RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376215.9

PDSS1-201, Transcript of decaprenyl diphosphate synthase subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDSS1, Length 1,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDSS1-201ENST00000376215 RUNX3Q13761 415 aa24.28■■□□□ 1.48
PDSS1-201ENST00000376215 PDK2Q15119 407 aa24.28■■□□□ 1.48
PDSS1-201ENST00000376215 RPS6KA1Q15418 735 aa24.28■■□□□ 1.48
PDSS1-201ENST00000376215 ALFQ53S48 1182 aa24.28■■□□□ 1.48
PDSS1-201ENST00000376215 UBL4BQ8N7F7 174 aa24.28■■□□□ 1.48
PDSS1-201ENST00000376215 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
PDSS1-201ENST00000376215 DDI1Q8WTU0 396 aa24.28■■□□□ 1.48
PDSS1-201ENST00000376215 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
PDSS1-201ENST00000376215 TBC1D31Q96DN5 1066 aa24.28■■□□□ 1.48
PDSS1-201ENST00000376215 CSPG4P5Q96PW8 444 aa24.28■■□□□ 1.48
PDSS1-201ENST00000376215 CALN1Q9BXU9 219 aa24.28■■□□□ 1.48
PDSS1-201ENST00000376215 MARK1Q9P0L2 795 aa24.28■■□□□ 1.48
PDSS1-201ENST00000376215 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
PDSS1-201ENST00000376215 TBL1XO60907 577 aa24.28■■□□□ 1.48
PDSS1-201ENST00000376215 PENKP01210 267 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
PDSS1-201ENST00000376215 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
PDSS1-201ENST00000376215 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
PDSS1-201ENST00000376215 RWDD2BP57060 319 aa24.28■■□□□ 1.48
PDSS1-201ENST00000376215 TPI1P60174 286 aa24.28■■□□□ 1.48
PDSS1-201ENST00000376215 DPYSQ14117 519 aa24.28■■□□□ 1.48
PDSS1-201ENST00000376215 GAB4Q2WGN9 574 aa24.28■■□□□ 1.48
PDSS1-201ENST00000376215 MPPE1Q53F39 396 aa24.28■■□□□ 1.48
PDSS1-201ENST00000376215 RABGAP1LQ5R372 815 aa24.28■■□□□ 1.48
PDSS1-201ENST00000376215 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
PDSS1-201ENST00000376215 MFSD7Q6UXD7 560 aa24.28■■□□□ 1.48
PDSS1-201ENST00000376215 RFX8Q6ZV50 586 aa24.28■■□□□ 1.48
PDSS1-201ENST00000376215 EXD1Q8NHP7 514 aa24.28■■□□□ 1.48
PDSS1-201ENST00000376215 TTC8Q8TAM2 541 aa24.28■■□□□ 1.48
PDSS1-201ENST00000376215 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa24.28■■□□□ 1.48
PDSS1-201ENST00000376215 BBS2Q9BXC9 721 aa24.28■■□□□ 1.48
PDSS1-201ENST00000376215 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa24.27■■□□□ 1.48
PDSS1-201ENST00000376215 NUP205Q92621 2012 aa24.27■■□□□ 1.48
PDSS1-201ENST00000376215 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa24.27■■□□□ 1.48
PDSS1-201ENST00000376215 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP24.27■■□□□ 1.48
PDSS1-201ENST00000376215 ADH1CP00326 375 aa24.27■■□□□ 1.48
PDSS1-201ENST00000376215 MSNP26038 577 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
PDSS1-201ENST00000376215 EPHB2P29323 1055 aa24.27■■□□□ 1.48
PDSS1-201ENST00000376215 HCAR3P49019 387 aa24.27■■□□□ 1.48
PDSS1-201ENST00000376215 ANO4Q32M45 955 aa24.27■■□□□ 1.48
PDSS1-201ENST00000376215 RNF43Q68DV7 783 aa24.27■■□□□ 1.48
PDSS1-201ENST00000376215 AADACL2Q6P093 401 aa24.27■■□□□ 1.48
PDSS1-201ENST00000376215 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
PDSS1-201ENST00000376215 ZYG11BQ9C0D3 744 aa24.27■■□□□ 1.48
PDSS1-201ENST00000376215 STIM2Q9P246 746 aa24.27■■□□□ 1.48
PDSS1-201ENST00000376215 ZNF212Q9UDV6 495 aa24.27■■□□□ 1.48
PDSS1-201ENST00000376215 CLEC4EQ9ULY5 219 aa24.27■■□□□ 1.48
PDSS1-201ENST00000376215 CHD5Q8TDI0 1954 aa24.26■■□□□ 1.47
PDSS1-201ENST00000376215 H3BRJ5 948 aa24.26■■□□□ 1.47
PDSS1-201ENST00000376215 CYBBP04839 570 aa24.26■■□□□ 1.47
