RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000371746.7

LHX3-201, Transcript of LIM homeobox 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LHX3, Length 2,403 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX3-201ENST00000371746 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.49
LHX3-201ENST00000371746 WDR27A2RRH5 827 aa24.39■■□□□ 1.49
LHX3-201ENST00000371746 UGT1A9O60656 530 aa24.39■■□□□ 1.49
LHX3-201ENST00000371746 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.49
LHX3-201ENST00000371746 APOEP02649 317 aa24.39■■□□□ 1.49
LHX3-201ENST00000371746 GARSP41250 739 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.49
LHX3-201ENST00000371746 CCL23P55773 120 aa24.39■■□□□ 1.49
LHX3-201ENST00000371746 SLC1A5Q15758 541 aa24.39■■□□□ 1.49
LHX3-201ENST00000371746 PIGWQ7Z7B1 504 aa24.39■■□□□ 1.49
LHX3-201ENST00000371746 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.49
LHX3-201ENST00000371746 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP24.39■■□□□ 1.49
LHX3-201ENST00000371746 AGAP3Q96P47 875 aa24.39■■□□□ 1.49
LHX3-201ENST00000371746 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.49
LHX3-201ENST00000371746 UGT1A7Q9HAW7 530 aa24.39■■□□□ 1.49
LHX3-201ENST00000371746 UGT1A10Q9HAW8 530 aa24.39■■□□□ 1.49
LHX3-201ENST00000371746 UGT1A8Q9HAW9 530 aa24.39■■□□□ 1.49
LHX3-201ENST00000371746 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa24.39■■□□□ 1.49
LHX3-201ENST00000371746 PITPNM1O00562 1244 aa24.38■■□□□ 1.49
LHX3-201ENST00000371746 CCR1P32246 355 aa24.38■■□□□ 1.49
LHX3-201ENST00000371746 SARNPP82979 210 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
LHX3-201ENST00000371746 CDK16Q00536 496 aa24.38■■□□□ 1.49
LHX3-201ENST00000371746 GALNT2Q10471 571 aa24.38■■□□□ 1.49
LHX3-201ENST00000371746 ZBTB17Q13105 803 aa24.38■■□□□ 1.49
LHX3-201ENST00000371746 LRRC6Q86X45 466 aa24.38■■□□□ 1.49
LHX3-201ENST00000371746 NUP93Q8N1F7 819 aa24.38■■□□□ 1.49
LHX3-201ENST00000371746 GORASP1Q9BQQ3 440 aa24.38■■□□□ 1.49
LHX3-201ENST00000371746 OSBPL2Q9H1P3 480 aa24.38■■□□□ 1.49
LHX3-201ENST00000371746 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa24.38■■□□□ 1.49
LHX3-201ENST00000371746 NUP205Q92621 2012 aa24.38■■□□□ 1.49
LHX3-201ENST00000371746 VWA8A3KMH1 1905 aa24.38■■□□□ 1.49
LHX3-201ENST00000371746 PATJQ8NI35 1801 aa24.38■■□□□ 1.49
LHX3-201ENST00000371746 NCAM2O15394 837 aa24.37■■□□□ 1.49
LHX3-201ENST00000371746 ALDH2P05091 517 aa24.37■■□□□ 1.49
LHX3-201ENST00000371746 CORO7P57737 925 aa24.37■■□□□ 1.49
LHX3-201ENST00000371746 IL9RQ01113 521 aa24.37■■□□□ 1.49
LHX3-201ENST00000371746 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
LHX3-201ENST00000371746 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
LHX3-201ENST00000371746 SAMD15Q9P1V8 674 aa24.37■■□□□ 1.49
LHX3-201ENST00000371746 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
LHX3-201ENST00000371746 TRIM66O15016 1216 aa24.37■■□□□ 1.49
LHX3-201ENST00000371746 KIAA0754O94854 1291 aa24.37■■□□□ 1.49
LHX3-201ENST00000371746 PRKCHP24723 683 aa24.37■■□□□ 1.49
LHX3-201ENST00000371746 SERPINB6P35237 376 aa24.37■■□□□ 1.49
LHX3-201ENST00000371746 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
LHX3-201ENST00000371746 SLC26A11Q86WA9 606 aa24.37■■□□□ 1.49
LHX3-201ENST00000371746 UNC5BQ8IZJ1 945 aa24.37■■□□□ 1.49
LHX3-201ENST00000371746 GSDMBQ8TAX9 411 aa24.37■■□□□ 1.49
LHX3-201ENST00000371746 SPOCK2Q92563 424 aa24.37■■□□□ 1.49
LHX3-201ENST00000371746 HDAC11Q96DB2 347 aa24.37■■□□□ 1.49
