RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421832.2

CTU1-201, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CTU1, Length 2,087 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU1-201ENST00000421832 RCOR2Q8IZ40 523 aa25.2■■□□□ 1.62
CTU1-201ENST00000421832 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa25.2■■□□□ 1.62
CTU1-201ENST00000421832 MSI1O43347 362 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
CTU1-201ENST00000421832 TBX18O95935 607 aa25.19■■□□□ 1.62
CTU1-201ENST00000421832 IGLV3-25P01717 112 aa25.19■■□□□ 1.62
CTU1-201ENST00000421832 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
CTU1-201ENST00000421832 TAOK1Q7L7X3 1001 aa25.19■■□□□ 1.62
CTU1-201ENST00000421832 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
CTU1-201ENST00000421832 SAMD11Q96NU1 681 aa25.19■■□□□ 1.62
CTU1-201ENST00000421832 COMMD8Q9NX08 183 aa25.19■■□□□ 1.62
CTU1-201ENST00000421832 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa25.19■■□□□ 1.62
CTU1-201ENST00000421832 LRRC42Q9Y546 428 aa25.19■■□□□ 1.62
CTU1-201ENST00000421832 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa25.19■■□□□ 1.62
CTU1-201ENST00000421832 MDM4O15151 490 aa25.19■■□□□ 1.62
CTU1-201ENST00000421832 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa25.19■■□□□ 1.62
CTU1-201ENST00000421832 CDKN2BP42772 138 aa25.19■■□□□ 1.62
CTU1-201ENST00000421832 ARSEP51690 589 aa25.19■■□□□ 1.62
CTU1-201ENST00000421832 CLCN4P51793 760 aa25.19■■□□□ 1.62
CTU1-201ENST00000421832 PLD1Q13393 1074 aa25.19■■□□□ 1.62
CTU1-201ENST00000421832 BOLA3Q53S33 107 aa25.19■■□□□ 1.62
CTU1-201ENST00000421832 PPP2R2DQ66LE6 453 aa25.19■■□□□ 1.62
CTU1-201ENST00000421832 KCTD6Q8NC69 237 aa25.19■■□□□ 1.62
CTU1-201ENST00000421832 KREMEN2Q8NCW0 462 aa25.19■■□□□ 1.62
CTU1-201ENST00000421832 ARNTL2Q8WYA1 636 aa25.19■■□□□ 1.62
CTU1-201ENST00000421832 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
CTU1-201ENST00000421832 CEP295NLQ96MC4 621 aa25.19■■□□□ 1.62
CTU1-201ENST00000421832 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
CTU1-201ENST00000421832 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
CTU1-201ENST00000421832 OSBPL8Q9BZF1 889 aa25.19■■□□□ 1.62
CTU1-201ENST00000421832 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP25.19■■□□□ 1.62
CTU1-201ENST00000421832 RRN3Q9NYV6 651 aa25.19■■□□□ 1.62
CTU1-201ENST00000421832 EPOPA6NHQ4 379 aa25.18■■□□□ 1.62
CTU1-201ENST00000421832 CSH1P0DML2 217 aa25.18■■□□□ 1.62
CTU1-201ENST00000421832 CSH2P0DML3 217 aa25.18■■□□□ 1.62
CTU1-201ENST00000421832 RARGP13631 454 aa25.18■■□□□ 1.62
CTU1-201ENST00000421832 CDH6P55285 790 aa25.18■■□□□ 1.62
CTU1-201ENST00000421832 MMRN1Q13201 1228 aa25.18■■□□□ 1.62
CTU1-201ENST00000421832 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
CTU1-201ENST00000421832 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
CTU1-201ENST00000421832 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
CTU1-201ENST00000421832 ZFAND2BQ8WV99 257 aa25.18■■□□□ 1.62
CTU1-201ENST00000421832 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
CTU1-201ENST00000421832 ERP44Q9BS26 406 aa25.18■■□□□ 1.62
CTU1-201ENST00000421832 TRIM62Q9BVG3 475 aa25.18■■□□□ 1.62
CTU1-201ENST00000421832 SMOC2Q9H3U7 446 aa25.18■■□□□ 1.62
CTU1-201ENST00000421832 CCSER2Q9H7U1 834 aa25.18■■□□□ 1.62
CTU1-201ENST00000421832 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
CTU1-201ENST00000421832 REV3LO60673 3130 aa25.18■■□□□ 1.62
