RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439415.1

CBX1P4-201, Transcript of chromobox 1 pseudogene 4, humanhuman

BASIC

Gene CBX1P4, Length 457 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P4-201ENST00000439415 SLC22A18Q96BI1 424 aa4.99□□□□□ -1.61
CBX1P4-201ENST00000439415 FAM149B1Q96BN6 582 aa4.99□□□□□ -1.61
CBX1P4-201ENST00000439415 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
CBX1P4-201ENST00000439415 GBP5Q96PP8 586 aa4.99□□□□□ -1.61
CBX1P4-201ENST00000439415 GCNAQ96QF7 691 aa4.99□□□□□ -1.61
CBX1P4-201ENST00000439415 FNBP1Q96RU3 617 aa4.99□□□□□ -1.61
CBX1P4-201ENST00000439415 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
CBX1P4-201ENST00000439415 C17orf80Q9BSJ5 609 aa4.99□□□□□ -1.61
CBX1P4-201ENST00000439415 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
CBX1P4-201ENST00000439415 KLHL4Q9C0H6 718 aa4.99□□□□□ -1.61
CBX1P4-201ENST00000439415 CTDSP1Q9GZU7 261 aa4.99□□□□□ -1.61
CBX1P4-201ENST00000439415 TRIM36Q9NQ86 728 aa4.99□□□□□ -1.61
CBX1P4-201ENST00000439415 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
CBX1P4-201ENST00000439415 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa4.99□□□□□ -1.61
CBX1P4-201ENST00000439415 WDR35Q9P2L0 1181 aa4.99□□□□□ -1.61
CBX1P4-201ENST00000439415 CDH22Q9UJ99 828 aa4.99□□□□□ -1.61
CBX1P4-201ENST00000439415 ADAM29Q9UKF5 820 aa4.99□□□□□ -1.61
CBX1P4-201ENST00000439415 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
CBX1P4-201ENST00000439415 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa4.99□□□□□ -1.61
CBX1P4-201ENST00000439415 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
CBX1P4-201ENST00000439415 NR2E1Q9Y466 385 aa4.99□□□□□ -1.61
CBX1P4-201ENST00000439415 SNX14Q9Y5W7 946 aa4.99□□□□□ -1.61
CBX1P4-201ENST00000439415 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa4.98□□□□□ -1.61
CBX1P4-201ENST00000439415 A0A1W2PRX2 142 aa4.98□□□□□ -1.61
CBX1P4-201ENST00000439415 GLOD5A6NK44 160 aa4.98□□□□□ -1.61
CBX1P4-201ENST00000439415 M0QZQ0 153 aa4.98□□□□□ -1.61
CBX1P4-201ENST00000439415 GRM8O00222 908 aa4.98□□□□□ -1.61
CBX1P4-201ENST00000439415 SUN1O94901 812 aa4.98□□□□□ -1.61
CBX1P4-201ENST00000439415 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
CBX1P4-201ENST00000439415 THEGLP0DJG4 465 aa4.98□□□□□ -1.61
CBX1P4-201ENST00000439415 KCNA2P16389 499 aa4.98□□□□□ -1.61
CBX1P4-201ENST00000439415 MMP8P22894 467 aa4.98□□□□□ -1.61
CBX1P4-201ENST00000439415 TTKP33981 857 aa4.98□□□□□ -1.61
CBX1P4-201ENST00000439415 HNF1BP35680 557 aa4.98□□□□□ -1.61
CBX1P4-201ENST00000439415 KRT2P35908 639 aa4.98□□□□□ -1.61
CBX1P4-201ENST00000439415 CPOXP36551 454 aa4.98□□□□□ -1.61
CBX1P4-201ENST00000439415 NDUFV1P49821 464 aa4.98□□□□□ -1.61
CBX1P4-201ENST00000439415 CHN2P52757 468 aa4.98□□□□□ -1.61
CBX1P4-201ENST00000439415 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
CBX1P4-201ENST00000439415 EFNB1P98172 346 aa4.98□□□□□ -1.61
CBX1P4-201ENST00000439415 CSRP2Q16527 193 aa4.98□□□□□ -1.61
CBX1P4-201ENST00000439415 ST3GAL2Q16842 350 aa4.98□□□□□ -1.61
CBX1P4-201ENST00000439415 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
CBX1P4-201ENST00000439415 ZNF568Q3ZCX4 644 aa4.98□□□□□ -1.61
CBX1P4-201ENST00000439415 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
CBX1P4-201ENST00000439415 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
CBX1P4-201ENST00000439415 C9orf152Q5JTZ5 239 aa4.98□□□□□ -1.61
CBX1P4-201ENST00000439415 FAM111BQ6SJ93 734 aa4.98□□□□□ -1.61
CBX1P4-201ENST00000439415 MTHFD1LQ6UB35 978 aa4.98□□□□□ -1.61
CBX1P4-201ENST00000439415 CHST3Q7LGC8 479 aa4.98□□□□□ -1.61
