RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426282.6

NUP50-AS1-201, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NUP50-AS1, Length 2,076 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PGAM1P18669 254 aa19.22■□□□□ 0.67
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PAX3P23760 479 aa19.22■□□□□ 0.67
NUP50-AS1-201ENST00000426282 YY1P25490 414 aa19.22■□□□□ 0.67
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP19.22■□□□□ 0.67
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP19.22■□□□□ 0.67
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FAM26DQ5JW98 314 aa19.22■□□□□ 0.67
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CCNJLQ8IV13 435 aa19.22■□□□□ 0.67
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP19.22■□□□□ 0.67
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ERP27Q96DN0 273 aa19.22■□□□□ 0.67
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LRRC37BQ96QE4 947 aa19.22■□□□□ 0.67
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PLLPQ9Y342 182 aa19.22■□□□□ 0.67
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SNX10Q9Y5X0 201 aa19.22■□□□□ 0.67
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TMEM88BA6NKF7 163 aa19.21■□□□□ 0.67
NUP50-AS1-201ENST00000426282 F8W810 466 aa19.21■□□□□ 0.67
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP19.21■□□□□ 0.67
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SKIP12755 728 aa19.21■□□□□ 0.67
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CCNB1P14635 433 aa19.21■□□□□ 0.67
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NIPAL4Q0D2K0 466 aa19.21■□□□□ 0.67
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ITGA7Q13683 1181 aa19.21■□□□□ 0.67
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CRYMQ14894 314 aa19.21■□□□□ 0.67
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP19.21■□□□□ 0.67
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MROH9Q5TGP6 573 aa19.21■□□□□ 0.67
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP19.21■□□□□ 0.67
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP19.21■□□□□ 0.67
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PARP9Q8IXQ6 854 aa19.21■□□□□ 0.67
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SMC1BQ8NDV3 1235 aa19.21■□□□□ 0.67
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF398Q8TD17 642 aa19.21■□□□□ 0.67
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HDAC11Q96DB2 347 aa19.21■□□□□ 0.67
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SUSD3Q96L08 255 aa19.21■□□□□ 0.67
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GORASP1Q9BQQ3 440 aa19.21■□□□□ 0.67
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TSSK1BQ9BXA7 367 aa19.21■□□□□ 0.67
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SYBUQ9NX95 663 aa19.21■□□□□ 0.67
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CEP350Q5VT06 3117 aa19.21■□□□□ 0.67
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP19.21■□□□□ 0.67
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LRIG2O94898 1065 aa19.21■□□□□ 0.67
NUP50-AS1-201ENST00000426282 BGNP21810 368 aa19.21■□□□□ 0.67
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP19.21■□□□□ 0.67
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MNAT1P51948 309 aa19.21■□□□□ 0.67
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KCNJ2P63252 427 aa19.21■□□□□ 0.67
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GALNT2Q10471 571 aa19.21■□□□□ 0.67
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OVGP1Q12889 678 aa19.21■□□□□ 0.67
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP19.21■□□□□ 0.67
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP19.21■□□□□ 0.67
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NAT9Q9BTE0 207 aa19.21■□□□□ 0.67
NUP50-AS1-201ENST00000426282 BRD8Q9H0E9 1235 aa19.21■□□□□ 0.67
NUP50-AS1-201ENST00000426282 VGLL3A8MV65 326 aa19.2■□□□□ 0.66
NUP50-AS1-201ENST00000426282 C2CD2LO14523 706 aa19.2■□□□□ 0.66
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MGRN1O60291 552 aa19.2■□□□□ 0.66
NUP50-AS1-201ENST00000426282 UNC5CO95185 931 aa19.2■□□□□ 0.66
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NQO1P15559 274 aaKnown RBP19.2■□□□□ 0.66
