220 341 aa7.35□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 PRKACBP22694 351 aa7.35□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 IL32P24001 234 aa7.35□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 ARNTP27540 789 aa7.35□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 CPOXP36551 454 aa7.35□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 PRELPP51888 382 aa7.35□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 ZNF132P52740 706 aa7.35□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 GALCP54803 685 aa7.35□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 PLAURQ03405 335 aa7.35□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 PTP4A2Q12974 167 aa7.35□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 DHCR24Q15392 516 aa7.35□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 GPR162Q16538 588 aa7.35□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 NFIL3Q16649 462 aa7.35□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 INSCQ1MX18 579 aa7.35□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 KLHL38Q2WGJ6 581 aa7.35□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 EFHC2Q5JST6 749 aa7.35□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 DCAF12L1Q5VU92 463 aa7.35□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 NANOGP8Q6NSW7 305 aa7.35□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 KIAA1211LQ6NV74 962 aa7.35□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa7.35□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 LIAT1Q6ZQX7 453 aa7.35□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa7.35□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 SULF2Q8IWU5 870 aa7.35□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 MEIOBQ8N635 442 aa7.35□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 PACRGLQ8N7B6 248 aa7.35□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 SIMC1Q8NDZ2 872 aa7.35□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 SLC35G2Q8TBE7 412 aa7.35□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 TBC1D15Q8TC07 691 aa7.35□□□□□ -1.23
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