CTU1-201ENST00000421832 ENO4A6NNW6 628 aa25.17■■□□□ 1.62
CTU1-201ENST00000421832 GLUD1P00367 558 aa25.17■■□□□ 1.62
CTU1-201ENST00000421832 PPARDQ03181 441 aa25.17■■□□□ 1.62
CTU1-201ENST00000421832 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
CTU1-201ENST00000421832 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
CTU1-201ENST00000421832 KAZNQ674X7 775 aa25.17■■□□□ 1.62
CTU1-201ENST00000421832 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
CTU1-201ENST00000421832 PYROXD2Q8N2H3 581 aa25.17■■□□□ 1.62
CTU1-201ENST00000421832 ARHGAP18Q8N392 663 aa25.17■■□□□ 1.62
CTU1-201ENST00000421832 TEKT4Q8WW24 435 aa25.17■■□□□ 1.62
CTU1-201ENST00000421832 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
CTU1-201ENST00000421832 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa25.17■■□□□ 1.62
CTU1-201ENST00000421832 MSRAQ9UJ68 235 aa25.17■■□□□ 1.62
CTU1-201ENST00000421832 MAFFQ9ULX9 164 aa25.17■■□□□ 1.62
CTU1-201ENST00000421832 AP4E1Q9UPM8 1137 aa25.17■■□□□ 1.62
CTU1-201ENST00000421832 OBSL1O75147 1896 aa25.17■■□□□ 1.62
CTU1-201ENST00000421832 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa25.17■■□□□ 1.62
CTU1-201ENST00000421832 C8AP07357 584 aa25.17■■□□□ 1.62
CTU1-201ENST00000421832 ABL2P42684 1182 aa25.17■■□□□ 1.62
CTU1-201ENST00000421832 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
CTU1-201ENST00000421832 LBRQ14739 615 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
CTU1-201ENST00000421832 GDPD5Q8WTR4 605 aa25.17■■□□□ 1.62
CTU1-201ENST00000421832 RNF139Q8WU17 664 aa25.17■■□□□ 1.62
CTU1-201ENST00000421832 MYRFLQ96LU7 910 aa25.17■■□□□ 1.62
CTU1-201ENST00000421832 DPH5Q9H2P9 285 aa25.17■■□□□ 1.62
CTU1-201ENST00000421832 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
CTU1-201ENST00000421832 MTMR10Q9NXD2 777 aa25.17■■□□□ 1.62
CTU1-201ENST00000421832 CLIC5Q9NZA1 410 aa25.17■■□□□ 1.62
CTU1-201ENST00000421832 FZD10Q9ULW2 581 aa25.17■■□□□ 1.62
CTU1-201ENST00000421832 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa25.17■■□□□ 1.62
CTU1-201ENST00000421832 PER2O15055 1255 aa25.16■■□□□ 1.62
CTU1-201ENST00000421832 IRAK2O43187 625 aa25.16■■□□□ 1.62
CTU1-201ENST00000421832 SHBGP04278 402 aa25.16■■□□□ 1.62
CTU1-201ENST00000421832 KRT16P08779 473 aa25.16■■□□□ 1.62
CTU1-201ENST00000421832 CXCR3P49682 368 aa25.16■■□□□ 1.62
CTU1-201ENST00000421832 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
CTU1-201ENST00000421832 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
CTU1-201ENST00000421832 DPYSL3Q14195 570 aa25.16■■□□□ 1.62
CTU1-201ENST00000421832 TAF11Q15544 211 aa25.16■■□□□ 1.62
CTU1-201ENST00000421832 CALN1Q9BXU9 219 aa25.16■■□□□ 1.62
CTU1-201ENST00000421832 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa25.16■■□□□ 1.62
CTU1-201ENST00000421832 YIPF3Q9GZM5 350 aa25.16■■□□□ 1.62
CTU1-201ENST00000421832 PCDH18Q9HCL0 1135 aa25.16■■□□□ 1.62
CTU1-201ENST00000421832 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
CTU1-201ENST00000421832 CCNB1P14635 433 aa25.16■■□□□ 1.62
CTU1-201ENST00000421832 IL4RP24394 825 aa25.16■■□□□ 1.62
CTU1-201ENST00000421832 RPS6KA3P51812 740 aa25.16■■□□□ 1.62
CTU1-201ENST00000421832 EPHB3P54753 998 aa25.16■■□□□ 1.62
CTU1-201ENST00000421832 VEPH1Q14D04 833 aa25.16■■□□□ 1.62
CTU1-201ENST00000421832 RAB30Q15771 203 aa25.16■■□□□ 1.62
CTU1-201ENST00000421832 TAZQ16635 292 aa25.16■■□□□ 1.62
CTU1-201ENST00000421832 MSANTD2Q6P1R3 559 aa25.16■■□□□ 1.62
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