LHX3-201ENST00000371746 SERAC1Q96JX3 654 aa24.37■■□□□ 1.49
LHX3-201ENST00000371746 MAGEB18Q96M61 343 aa24.37■■□□□ 1.49
LHX3-201ENST00000371746 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
LHX3-201ENST00000371746 IGSF9Q9P2J2 1179 aa24.37■■□□□ 1.49
LHX3-201ENST00000371746 RAD54BQ9Y620 910 aa24.37■■□□□ 1.49
LHX3-201ENST00000371746 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
LHX3-201ENST00000371746 USP12O75317 370 aa24.36■■□□□ 1.49
LHX3-201ENST00000371746 CPB1P15086 417 aa24.36■■□□□ 1.49
LHX3-201ENST00000371746 MX2P20592 715 aa24.36■■□□□ 1.49
LHX3-201ENST00000371746 MGAT1P26572 445 aa24.36■■□□□ 1.49
LHX3-201ENST00000371746 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
LHX3-201ENST00000371746 BRMS1LQ5PSV4 323 aa24.36■■□□□ 1.49
LHX3-201ENST00000371746 ZNF280DQ6N043 979 aa24.36■■□□□ 1.49
LHX3-201ENST00000371746 CCDC197Q8NCU1 140 aa24.36■■□□□ 1.49
LHX3-201ENST00000371746 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa24.36■■□□□ 1.49
LHX3-201ENST00000371746 C8orf48Q96LL4 319 aa24.36■■□□□ 1.49
LHX3-201ENST00000371746 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
LHX3-201ENST00000371746 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
LHX3-201ENST00000371746 GMIPQ9P107 970 aa24.36■■□□□ 1.49
LHX3-201ENST00000371746 GGA2Q9UJY4 613 aa24.36■■□□□ 1.49
LHX3-201ENST00000371746 SCML2Q9UQR0 700 aa24.36■■□□□ 1.49
LHX3-201ENST00000371746 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa24.36■■□□□ 1.49
LHX3-201ENST00000371746 TBKBP1A7MCY6 615 aa24.36■■□□□ 1.49
LHX3-201ENST00000371746 MT-ND3P03897 115 aa24.36■■□□□ 1.49
LHX3-201ENST00000371746 CSH1P0DML2 217 aa24.36■■□□□ 1.49
LHX3-201ENST00000371746 CSH2P0DML3 217 aa24.36■■□□□ 1.49
LHX3-201ENST00000371746 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
LHX3-201ENST00000371746 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
LHX3-201ENST00000371746 RTP2Q5QGT7 225 aa24.36■■□□□ 1.49
LHX3-201ENST00000371746 FUT10Q6P4F1 479 aa24.36■■□□□ 1.49
LHX3-201ENST00000371746 LRRC8BQ6P9F7 803 aa24.36■■□□□ 1.49
LHX3-201ENST00000371746 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa24.36■■□□□ 1.49
LHX3-201ENST00000371746 CRISPLD1Q9H336 500 aa24.36■■□□□ 1.49
LHX3-201ENST00000371746 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
LHX3-201ENST00000371746 TAC1P20366 129 aa24.35■■□□□ 1.49
LHX3-201ENST00000371746 CD68P34810 354 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
LHX3-201ENST00000371746 SLC18A1P54219 525 aa24.35■■□□□ 1.49
LHX3-201ENST00000371746 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa24.35■■□□□ 1.49
LHX3-201ENST00000371746 MON1AQ86VX9 555 aa24.35■■□□□ 1.49
LHX3-201ENST00000371746 CRIPAKQ8N1N5 446 aa24.35■■□□□ 1.49
LHX3-201ENST00000371746 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP24.35■■□□□ 1.49
LHX3-201ENST00000371746 HAPLN3Q96S86 360 aa24.35■■□□□ 1.49
LHX3-201ENST00000371746 DFFAO00273 331 aa24.35■■□□□ 1.49
LHX3-201ENST00000371746 MLNP12872 115 aa24.35■■□□□ 1.49
LHX3-201ENST00000371746 FGFR3P22607 806 aa24.35■■□□□ 1.49
LHX3-201ENST00000371746 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
LHX3-201ENST00000371746 TAS1R1Q7RTX1 841 aa24.35■■□□□ 1.49
LHX3-201ENST00000371746 BANPQ8N9N5 519 aa24.35■■□□□ 1.49
LHX3-201ENST00000371746 RNF208Q9H0X6 261 aa24.35■■□□□ 1.49
LHX3-201ENST00000371746 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa24.35■■□□□ 1.49
LHX3-201ENST00000371746 SDR42E2A6NKP2 422 aa24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.4 ms