RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398571.6

USP34-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 34, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene USP34, Length 11,357 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34-201ENST00000398571 EP400NLQ6ZTU2 488 aa4.54□□□□□ -1.68
USP34-201ENST00000398571 ZNF516Q92618 1163 aa4.54□□□□□ -1.68
USP34-201ENST00000398571 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
USP34-201ENST00000398571 SNX27Q96L92 541 aa4.54□□□□□ -1.68
USP34-201ENST00000398571 GPR20Q99678 358 aa4.54□□□□□ -1.68
USP34-201ENST00000398571 DOK1Q99704 481 aa4.54□□□□□ -1.68
USP34-201ENST00000398571 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
USP34-201ENST00000398571 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
USP34-201ENST00000398571 USP29Q9HBJ7 922 aa4.54□□□□□ -1.68
USP34-201ENST00000398571 MTMR10Q9NXD2 777 aa4.54□□□□□ -1.68
USP34-201ENST00000398571 ETAA1Q9NY74 926 aa4.54□□□□□ -1.68
USP34-201ENST00000398571 F8VP50 259 aa4.54□□□□□ -1.68
USP34-201ENST00000398571 HUS1O60921 280 aa4.54□□□□□ -1.68
USP34-201ENST00000398571 ANXA9O76027 345 aa4.54□□□□□ -1.68
USP34-201ENST00000398571 RPSAP08865 295 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
USP34-201ENST00000398571 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
USP34-201ENST00000398571 AMHR2Q16671 573 aa4.54□□□□□ -1.68
USP34-201ENST00000398571 PCID2Q5JVF3 399 aa4.54□□□□□ -1.68
USP34-201ENST00000398571 ABCD2Q9UBJ2 740 aa4.54□□□□□ -1.68
USP34-201ENST00000398571 GOLGA8JA6NMD2 632 aa4.54□□□□□ -1.68
USP34-201ENST00000398571 SLC16A4O15374 487 aa4.54□□□□□ -1.68
USP34-201ENST00000398571 PSMG1O95456 288 aa4.54□□□□□ -1.68
USP34-201ENST00000398571 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP4.54□□□□□ -1.68
USP34-201ENST00000398571 FCGR1AP12314 374 aa4.54□□□□□ -1.68
USP34-201ENST00000398571 ADAM17P78536 824 aa4.54□□□□□ -1.68
USP34-201ENST00000398571 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
USP34-201ENST00000398571 ARID5AQ03989 594 aa4.54□□□□□ -1.68
USP34-201ENST00000398571 PCDH1Q08174 1060 aa4.54□□□□□ -1.68
USP34-201ENST00000398571 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
USP34-201ENST00000398571 MYBPC3Q14896 1274 aa4.54□□□□□ -1.68
USP34-201ENST00000398571 RHPN2Q8IUC4 686 aa4.54□□□□□ -1.68
USP34-201ENST00000398571 RDH13Q8NBN7 331 aa4.54□□□□□ -1.68
USP34-201ENST00000398571 PAPD5Q8NDF8 572 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
USP34-201ENST00000398571 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP4.54□□□□□ -1.682e-6■■■□□ 17.7
USP34-201ENST00000398571 TTC1Q99614 292 aa4.54□□□□□ -1.68
USP34-201ENST00000398571 ACBD6Q9BR61 282 aa4.54□□□□□ -1.68
USP34-201ENST00000398571 FAM213AQ9BRX8 229 aa4.54□□□□□ -1.68
USP34-201ENST00000398571 ECT2Q9H8V3 914 aa4.54□□□□□ -1.68
USP34-201ENST00000398571 TBCCD1Q9NVR7 557 aa4.54□□□□□ -1.68
USP34-201ENST00000398571 FRMPD3Q5JV73 1810 aa4.54□□□□□ -1.68
USP34-201ENST00000398571 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
USP34-201ENST00000398571 A8MUI8 341 aa4.54□□□□□ -1.68
USP34-201ENST00000398571 KPNA6O60684 536 aa4.54□□□□□ -1.68
USP34-201ENST00000398571 E2F5Q15329 346 aa4.54□□□□□ -1.68
USP34-201ENST00000398571 ANO4Q32M45 955 aa4.54□□□□□ -1.68
USP34-201ENST00000398571 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
USP34-201ENST00000398571 KAT5Q92993 513 aa4.54□□□□□ -1.68
USP34-201ENST00000398571 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
