RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379615.3

PGGT1B-202, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 903 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 CCP110O43303 1012 aa15.88■□□□□ 0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 CLDN11O75508 207 aa15.88■□□□□ 0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 CDC25BP30305 580 aa15.88■□□□□ 0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 HOXA6P31267 233 aa15.88■□□□□ 0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 TIE1P35590 1138 aa15.88■□□□□ 0.13
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PGGT1B-202ENST00000379615 HDAC4P56524 1084 aa15.88■□□□□ 0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 SLC12A1Q13621 1099 aa15.88■□□□□ 0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 DMC1Q14565 340 aa15.88■□□□□ 0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa15.88■□□□□ 0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 CHST9Q7L1S5 443 aa15.88■□□□□ 0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 ASCL5Q7RTU5 278 aa15.88■□□□□ 0.13
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PGGT1B-202ENST00000379615 CAMKK1Q8N5S9 505 aa15.88■□□□□ 0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP15.88■□□□□ 0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 TC2NQ8N9U0 490 aa15.88■□□□□ 0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 P2RY11Q96G91 374 aa15.88■□□□□ 0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 CHP1Q99653 195 aa15.88■□□□□ 0.13
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PGGT1B-202ENST00000379615 THAP2Q9H0W7 228 aa15.88■□□□□ 0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 OSBPL2Q9H1P3 480 aa15.88■□□□□ 0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 ABCB8Q9NUT2 735 aa15.88■□□□□ 0.13
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PGGT1B-202ENST00000379615 CLEC4EQ9ULY5 219 aa15.88■□□□□ 0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 MMP17Q9ULZ9 603 aa15.88■□□□□ 0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 PLA2G4CQ9UP65 541 aa15.88■□□□□ 0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 PIEZO1Q92508 2521 aa15.87■□□□□ 0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 PRRT4C9JH25 899 aa15.87■□□□□ 0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 CYP1A2P05177 515 aa15.87■□□□□ 0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 SP9P0CG40 484 aa15.87■□□□□ 0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP15.87■□□□□ 0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 HLA-FP30511 346 aa15.87■□□□□ 0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 NTSR1P30989 418 aa15.87■□□□□ 0.13
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PGGT1B-202ENST00000379615 CDH4P55283 916 aa15.87■□□□□ 0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 SATB1Q01826 763 aa15.87■□□□□ 0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 SCAPQ12770 1279 aa15.87■□□□□ 0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
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PGGT1B-202ENST00000379615 C5orf22Q49AR2 442 aa15.87■□□□□ 0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 EFHC2Q5JST6 749 aa15.87■□□□□ 0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 EMC10Q5UCC4 262 aa15.87■□□□□ 0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 CCDC170Q8IYT3 715 aa15.87■□□□□ 0.13
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PGGT1B-202ENST00000379615 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 CCDC33Q8N5R6 958 aa15.87■□□□□ 0.13
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PGGT1B-202ENST00000379615 IL17RCQ8NAC3 791 aa15.87■□□□□ 0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 NUP85Q9BW27 656 aa15.87■□□□□ 0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 RETREG1Q9H6L5 497 aa15.87■□□□□ 0.13
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PGGT1B-202ENST00000379615 UVRAGQ9P2Y5 699 aa15.87■□□□□ 0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 OR12D3Q9UGF7 316 aa15.87■□□□□ 0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 IP6K2Q9UHH9 426 aa15.87■□□□□ 0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 NENFQ9UMX5 172 aa15.87■□□□□ 0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 DRGXA6NNA5 263 aa15.86■□□□□ 0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 E9PAM4 449 aa15.86■□□□□ 0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 MYO1FO00160 1098 aa15.86■□□□□ 0.13
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PGGT1B-202ENST00000379615 ALDH1A2O94788 518 aa15.86■□□□□ 0.13
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PGGT1B-202ENST00000379615 CRY1Q16526 586 aa15.86■□□□□ 0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 PKN3Q6P5Z2 889 aa15.86■□□□□ 0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 TMTC1Q8IUR5 882 aa15.86■□□□□ 0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 SFTPA1Q8IWL2 248 aa15.86■□□□□ 0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 ATRIPQ8WXE1 791 aa15.86■□□□□ 0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 IGSF8Q969P0 613 aa15.86■□□□□ 0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 MYEOVQ96EZ4 313 aa15.86■□□□□ 0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 ANLNQ9NQW6 1124 aa15.86■□□□□ 0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 ZSCAN32Q9NX65 697 aa15.86■□□□□ 0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa15.86■□□□□ 0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa15.85■□□□□ 0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa15.85■□□□□ 0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa15.85■□□□□ 0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 PRPSAP2O60256 369 aa15.85■□□□□ 0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 APBB3O95704 486 aa15.85■□□□□ 0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 ASLP04424 464 aa15.85■□□□□ 0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 TMEM253P0C7T8 217 aa15.85■□□□□ 0.13
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