CBX1P4-201ENST00000439415 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa4.98□□□□□ -1.61
CBX1P4-201ENST00000439415 ERC1Q8IUD2 1116 aa4.98□□□□□ -1.61
CBX1P4-201ENST00000439415 TP53INP2Q8IXH6 220 aa4.98□□□□□ -1.61
CBX1P4-201ENST00000439415 CCDC170Q8IYT3 715 aa4.98□□□□□ -1.61
CBX1P4-201ENST00000439415 IZUMO1Q8IYV9 350 aa4.98□□□□□ -1.61
CBX1P4-201ENST00000439415 METTL25Q8N6Q8 603 aa4.98□□□□□ -1.61
CBX1P4-201ENST00000439415 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
CBX1P4-201ENST00000439415 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
CBX1P4-201ENST00000439415 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
CBX1P4-201ENST00000439415 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa4.98□□□□□ -1.61
CBX1P4-201ENST00000439415 OSCP1Q8WVF1 389 aa4.98□□□□□ -1.61
CBX1P4-201ENST00000439415 RMDN1Q96DB5 314 aa4.98□□□□□ -1.61
CBX1P4-201ENST00000439415 CCDC34Q96HJ3 373 aa4.98□□□□□ -1.61
CBX1P4-201ENST00000439415 PGAM5Q96HS1 289 aa4.98□□□□□ -1.61
CBX1P4-201ENST00000439415 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
CBX1P4-201ENST00000439415 ABHD1Q96SE0 405 aa4.98□□□□□ -1.61
CBX1P4-201ENST00000439415 MAP7D2Q96T17 732 aa4.98□□□□□ -1.61
CBX1P4-201ENST00000439415 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
CBX1P4-201ENST00000439415 CLSTN3Q9BQT9 956 aa4.98□□□□□ -1.61
CBX1P4-201ENST00000439415 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP4.98□□□□□ -1.61
CBX1P4-201ENST00000439415 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
CBX1P4-201ENST00000439415 ANAPC5Q9UJX4 755 aa4.98□□□□□ -1.61
CBX1P4-201ENST00000439415 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa4.98□□□□□ -1.61
CBX1P4-201ENST00000439415 SMARCA4P51532 1647 aa4.97□□□□□ -1.61
CBX1P4-201ENST00000439415 F5H697 171 aa4.97□□□□□ -1.61
CBX1P4-201ENST00000439415 PER2O15055 1255 aa4.97□□□□□ -1.61
CBX1P4-201ENST00000439415 MT-ND3P03897 115 aa4.97□□□□□ -1.61
CBX1P4-201ENST00000439415 CCDC175P0C221 793 aa4.97□□□□□ -1.61
CBX1P4-201ENST00000439415 MYBL1P10243 752 aa4.97□□□□□ -1.61
CBX1P4-201ENST00000439415 GNAT2P19087 354 aa4.97□□□□□ -1.61
CBX1P4-201ENST00000439415 GP5P40197 560 aa4.97□□□□□ -1.61
CBX1P4-201ENST00000439415 LIMS1P48059 325 aa4.97□□□□□ -1.61
CBX1P4-201ENST00000439415 NRIP1P48552 1158 aa4.97□□□□□ -1.61
CBX1P4-201ENST00000439415 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP4.97□□□□□ -1.61
CBX1P4-201ENST00000439415 MVDP53602 400 aa4.97□□□□□ -1.61
CBX1P4-201ENST00000439415 FOXL2P58012 376 aa4.97□□□□□ -1.61
CBX1P4-201ENST00000439415 ARHGAP8P85298 464 aa4.97□□□□□ -1.61
CBX1P4-201ENST00000439415 CDK18Q07002 472 aa4.97□□□□□ -1.61
CBX1P4-201ENST00000439415 RNF151Q2KHN1 245 aa4.97□□□□□ -1.61
CBX1P4-201ENST00000439415 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP4.97□□□□□ -1.61
CBX1P4-201ENST00000439415 MTFR2Q6P444 385 aa4.97□□□□□ -1.61
CBX1P4-201ENST00000439415 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa4.97□□□□□ -1.61
CBX1P4-201ENST00000439415 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP4.97□□□□□ -1.61
CBX1P4-201ENST00000439415 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP4.97□□□□□ -1.61
CBX1P4-201ENST00000439415 USP51Q70EK9 711 aa4.97□□□□□ -1.61
CBX1P4-201ENST00000439415 METTL23Q86XA0 190 aa4.97□□□□□ -1.61
CBX1P4-201ENST00000439415 TICAM1Q8IUC6 712 aa4.97□□□□□ -1.61
CBX1P4-201ENST00000439415 LINC00346Q8IVM7 164 aa4.97□□□□□ -1.61
CBX1P4-201ENST00000439415 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa4.97□□□□□ -1.61
CBX1P4-201ENST00000439415 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP4.97□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.3 ms