RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398073.6

CTDSP2-201, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDSP2, Length 4,795 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-201ENST00000398073 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
CTDSP2-201ENST00000398073 MORF4L1Q9UBU8 362 aa16.73■□□□□ 0.27
CTDSP2-201ENST00000398073 RAD54BQ9Y620 910 aa16.73■□□□□ 0.27
CTDSP2-201ENST00000398073 CREB1P16220 341 aa16.73■□□□□ 0.27
CTDSP2-201ENST00000398073 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
CTDSP2-201ENST00000398073 PTPN20Q4JDL3 420 aa16.73■□□□□ 0.27
CTDSP2-201ENST00000398073 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
CTDSP2-201ENST00000398073 CPT1BQ92523 772 aa16.73■□□□□ 0.27
CTDSP2-201ENST00000398073 AKT1S1Q96B36 256 aa16.73■□□□□ 0.27
CTDSP2-201ENST00000398073 HSFY1Q96LI6 401 aa16.73■□□□□ 0.27
CTDSP2-201ENST00000398073 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
CTDSP2-201ENST00000398073 BPGMP07738 259 aa16.72■□□□□ 0.27
CTDSP2-201ENST00000398073 NOS2P35228 1153 aa16.72■□□□□ 0.27
CTDSP2-201ENST00000398073 CDKN2BP42772 138 aa16.72■□□□□ 0.27
CTDSP2-201ENST00000398073 CRADDP78560 199 aa16.72■□□□□ 0.27
CTDSP2-201ENST00000398073 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
CTDSP2-201ENST00000398073 TAF2Q6P1X5 1199 aa16.72■□□□□ 0.27
CTDSP2-201ENST00000398073 HORMAD1Q86X24 394 aa16.72■□□□□ 0.27
CTDSP2-201ENST00000398073 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP16.72■□□□□ 0.27
CTDSP2-201ENST00000398073 MECRQ9BV79 373 aa16.72■□□□□ 0.27
CTDSP2-201ENST00000398073 MUC3BQ9H195 1237 aa16.72■□□□□ 0.27
CTDSP2-201ENST00000398073 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
CTDSP2-201ENST00000398073 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
CTDSP2-201ENST00000398073 CCDC167Q9P0B6 97 aa16.72■□□□□ 0.27
CTDSP2-201ENST00000398073 ITGA2BP08514 1039 aa16.72■□□□□ 0.27
CTDSP2-201ENST00000398073 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
CTDSP2-201ENST00000398073 PDK3Q15120 406 aa16.72■□□□□ 0.27
CTDSP2-201ENST00000398073 SLC35G1Q2M3R5 365 aa16.72■□□□□ 0.27
CTDSP2-201ENST00000398073 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa16.72■□□□□ 0.27
CTDSP2-201ENST00000398073 CACHD1Q5VU97 1274 aa16.72■□□□□ 0.27
CTDSP2-201ENST00000398073 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP16.72■□□□□ 0.27
CTDSP2-201ENST00000398073 OR52K1Q8NGK4 314 aa16.72■□□□□ 0.27
CTDSP2-201ENST00000398073 PIK3R5Q8WYR1 880 aa16.72■□□□□ 0.27
CTDSP2-201ENST00000398073 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP16.72■□□□□ 0.27
CTDSP2-201ENST00000398073 APOL5Q9BWW9 433 aa16.72■□□□□ 0.27
CTDSP2-201ENST00000398073 ARHGEF3Q9NR81 526 aa16.72■□□□□ 0.27
CTDSP2-201ENST00000398073 PLLPQ9Y342 182 aa16.72■□□□□ 0.27
CTDSP2-201ENST00000398073 C17orf102A2RUQ5 167 aa16.72■□□□□ 0.27
CTDSP2-201ENST00000398073 FOXO6A8MYZ6 492 aa16.72■□□□□ 0.27
CTDSP2-201ENST00000398073 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa16.72■□□□□ 0.27
CTDSP2-201ENST00000398073 HDAC3O15379 428 aa16.72■□□□□ 0.27
CTDSP2-201ENST00000398073 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
CTDSP2-201ENST00000398073 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
CTDSP2-201ENST00000398073 THP07101 528 aa16.72■□□□□ 0.27
CTDSP2-201ENST00000398073 BLMHQ13867 455 aa16.72■□□□□ 0.27
CTDSP2-201ENST00000398073 SGO1Q5FBB7 561 aa16.72■□□□□ 0.27
CTDSP2-201ENST00000398073 HOMEZQ8IX15 550 aa16.72■□□□□ 0.27
CTDSP2-201ENST00000398073 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP16.72■□□□□ 0.27
CTDSP2-201ENST00000398073 NT5MQ9NPB1 228 aa16.72■□□□□ 0.27