USP34-201ENST00000398571 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
USP34-201ENST00000398571 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa4.54□□□□□ -1.68
USP34-201ENST00000398571 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
USP34-201ENST00000398571 CCDC162PA2VCL2 907 aa4.54□□□□□ -1.68
USP34-201ENST00000398571 YDJCA8MPS7 323 aa4.54□□□□□ -1.68
USP34-201ENST00000398571 TCP11X1B4DZS4 312 aa4.54□□□□□ -1.68
USP34-201ENST00000398571 PIK3R2O00459 728 aa4.54□□□□□ -1.68
USP34-201ENST00000398571 ENTPD5O75356 428 aa4.54□□□□□ -1.68
USP34-201ENST00000398571 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
USP34-201ENST00000398571 NDST2P52849 883 aa4.54□□□□□ -1.68
USP34-201ENST00000398571 PRKAA1Q13131 559 aa4.54□□□□□ -1.68
USP34-201ENST00000398571 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
USP34-201ENST00000398571 AP1ARQ63HQ0 302 aa4.54□□□□□ -1.68
USP34-201ENST00000398571 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
USP34-201ENST00000398571 PLD5Q8N7P1 536 aa4.54□□□□□ -1.68
USP34-201ENST00000398571 TADA1Q96BN2 335 aa4.54□□□□□ -1.68
USP34-201ENST00000398571 NPY6RQ99463 290 aa4.54□□□□□ -1.68
USP34-201ENST00000398571 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
USP34-201ENST00000398571 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
USP34-201ENST00000398571 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
USP34-201ENST00000398571 BAIAP3O94812 1187 aa4.54□□□□□ -1.68
USP34-201ENST00000398571 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
USP34-201ENST00000398571 TAF6P49848 677 aa4.54□□□□□ -1.68
USP34-201ENST00000398571 TEKQ02763 1124 aa4.54□□□□□ -1.68
USP34-201ENST00000398571 PTK7Q13308 1070 aa4.54□□□□□ -1.68
USP34-201ENST00000398571 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
USP34-201ENST00000398571 KIFC1Q9BW19 673 aa4.54□□□□□ -1.68
USP34-201ENST00000398571 CEP44Q9C0F1 390 aa4.54□□□□□ -1.68
USP34-201ENST00000398571 NMRK1Q9NWW6 199 aa4.54□□□□□ -1.68
USP34-201ENST00000398571 KLHL42Q9P2K6 505 aa4.54□□□□□ -1.68
USP34-201ENST00000398571 SERTM1A2A2V5 107 aa4.54□□□□□ -1.68
USP34-201ENST00000398571 AP2A1O95782 977 aa4.54□□□□□ -1.68
USP34-201ENST00000398571 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
USP34-201ENST00000398571 SULT2A1Q06520 285 aa4.54□□□□□ -1.68
USP34-201ENST00000398571 LRRC14Q15048 493 aa4.54□□□□□ -1.68
USP34-201ENST00000398571 CES4AQ5XG92 561 aa4.54□□□□□ -1.68
USP34-201ENST00000398571 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
USP34-201ENST00000398571 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
USP34-201ENST00000398571 ZNF639Q9UID6 485 aa4.54□□□□□ -1.68
USP34-201ENST00000398571 LCTP09848 1927 aa4.54□□□□□ -1.68
USP34-201ENST00000398571 A0A1W2PQ67 120 aa4.54□□□□□ -1.68
USP34-201ENST00000398571 CA12O43570 354 aa4.54□□□□□ -1.68
USP34-201ENST00000398571 PLIN3O60664 434 aa4.54□□□□□ -1.68
USP34-201ENST00000398571 ACSL3O95573 720 aa4.54□□□□□ -1.68
USP34-201ENST00000398571 NCAM1P13591 858 aa4.54□□□□□ -1.68
USP34-201ENST00000398571 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
USP34-201ENST00000398571 CLCN4P51793 760 aa4.54□□□□□ -1.68
USP34-201ENST00000398571 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
USP34-201ENST00000398571 TXNDC11Q6PKC3 985 aa4.54□□□□□ -1.68
USP34-201ENST00000398571 FAM47EQ6ZV65 393 aa4.54□□□□□ -1.68
USP34-201ENST00000398571 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
USP34-201ENST00000398571 FCRL5Q96RD9 977 aa4.54□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.6 ms