RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467748.1

RABGGTB-206, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 468 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-206ENST00000467748 PELI3Q8N2H9 469 aa4.61□□□□□ -1.67
RABGGTB-206ENST00000467748 SLC44A5Q8NCS7 719 aa4.61□□□□□ -1.67
RABGGTB-206ENST00000467748 KAT2AQ92830 837 aa4.61□□□□□ -1.67
RABGGTB-206ENST00000467748 PMM1Q92871 262 aa4.61□□□□□ -1.67
RABGGTB-206ENST00000467748 FAR2Q96K12 515 aa4.61□□□□□ -1.67
RABGGTB-206ENST00000467748 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP4.61□□□□□ -1.67
RABGGTB-206ENST00000467748 FAM234AQ9H0X4 552 aa4.61□□□□□ -1.67
RABGGTB-206ENST00000467748 THSD1Q9NS62 852 aa4.61□□□□□ -1.67
RABGGTB-206ENST00000467748 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP4.61□□□□□ -1.67
RABGGTB-206ENST00000467748 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP4.61□□□□□ -1.67
RABGGTB-206ENST00000467748 SLC12A4Q9UP95 1085 aa4.61□□□□□ -1.67
RABGGTB-206ENST00000467748 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP4.61□□□□□ -1.67
RABGGTB-206ENST00000467748 TOP2BQ02880 1626 aa4.61□□□□□ -1.67
RABGGTB-206ENST00000467748 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-206ENST00000467748 PROB1E7EW31 1015 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-206ENST00000467748 KIR2DS3K7RE56 304 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-206ENST00000467748 INSIG1O15503 277 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-206ENST00000467748 ATG13O75143 517 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-206ENST00000467748 ALPLP05186 524 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-206ENST00000467748 SNHG28P0DPA3 235 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-206ENST00000467748 STARD3Q14849 445 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-206ENST00000467748 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-206ENST00000467748 PRTGQ2VWP7 1150 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-206ENST00000467748 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-206ENST00000467748 DGKKQ5KSL6 1271 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-206ENST00000467748 ASPHD1Q5U4P2 390 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-206ENST00000467748 WDR93Q6P2C0 686 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-206ENST00000467748 RFX8Q6ZV50 586 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-206ENST00000467748 TMEM199Q8N511 208 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-206ENST00000467748 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-206ENST00000467748 MPLKIPQ8TAP9 179 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-206ENST00000467748 CLEC4CQ8WTT0 213 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-206ENST00000467748 ASB5Q8WWX0 329 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-206ENST00000467748 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-206ENST00000467748 NLRP4Q96MN2 994 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-206ENST00000467748 CCDC134Q9H6E4 229 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-206ENST00000467748 OBP2BQ9NPH6 170 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-206ENST00000467748 NLRC4Q9NPP4 1024 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-206ENST00000467748 CHD1O14646 1710 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-206ENST00000467748 FAM90A10PA6NDY2 464 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-206ENST00000467748 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-206ENST00000467748 TECP42680 631 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-206ENST00000467748 HTR6P50406 440 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-206ENST00000467748 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-206ENST00000467748 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-206ENST00000467748 ABCC10Q5T3U5 1492 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-206ENST00000467748 SYCP2LQ5T4T6 812 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-206ENST00000467748 ZNF549Q6P9A3 640 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-206ENST00000467748 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-206ENST00000467748 OR52N4Q8NGI2 321 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-206ENST00000467748 IP6K1Q92551 441 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-206ENST00000467748 TMEM41AQ96HV5 264 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-206ENST00000467748 FBXO4Q9UKT5 387 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-206ENST00000467748 LAMP3Q9UQV4 416 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-206ENST00000467748 CXorf65A6NEN9 183 aa4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-206ENST00000467748 LGALS16A8MUM7 142 aa4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-206ENST00000467748 RHODO00212 210 aa4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-206ENST00000467748 SGPL1O95470 568 aa4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-206ENST00000467748 TGM2P21980 687 aa4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-206ENST00000467748 CIITAP33076 1130 aa4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-206ENST00000467748 GRK5P34947 590 aa4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-206ENST00000467748 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-206ENST00000467748 GAD2Q05329 585 aa4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-206ENST00000467748 PPATQ06203 517 aa4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-206ENST00000467748 SPARCL1Q14515 664 aa4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-206ENST00000467748 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-206ENST00000467748 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-206ENST00000467748 HMBOX1Q6NT76 420 aa4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-206ENST00000467748 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-206ENST00000467748 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-206ENST00000467748 DDIASQ8IXT1 998 aa4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-206ENST00000467748 ACRBPQ8NEB7 543 aa4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-206ENST00000467748 SVIPQ8NHG7 77 aa4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-206ENST00000467748 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-206ENST00000467748 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-206ENST00000467748 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-206ENST00000467748 IL21RQ9HBE5 538 aa4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-206ENST00000467748 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-206ENST00000467748 DECR2Q9NUI1 292 aa4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-206ENST00000467748 ANAPC4Q9UJX5 808 aa4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-206ENST00000467748 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-206ENST00000467748 SLC8A2Q9UPR5 921 aa4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-206ENST00000467748 LZTS1Q9Y250 596 aa4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-206ENST00000467748 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-206ENST00000467748 CLASP1Q7Z460 1538 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-206ENST00000467748 IFT140Q96RY7 1462 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-206ENST00000467748 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-206ENST00000467748 DPPA5A6NC42 116 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-206ENST00000467748 FAM90A18PA6NE21 464 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-206ENST00000467748 FAM90A16PA6NEW6 464 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-206ENST00000467748 AGAP5A6NIR3 686 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-206ENST00000467748 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-206ENST00000467748 SLC38A8A6NNN8 435 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-206ENST00000467748 FAM90A5PA8MXJ8 464 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-206ENST00000467748 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-206ENST00000467748 NFATC1O95644 943 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-206ENST00000467748 SYF2O95926 243 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-206ENST00000467748 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-206ENST00000467748 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-206ENST00000467748 FAM90A15PP0C7V4 464 aa4.57□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.3 ms