RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476635.5

PRKCI-202, Transcript of protein kinase C iota, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRKCI, Length 3,650 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCI-202ENST00000476635 GBA3Q9H227 469 aa6.64□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 FAM204AQ9H8W3 233 aa6.64□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 PLAC1Q9HBJ0 212 aa6.64□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 PCSK1NQ9UHG2 260 aa6.64□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa6.64□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 E9PAM4 449 aa6.64□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 MAFKO60675 156 aa6.64□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 PAGE1O75459 146 aa6.64□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 URODP06132 367 aa6.64□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 OR4Q2P0C623 313 aa6.64□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 ERCC2P18074 760 aa6.64□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 PRKCHP24723 683 aa6.64□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 GCAP28676 217 aa6.64□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 KCNJ1P48048 391 aa6.64□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 PLK1P53350 603 aa6.64□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 CALCOCO2Q13137 446 aa6.64□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 PARP15Q460N3 678 aa6.64□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 NADSYN1Q6IA69 706 aa6.64□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 KDM7AQ6ZMT4 941 aa6.64□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 HTR3DQ70Z44 454 aa6.64□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 DEFB128Q7Z7B8 93 aa6.64□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 NPWQ8N729 165 aa6.64□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 SPPL3Q8TCT6 385 aa6.64□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 MZB1Q8WU39 189 aa6.64□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 FCRL5Q96RD9 977 aa6.64□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 HTATIP2Q9BUP3 242 aa6.64□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 HEMGNQ9BXL5 484 aa6.64□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 CASS4Q9NQ75 786 aa6.64□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 DDIT4Q9NX09 232 aa6.64□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa6.64□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 NINJ2Q9NZG7 142 aa6.64□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 OR12D3Q9UGF7 316 aa6.64□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 PRKAG3Q9UGI9 489 aa6.64□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 SLC24A2Q9UI40 661 aa6.64□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 DNMT3LQ9UJW3 386 aa6.64□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 ZNF180Q9UJW8 692 aa6.64□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 SNX24Q9Y343 169 aa6.64□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 TBX4P57082 545 aa6.63□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 GBE1Q04446 702 aa6.63□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 STAT4Q14765 748 aa6.63□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 ZNF365Q70YC5 407 aa6.63□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 FAM131BQ86XD5 332 aa6.63□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP6.63□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 PYROXD2Q8N2H3 581 aa6.63□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 BADQ92934 168 aa6.63□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 PEX13Q92968 403 aa6.63□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 TMEM169Q96HH4 297 aa6.63□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 SGSM3Q96HU1 749 aa6.63□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa6.63□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 KLHL11Q9NVR0 708 aa6.63□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP6.63□□□□□ -1.354e-7■■□□□ 12.3
PRKCI-202ENST00000476635 ANAPC5Q9UJX4 755 aa6.63□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 ESYT3A0FGR9 886 aa6.63□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 LINC01553A4QN01 128 aa6.63□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 GOLGA6BA6NDN3 693 aa6.63□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 MATN3O15232 486 aa6.63□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 TMEM63AO94886 807 aa6.63□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 PTPN3P26045 913 aa6.63□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 CHKAP35790 457 aa6.63□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 PPP1R7Q15435 360 aa6.63□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 TTMPQ5BVD1 217 aa6.63□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 NPNTQ6UXI9 565 aa6.63□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 CCDC13Q8IYE1 715 aa6.63□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 ATAD1Q8NBU5 361 aa6.63□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 FBXO32Q969P5 355 aa6.63□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 TMEM121Q9BTD3 319 aa6.63□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 PRO3102Q9H379 93 aa6.63□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 TEX28O15482 410 aa6.63□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 EN2P19622 333 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 AMPD1P23109 780 aa6.63□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 DNAJB1P25685 340 aa6.63□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 CSNK1DP48730 415 aa6.63□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 TPI1P60174 286 aa6.63□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 TAF10Q12962 218 aa6.63□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 USP4Q13107 963 aa6.63□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 GPS2Q13227 327 aa6.63□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 CAMK1Q14012 370 aa6.63□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 DDR2Q16832 855 aa6.63□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 CCDC38Q502W7 563 aa6.63□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP6.63□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 TEKT5Q96M29 485 aa6.63□□□□□ -1.35
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