RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000458294.5

PBRM1-218, Transcript of polybromo 1, humanhuman

TSL 3

Gene PBRM1, Length 476 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBRM1-218ENST00000458294 A0A1W2PPC4 97 aa27.36■■□□□ 1.97
PBRM1-218ENST00000458294 VILLO15195 856 aa27.36■■□□□ 1.97
PBRM1-218ENST00000458294 C21orf59P57076 290 aa27.36■■□□□ 1.97
PBRM1-218ENST00000458294 ARID5BQ14865 1188 aa27.36■■□□□ 1.97
PBRM1-218ENST00000458294 CNGA2Q16280 664 aa27.36■■□□□ 1.97
PBRM1-218ENST00000458294 KCNT1Q5JUK3 1230 aa27.36■■□□□ 1.97
PBRM1-218ENST00000458294 GANCQ8TET4 914 aa27.36■■□□□ 1.97
PBRM1-218ENST00000458294 HSFY1Q96LI6 401 aa27.36■■□□□ 1.97
PBRM1-218ENST00000458294 GSDMAQ96QA5 445 aa27.36■■□□□ 1.97
PBRM1-218ENST00000458294 MTG2Q9H4K7 406 aa27.36■■□□□ 1.97
PBRM1-218ENST00000458294 FBXL12Q9NXK8 326 aa27.36■■□□□ 1.97
PBRM1-218ENST00000458294 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa27.36■■□□□ 1.97
PBRM1-218ENST00000458294 ACACAQ13085 2346 aa27.35■■□□□ 1.97
PBRM1-218ENST00000458294 KNL1Q8NG31 2342 aa27.35■■□□□ 1.97
PBRM1-218ENST00000458294 TRABD2BA6NFA1 517 aa27.35■■□□□ 1.97
PBRM1-218ENST00000458294 M0QYV0 167 aa27.35■■□□□ 1.97
PBRM1-218ENST00000458294 PIK3R2O00459 728 aa27.35■■□□□ 1.97
PBRM1-218ENST00000458294 SIN3BO75182 1162 aa27.35■■□□□ 1.97
PBRM1-218ENST00000458294 FBXO21O94952 628 aa27.35■■□□□ 1.97
PBRM1-218ENST00000458294 CSKP41240 450 aa27.35■■□□□ 1.97
PBRM1-218ENST00000458294 PMS1P54277 932 aaKnown RBP27.35■■□□□ 1.97
PBRM1-218ENST00000458294 CAMK2BQ13554 666 aa27.35■■□□□ 1.97
PBRM1-218ENST00000458294 NADSYN1Q6IA69 706 aa27.35■■□□□ 1.97
PBRM1-218ENST00000458294 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP27.35■■□□□ 1.97
PBRM1-218ENST00000458294 CLEC4CQ8WTT0 213 aa27.35■■□□□ 1.97
PBRM1-218ENST00000458294 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP27.35■■□□□ 1.97
PBRM1-218ENST00000458294 SKA1Q96BD8 255 aa27.35■■□□□ 1.97
PBRM1-218ENST00000458294 MRGPRX3Q96LB0 322 aa27.35■■□□□ 1.97
PBRM1-218ENST00000458294 NT5C1BQ96P26 610 aa27.35■■□□□ 1.97
PBRM1-218ENST00000458294 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP27.35■■□□□ 1.97
PBRM1-218ENST00000458294 FTSJ1Q9UET6 329 aa27.35■■□□□ 1.97
PBRM1-218ENST00000458294 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa27.35■■□□□ 1.97
PBRM1-218ENST00000458294 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP27.34■■□□□ 1.97
PBRM1-218ENST00000458294 LOC400499M0QZD8 3231 aa27.34■■□□□ 1.97
PBRM1-218ENST00000458294 A0A1B0GTQ1 180 aa27.34■■□□□ 1.97
PBRM1-218ENST00000458294 PMM2O15305 246 aa27.34■■□□□ 1.97
PBRM1-218ENST00000458294 FMO5P49326 533 aa27.34■■□□□ 1.97
PBRM1-218ENST00000458294 GALCP54803 685 aa27.34■■□□□ 1.97
PBRM1-218ENST00000458294 NNTQ13423 1086 aa27.34■■□□□ 1.97
PBRM1-218ENST00000458294 CST6Q15828 149 aa27.34■■□□□ 1.97
PBRM1-218ENST00000458294 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP27.34■■□□□ 1.97
PBRM1-218ENST00000458294 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP27.34■■□□□ 1.97
PBRM1-218ENST00000458294 SERPINB11Q96P15 392 aa27.34■■□□□ 1.97
PBRM1-218ENST00000458294 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP27.34■■□□□ 1.97
PBRM1-218ENST00000458294 FZD4Q9ULV1 537 aa27.34■■□□□ 1.97
PBRM1-218ENST00000458294 TLR6Q9Y2C9 796 aa27.34■■□□□ 1.97
PBRM1-218ENST00000458294 APC2O95996 2303 aa27.33■■□□□ 1.97
PBRM1-218ENST00000458294 FAM47DPA6NHR8 397 aa27.33■■□□□ 1.97
PBRM1-218ENST00000458294 E9PAM4 449 aa27.33■■□□□ 1.97
PBRM1-218ENST00000458294 IL9RQ01113 521 aa27.33■■□□□ 1.97