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MX2P20592 715 aa19.2■□□□□ 0.66
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CNTFP26441 200 aa19.2■□□□□ 0.66
NUP50-AS1-201ENST00000426282 EPHB2P29323 1055 aa19.2■□□□□ 0.66
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SERPINB6P35237 376 aa19.2■□□□□ 0.66
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa19.2■□□□□ 0.66
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa19.2■□□□□ 0.66
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ASRGL1Q7L266 308 aa19.2■□□□□ 0.66
NUP50-AS1-201ENST00000426282 THEM5Q8N1Q8 247 aa19.2■□□□□ 0.66
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SCAMP5Q8TAC9 235 aa19.2■□□□□ 0.66
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KLHL29Q96CT2 875 aa19.2■□□□□ 0.66
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SLC13A1Q9BZW2 595 aa19.2■□□□□ 0.66
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PCMTD2Q9NV79 361 aa19.2■□□□□ 0.66
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SHROOM3Q8TF72 1996 aa19.2■□□□□ 0.66
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FRMPD3Q5JV73 1810 aa19.2■□□□□ 0.66
NUP50-AS1-201ENST00000426282 INPPL1O15357 1258 aa19.2■□□□□ 0.66
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GARSP41250 739 aaKnown RBP19.2■□□□□ 0.66
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TSPY1Q01534 308 aa19.2■□□□□ 0.66
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TIFABQ6ZNK6 161 aa19.2■□□□□ 0.66
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CDKL2Q92772 493 aa19.2■□□□□ 0.66
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TRIM62Q9BVG3 475 aa19.2■□□□□ 0.66
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SLC17A6Q9P2U8 582 aa19.2■□□□□ 0.66
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SQORQ9Y6N5 450 aa19.2■□□□□ 0.66
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KLF11O14901 512 aa19.19■□□□□ 0.66
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MTSS1O43312 755 aa19.19■□□□□ 0.66
NUP50-AS1-201ENST00000426282 AP2A1O95782 977 aa19.19■□□□□ 0.66
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ALDH1A1P00352 501 aa19.19■□□□□ 0.66
NUP50-AS1-201ENST00000426282 IGLV3-25P01717 112 aa19.19■□□□□ 0.66
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NEFHP12036 1026 aa19.19■□□□□ 0.66
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TYMPP19971 482 aa19.19■□□□□ 0.66
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OLIG2Q13516 323 aa19.19■□□□□ 0.66
NUP50-AS1-201ENST00000426282 BEND5Q7L4P6 421 aa19.19■□□□□ 0.66
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NLRP9Q7RTR0 991 aa19.19■□□□□ 0.66
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NDUFAF2Q8N183 169 aa19.19■□□□□ 0.66
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RFWD2Q8NHY2 731 aa19.19■□□□□ 0.66
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RNF34Q969K3 372 aa19.19■□□□□ 0.66
NUP50-AS1-201ENST00000426282 AGAP3Q96P47 875 aa19.19■□□□□ 0.66
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NUP205Q92621 2012 aa19.19■□□□□ 0.66
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ARHGEF37A1IGU5 675 aa19.18■□□□□ 0.66
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CHUKO15111 745 aa19.18■□□□□ 0.66
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP19.18■□□□□ 0.66
NUP50-AS1-201ENST00000426282 IL1BP01584 269 aa19.18■□□□□ 0.66
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZBTB17Q13105 803 aa19.18■□□□□ 0.66
NUP50-AS1-201ENST00000426282 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP19.18■□□□□ 0.66
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SNCBQ16143 134 aa19.18■□□□□ 0.66
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ARMC2Q8NEN0 867 aa19.18■□□□□ 0.66
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OR52K1Q8NGK4 314 aa19.18■□□□□ 0.66
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TRIM55Q9BYV6 548 aa19.18■□□□□ 0.66
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GBA3Q9H227 469 aa19.18■□□□□ 0.66
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ARHGEF3Q9NR81 526 aa19.18■□□□□ 0.66
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TXLNGQ9NUQ3 528 aa19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.9 ms