RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477486.1

RBMS1-211, Transcript of RNA binding motif single stranded interacting protein 1, humanhuman

TSL 4

Gene RBMS1, Length 562 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBMS1-211ENST00000477486 UPK3BL1B0FP48 263 aa22.78■■□□□ 1.24
RBMS1-211ENST00000477486 UPK3BL2E5RIL1 263 aa22.78■■□□□ 1.24
RBMS1-211ENST00000477486 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
RBMS1-211ENST00000477486 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
RBMS1-211ENST00000477486 ABCB4P21439 1286 aa22.78■■□□□ 1.24
RBMS1-211ENST00000477486 TACR2P21452 398 aa22.78■■□□□ 1.24
RBMS1-211ENST00000477486 ACSL1P33121 698 aa22.78■■□□□ 1.24
RBMS1-211ENST00000477486 ZBTB16Q05516 673 aa22.78■■□□□ 1.24
RBMS1-211ENST00000477486 GRIK2Q13002 908 aa22.78■■□□□ 1.24
RBMS1-211ENST00000477486 TAF5Q15542 800 aa22.78■■□□□ 1.24
RBMS1-211ENST00000477486 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
RBMS1-211ENST00000477486 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
RBMS1-211ENST00000477486 OR6B2Q6IFH4 312 aa22.78■■□□□ 1.24
RBMS1-211ENST00000477486 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa22.78■■□□□ 1.24
RBMS1-211ENST00000477486 PIP4P1Q86T03 277 aa22.78■■□□□ 1.24
RBMS1-211ENST00000477486 SHC3Q92529 594 aa22.78■■□□□ 1.24
RBMS1-211ENST00000477486 TTC17Q96AE7 1141 aa22.78■■□□□ 1.24
RBMS1-211ENST00000477486 PDCL3Q9H2J4 239 aa22.78■■□□□ 1.24
RBMS1-211ENST00000477486 F5H5T6 163 aa22.77■■□□□ 1.24
RBMS1-211ENST00000477486 GRAP2O75791 330 aa22.77■■□□□ 1.24
RBMS1-211ENST00000477486 KRT37O76014 449 aa22.77■■□□□ 1.24
RBMS1-211ENST00000477486 SLC2A3P11169 496 aa22.77■■□□□ 1.24
RBMS1-211ENST00000477486 SLC14A1Q13336 389 aa22.77■■□□□ 1.24
RBMS1-211ENST00000477486 MAN2A1Q16706 1144 aa22.77■■□□□ 1.24
RBMS1-211ENST00000477486 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa22.77■■□□□ 1.24
RBMS1-211ENST00000477486 FSCBQ5H9T9 825 aa22.77■■□□□ 1.24
RBMS1-211ENST00000477486 PITRM1Q5JRX3 1037 aa22.77■■□□□ 1.24
RBMS1-211ENST00000477486 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
RBMS1-211ENST00000477486 DEFB106AQ8N104 65 aa22.77■■□□□ 1.24
RBMS1-211ENST00000477486 CPXM1Q96SM3 734 aa22.77■■□□□ 1.24
RBMS1-211ENST00000477486 PCED1AQ9H1Q7 454 aa22.77■■□□□ 1.24
RBMS1-211ENST00000477486 CLSTN2Q9H4D0 955 aa22.77■■□□□ 1.24
RBMS1-211ENST00000477486 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
RBMS1-211ENST00000477486 DDIT4Q9NX09 232 aa22.77■■□□□ 1.24
RBMS1-211ENST00000477486 DACH1Q9UI36 760 aa22.77■■□□□ 1.24
RBMS1-211ENST00000477486 ERVW-1Q9UQF0 538 aa22.77■■□□□ 1.24
RBMS1-211ENST00000477486 KCNU1A8MYU2 1149 aa22.76■■□□□ 1.23
RBMS1-211ENST00000477486 SH3BP5O60239 455 aa22.76■■□□□ 1.23
RBMS1-211ENST00000477486 FSBPO95073 299 aa22.76■■□□□ 1.23
RBMS1-211ENST00000477486 SEMA4FO95754 770 aa22.76■■□□□ 1.23
RBMS1-211ENST00000477486 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
RBMS1-211ENST00000477486 CD59P13987 128 aa22.76■■□□□ 1.23
RBMS1-211ENST00000477486 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
RBMS1-211ENST00000477486 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
RBMS1-211ENST00000477486 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
RBMS1-211ENST00000477486 WDTC1Q8N5D0 677 aa22.76■■□□□ 1.23
RBMS1-211ENST00000477486 LMLNQ96KR4 655 aa22.76■■□□□ 1.23
RBMS1-211ENST00000477486 SCNM1Q9BWG6 230 aa22.76■■□□□ 1.23