PDSS1-201ENST00000376215 PYGMP11217 842 aa24.26■■□□□ 1.47
PDSS1-201ENST00000376215 ADH5P11766 374 aa24.26■■□□□ 1.47
PDSS1-201ENST00000376215 TYRP14679 529 aa24.26■■□□□ 1.47
PDSS1-201ENST00000376215 HTR7P34969 479 aa24.26■■□□□ 1.47
PDSS1-201ENST00000376215 ARL4AP40617 200 aa24.26■■□□□ 1.47
PDSS1-201ENST00000376215 CDKN2BP42772 138 aa24.26■■□□□ 1.47
PDSS1-201ENST00000376215 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP24.26■■□□□ 1.47
PDSS1-201ENST00000376215 ETF1P62495 437 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
PDSS1-201ENST00000376215 TAZQ16635 292 aa24.26■■□□□ 1.47
PDSS1-201ENST00000376215 MPP7Q5T2T1 576 aa24.26■■□□□ 1.47
PDSS1-201ENST00000376215 NLRP14Q86W24 1093 aa24.26■■□□□ 1.47
PDSS1-201ENST00000376215 MAP7D3Q8IWC1 876 aa24.26■■□□□ 1.47
PDSS1-201ENST00000376215 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP24.26■■□□□ 1.47
PDSS1-201ENST00000376215 RCOR2Q8IZ40 523 aa24.26■■□□□ 1.47
PDSS1-201ENST00000376215 CPA6Q8N4T0 437 aa24.26■■□□□ 1.47
PDSS1-201ENST00000376215 FAF2Q96CS3 445 aa24.26■■□□□ 1.47
PDSS1-201ENST00000376215 CHFRQ96EP1 664 aa24.26■■□□□ 1.47
PDSS1-201ENST00000376215 PSMB7Q99436 277 aa24.26■■□□□ 1.47
PDSS1-201ENST00000376215 ZNF670Q9BS34 389 aa24.26■■□□□ 1.47
PDSS1-201ENST00000376215 CD320Q9NPF0 282 aa24.26■■□□□ 1.47
PDSS1-201ENST00000376215 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP24.26■■□□□ 1.47
PDSS1-201ENST00000376215 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
PDSS1-201ENST00000376215 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
PDSS1-201ENST00000376215 LLGL1Q15334 1064 aa24.25■■□□□ 1.47
PDSS1-201ENST00000376215 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa24.25■■□□□ 1.47
PDSS1-201ENST00000376215 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
PDSS1-201ENST00000376215 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa24.25■■□□□ 1.47
PDSS1-201ENST00000376215 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa24.25■■□□□ 1.47
PDSS1-201ENST00000376215 RNF135Q8IUD6 432 aa24.25■■□□□ 1.47
PDSS1-201ENST00000376215 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
PDSS1-201ENST00000376215 TRPV5Q9NQA5 729 aa24.25■■□□□ 1.47
PDSS1-201ENST00000376215 ARHGEF4Q9NR80 690 aa24.25■■□□□ 1.47
PDSS1-201ENST00000376215 A0A0C4DFX4 3053 aa24.25■■□□□ 1.47
PDSS1-201ENST00000376215 A0A1B0GVM2 712 aa24.24■■□□□ 1.47
PDSS1-201ENST00000376215 TCAF2A6NFQ2 919 aa24.24■■□□□ 1.47
PDSS1-201ENST00000376215 SRFP11831 508 aa24.24■■□□□ 1.47
PDSS1-201ENST00000376215 AMPD1P23109 780 aa24.24■■□□□ 1.47
PDSS1-201ENST00000376215 GAD2Q05329 585 aa24.24■■□□□ 1.47
PDSS1-201ENST00000376215 ODF2Q5BJF6 829 aa24.24■■□□□ 1.47
PDSS1-201ENST00000376215 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa24.24■■□□□ 1.47
PDSS1-201ENST00000376215 C12orf40Q86WS4 652 aa24.24■■□□□ 1.47
PDSS1-201ENST00000376215 VSIG1Q86XK7 387 aa24.24■■□□□ 1.47
PDSS1-201ENST00000376215 PCDH19Q8TAB3 1148 aa24.24■■□□□ 1.47
PDSS1-201ENST00000376215 WFDC5Q8TCV5 224 aa24.24■■□□□ 1.47
PDSS1-201ENST00000376215 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
PDSS1-201ENST00000376215 NDFIP2Q9NV92 336 aa24.24■■□□□ 1.47
PDSS1-201ENST00000376215 ETNK2Q9NVF9 386 aa24.24■■□□□ 1.47
PDSS1-201ENST00000376215 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
PDSS1-201ENST00000376215 ZNF487B1APH4 448 aa24.24■■□□□ 1.47
PDSS1-201ENST00000376215 RHOQP17081 205 aa24.24■■□□□ 1.47
PDSS1-201ENST00000376215 ERCC2P18074 760 aa24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.7 ms