CTDSP2-201ENST00000398073 NDUFAF1Q9Y375 327 aa16.72■□□□□ 0.27
CTDSP2-201ENST00000398073 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa16.72■□□□□ 0.27
CTDSP2-201ENST00000398073 RGSL1A5PLK6 1076 aa16.72■□□□□ 0.27
CTDSP2-201ENST00000398073 CLOCKO15516 846 aa16.72■□□□□ 0.27
CTDSP2-201ENST00000398073 AVILO75366 819 aa16.72■□□□□ 0.27
CTDSP2-201ENST00000398073 TCEA3O75764 348 aa16.72■□□□□ 0.27
CTDSP2-201ENST00000398073 CCNE2O96020 404 aa16.72■□□□□ 0.27
CTDSP2-201ENST00000398073 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP16.72■□□□□ 0.272e-7■■■□□ 14.7
CTDSP2-201ENST00000398073 SERPINB1P30740 379 aa16.72■□□□□ 0.27
CTDSP2-201ENST00000398073 XIAPP98170 497 aa16.72■□□□□ 0.27
CTDSP2-201ENST00000398073 GRIK4Q16099 956 aa16.72■□□□□ 0.27
CTDSP2-201ENST00000398073 MGAT5BQ3V5L5 792 aa16.72■□□□□ 0.27
CTDSP2-201ENST00000398073 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP16.72■□□□□ 0.27
CTDSP2-201ENST00000398073 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa16.72■□□□□ 0.27
CTDSP2-201ENST00000398073 ZNF410Q86VK4 478 aa16.72■□□□□ 0.27
CTDSP2-201ENST00000398073 OSCP1Q8WVF1 389 aa16.72■□□□□ 0.27
CTDSP2-201ENST00000398073 USP6NLQ92738 828 aa16.72■□□□□ 0.27
CTDSP2-201ENST00000398073 WNT8BQ93098 351 aa16.72■□□□□ 0.27
CTDSP2-201ENST00000398073 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP16.72■□□□□ 0.27
CTDSP2-201ENST00000398073 POPDC2Q9HBU9 364 aa16.72■□□□□ 0.27
CTDSP2-201ENST00000398073 COQ4Q9Y3A0 265 aa16.72■□□□□ 0.27
CTDSP2-201ENST00000398073 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa16.71■□□□□ 0.27
CTDSP2-201ENST00000398073 TMEM114B3SHH9 223 aa16.71■□□□□ 0.27
CTDSP2-201ENST00000398073 BAIAP3O94812 1187 aa16.71■□□□□ 0.27
CTDSP2-201ENST00000398073 CETPP11597 493 aa16.71■□□□□ 0.27
CTDSP2-201ENST00000398073 CCR1P32246 355 aa16.71■□□□□ 0.27
CTDSP2-201ENST00000398073 ARHGAP8P85298 464 aa16.71■□□□□ 0.27
CTDSP2-201ENST00000398073 GALNTL6Q49A17 601 aa16.71■□□□□ 0.27
CTDSP2-201ENST00000398073 UNC5AQ6ZN44 842 aa16.71■□□□□ 0.27
CTDSP2-201ENST00000398073 KIAA2013Q8IYS2 634 aa16.71■□□□□ 0.27
CTDSP2-201ENST00000398073 EDEM1Q92611 657 aa16.71■□□□□ 0.27
CTDSP2-201ENST00000398073 SLCO2A1Q92959 643 aa16.71■□□□□ 0.27
CTDSP2-201ENST00000398073 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP16.71■□□□□ 0.27
CTDSP2-201ENST00000398073 RNPEPQ9H4A4 650 aa16.71■□□□□ 0.27
CTDSP2-201ENST00000398073 ZNF556Q9HAH1 456 aa16.71■□□□□ 0.27
CTDSP2-201ENST00000398073 PDGFCQ9NRA1 345 aa16.71■□□□□ 0.27
CTDSP2-201ENST00000398073 DUOX1Q9NRD9 1551 aa16.71■□□□□ 0.27
CTDSP2-201ENST00000398073 A0A087WXM4 84 aa16.71■□□□□ 0.27
CTDSP2-201ENST00000398073 GOLGA8TH3BQL2 631 aa16.71■□□□□ 0.27
CTDSP2-201ENST00000398073 PMM2O15305 246 aa16.71■□□□□ 0.27
CTDSP2-201ENST00000398073 ASMTLO95671 621 aa16.71■□□□□ 0.27
CTDSP2-201ENST00000398073 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP16.71■□□□□ 0.27
CTDSP2-201ENST00000398073 MARC1Q5VT66 337 aa16.71■□□□□ 0.27
CTDSP2-201ENST00000398073 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP16.71■□□□□ 0.27
CTDSP2-201ENST00000398073 BTBD7Q9P203 1132 aa16.71■□□□□ 0.27
CTDSP2-201ENST00000398073 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa16.71■□□□□ 0.27
CTDSP2-201ENST00000398073 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa16.71■□□□□ 0.27
CTDSP2-201ENST00000398073 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP16.71■□□□□ 0.27
CTDSP2-201ENST00000398073 RPL5P46777 297 aaKnown RBP16.71■□□□□ 0.27
CTDSP2-201ENST00000398073 HARS2P49590 506 aaKnown RBP16.71■□□□□ 0.27
CTDSP2-201ENST00000398073 GTF2H3Q13889 308 aa16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.8 ms