RBMS1-211ENST00000477486 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
RBMS1-211ENST00000477486 PCDHGC3Q9UN70 934 aa22.76■■□□□ 1.23
RBMS1-211ENST00000477486 PCNX2A6NKB5 2137 aa22.76■■□□□ 1.23
RBMS1-211ENST00000477486 CHD8Q9HCK8 2581 aa22.76■■□□□ 1.23
RBMS1-211ENST00000477486 PCDH15Q96QU1 1955 aa22.76■■□□□ 1.23
RBMS1-211ENST00000477486 CACNA1BQ00975 2339 aa22.75■■□□□ 1.23
RBMS1-211ENST00000477486 FAM47DPA6NHR8 397 aa22.75■■□□□ 1.23
RBMS1-211ENST00000477486 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
RBMS1-211ENST00000477486 SIN3BO75182 1162 aa22.75■■□□□ 1.23
RBMS1-211ENST00000477486 GLI1P08151 1106 aa22.75■■□□□ 1.23
RBMS1-211ENST00000477486 CCR1P32246 355 aa22.75■■□□□ 1.23
RBMS1-211ENST00000477486 NNMTP40261 264 aa22.75■■□□□ 1.23
RBMS1-211ENST00000477486 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
RBMS1-211ENST00000477486 ECT2LQ008S8 904 aa22.75■■□□□ 1.23
RBMS1-211ENST00000477486 NME3Q13232 169 aa22.75■■□□□ 1.23
RBMS1-211ENST00000477486 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
RBMS1-211ENST00000477486 VWA3BQ502W6 1294 aa22.75■■□□□ 1.23
RBMS1-211ENST00000477486 LRSAM1Q6UWE0 723 aa22.75■■□□□ 1.23
RBMS1-211ENST00000477486 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
RBMS1-211ENST00000477486 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
RBMS1-211ENST00000477486 CAMK1GQ96NX5 476 aa22.75■■□□□ 1.23
RBMS1-211ENST00000477486 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa22.75■■□□□ 1.23
RBMS1-211ENST00000477486 NDST4Q9H3R1 872 aa22.75■■□□□ 1.23
RBMS1-211ENST00000477486 GAREM1Q9H706 876 aa22.75■■□□□ 1.23
RBMS1-211ENST00000477486 SGK2Q9HBY8 427 aa22.75■■□□□ 1.23
RBMS1-211ENST00000477486 EPG5Q9HCE0 2579 aa22.74■■□□□ 1.23
RBMS1-211ENST00000477486 HSF2BPO75031 334 aa22.74■■□□□ 1.23
RBMS1-211ENST00000477486 CER1O95813 267 aa22.74■■□□□ 1.23
RBMS1-211ENST00000477486 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
RBMS1-211ENST00000477486 MATKP42679 507 aa22.74■■□□□ 1.23
RBMS1-211ENST00000477486 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
RBMS1-211ENST00000477486 NUMBP49757 651 aa22.74■■□□□ 1.23
RBMS1-211ENST00000477486 BPIFB4P59827 614 aa22.74■■□□□ 1.23
RBMS1-211ENST00000477486 RAPGEF1Q13905 1077 aa22.74■■□□□ 1.23
RBMS1-211ENST00000477486 TEAD4Q15561 434 aa22.74■■□□□ 1.23
RBMS1-211ENST00000477486 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
RBMS1-211ENST00000477486 RABGAP1LQ5R372 815 aa22.74■■□□□ 1.23
RBMS1-211ENST00000477486 IL27RAQ6UWB1 636 aa22.74■■□□□ 1.23
RBMS1-211ENST00000477486 SLC47A2Q86VL8 602 aa22.74■■□□□ 1.23
RBMS1-211ENST00000477486 APCDD1Q8J025 514 aa22.74■■□□□ 1.23
RBMS1-211ENST00000477486 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
RBMS1-211ENST00000477486 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
RBMS1-211ENST00000477486 OMDQ99983 421 aa22.74■■□□□ 1.23
RBMS1-211ENST00000477486 NUP62CLQ9H1M0 184 aa22.74■■□□□ 1.23
RBMS1-211ENST00000477486 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
RBMS1-211ENST00000477486 PLCB1Q9NQ66 1216 aa22.74■■□□□ 1.23
RBMS1-211ENST00000477486 ASNSD1Q9NWL6 643 aa22.74■■□□□ 1.23
RBMS1-211ENST00000477486 FBXL12Q9NXK8 326 aa22.74■■□□□ 1.23
RBMS1-211ENST00000477486 SCML1Q9UN30 329 aa22.74■■□□□ 1.23
RBMS1-211ENST00000477486 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
RBMS1-211ENST00000477486 A0A1B0GVT2 93 aa22.73■■□□□ 1.23
RBMS1-211ENST00000477486 TTC34A8MYJ7 566 aa22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 74 ms