PBRM1-218ENST00000458294 CYP4F3Q08477 520 aa27.33■■□□□ 1.97
PBRM1-218ENST00000458294 CDH18Q13634 790 aa27.33■■□□□ 1.97
PBRM1-218ENST00000458294 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP27.33■■□□□ 1.97
PBRM1-218ENST00000458294 CARNMT1Q8N4J0 409 aa27.33■■□□□ 1.97
PBRM1-218ENST00000458294 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP27.33■■□□□ 1.97
PBRM1-218ENST00000458294 SLC6A18Q96N87 628 aa27.33■■□□□ 1.97
PBRM1-218ENST00000458294 ZSWIM1Q9BR11 485 aa27.33■■□□□ 1.97
PBRM1-218ENST00000458294 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP27.33■■□□□ 1.97
PBRM1-218ENST00000458294 SERGEFQ9UGK8 458 aa27.33■■□□□ 1.97
PBRM1-218ENST00000458294 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa27.33■■□□□ 1.97
PBRM1-218ENST00000458294 A0A1W2PP55 124 aa27.32■■□□□ 1.96
PBRM1-218ENST00000458294 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP27.32■■□□□ 1.96
PBRM1-218ENST00000458294 TRIM49BA6NDI0 452 aa27.32■■□□□ 1.96
PBRM1-218ENST00000458294 LRRC72A6NJI9 287 aa27.32■■□□□ 1.96
PBRM1-218ENST00000458294 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP27.32■■□□□ 1.96
PBRM1-218ENST00000458294 MID1O15344 667 aa27.32■■□□□ 1.96
PBRM1-218ENST00000458294 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP27.32■■□□□ 1.96
PBRM1-218ENST00000458294 RPS24P62847 133 aaKnown RBP27.32■■□□□ 1.96
PBRM1-218ENST00000458294 MS4A13Q5J8X5 152 aa27.32■■□□□ 1.96
PBRM1-218ENST00000458294 C9orf64Q5T6V5 341 aa27.32■■□□□ 1.96
PBRM1-218ENST00000458294 NCEH1Q6PIU2 408 aa27.32■■□□□ 1.96
PBRM1-218ENST00000458294 MARCH9Q86YJ5 346 aa27.32■■□□□ 1.96
PBRM1-218ENST00000458294 PPM1KQ8N3J5 372 aa27.32■■□□□ 1.96
PBRM1-218ENST00000458294 OR2T34Q8NGX1 318 aa27.32■■□□□ 1.96
PBRM1-218ENST00000458294 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP27.32■■□□□ 1.96
PBRM1-218ENST00000458294 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP27.32■■□□□ 1.96
PBRM1-218ENST00000458294 ERVW-1Q9UQF0 538 aa27.32■■□□□ 1.96
PBRM1-218ENST00000458294 FASNP49327 2511 aaKnown RBP27.32■■□□□ 1.96
PBRM1-218ENST00000458294 FYNP06241 537 aa27.31■■□□□ 1.96
PBRM1-218ENST00000458294 BRD2P25440 801 aaKnown RBP27.31■■□□□ 1.96
PBRM1-218ENST00000458294 CCDC157Q569K6 752 aa27.31■■□□□ 1.96
PBRM1-218ENST00000458294 PITRM1Q5JRX3 1037 aa27.31■■□□□ 1.96
PBRM1-218ENST00000458294 DHRS13Q6UX07 377 aa27.31■■□□□ 1.96
PBRM1-218ENST00000458294 SCUBE3Q8IX30 993 aa27.31■■□□□ 1.96
PBRM1-218ENST00000458294 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP27.31■■□□□ 1.96
PBRM1-218ENST00000458294 MYEOVQ96EZ4 313 aa27.31■■□□□ 1.96
PBRM1-218ENST00000458294 SLC39A13Q96H72 371 aa27.31■■□□□ 1.96
PBRM1-218ENST00000458294 OMDQ99983 421 aa27.31■■□□□ 1.96
PBRM1-218ENST00000458294 MIS12Q9H081 205 aa27.31■■□□□ 1.96
PBRM1-218ENST00000458294 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP27.31■■□□□ 1.96
PBRM1-218ENST00000458294 NEUROG2Q9H2A3 272 aa27.31■■□□□ 1.96
PBRM1-218ENST00000458294 GDPD2Q9HCC8 539 aa27.31■■□□□ 1.96
PBRM1-218ENST00000458294 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP27.31■■□□□ 1.96
PBRM1-218ENST00000458294 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa27.31■■□□□ 1.96
PBRM1-218ENST00000458294 ITIH6Q6UXX5 1313 aa27.31■■□□□ 1.96
PBRM1-218ENST00000458294 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP27.3■■□□□ 1.96
PBRM1-218ENST00000458294 FAM149AA5PLN7 773 aa27.3■■□□□ 1.96
PBRM1-218ENST00000458294 C10orf142B7Z368 130 aa27.3■■□□□ 1.96
PBRM1-218ENST00000458294 SART1O43290 800 aaKnown RBP27.3■■□□□ 1.96
PBRM1-218ENST00000458294 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.6 ms