RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368045.3

CD48-201, Transcript of CD48 molecule, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CD48, Length 1,793 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD48-201ENST00000368045 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
CD48-201ENST00000368045 MXRA7P84157 204 aa14.66□□□□□ -0.06
CD48-201ENST00000368045 GLRA4Q5JXX5 417 aa14.66□□□□□ -0.06
CD48-201ENST00000368045 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
CD48-201ENST00000368045 IQSEC1Q6DN90 963 aa14.66□□□□□ -0.06
CD48-201ENST00000368045 RFX8Q6ZV50 586 aa14.66□□□□□ -0.06
CD48-201ENST00000368045 PIGZQ86VD9 579 aa14.66□□□□□ -0.06
CD48-201ENST00000368045 UNC5BQ8IZJ1 945 aa14.66□□□□□ -0.06
CD48-201ENST00000368045 ZNF567Q8N184 647 aa14.66□□□□□ -0.06
CD48-201ENST00000368045 CCDC33Q8N5R6 958 aa14.66□□□□□ -0.06
CD48-201ENST00000368045 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa14.66□□□□□ -0.06
CD48-201ENST00000368045 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
CD48-201ENST00000368045 WNT8BQ93098 351 aa14.66□□□□□ -0.06
CD48-201ENST00000368045 NTAN1Q96AB6 310 aa14.66□□□□□ -0.06
CD48-201ENST00000368045 FAM149B1Q96BN6 582 aa14.66□□□□□ -0.06
CD48-201ENST00000368045 PGBD4Q96DM1 585 aa14.66□□□□□ -0.06
CD48-201ENST00000368045 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
CD48-201ENST00000368045 EBF4Q9BQW3 602 aa14.66□□□□□ -0.06
CD48-201ENST00000368045 APOL6Q9BWW8 343 aa14.66□□□□□ -0.06
CD48-201ENST00000368045 PRDM12Q9H4Q4 367 aa14.66□□□□□ -0.06
CD48-201ENST00000368045 SETD4Q9NVD3 440 aa14.66□□□□□ -0.06
CD48-201ENST00000368045 COPG2Q9UBF2 871 aa14.66□□□□□ -0.06
CD48-201ENST00000368045 SLC7A8Q9UHI5 535 aa14.66□□□□□ -0.06
CD48-201ENST00000368045 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
CD48-201ENST00000368045 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
CD48-201ENST00000368045 DCLK1O15075 740 aa14.65□□□□□ -0.06
CD48-201ENST00000368045 HCRTO43612 131 aa14.65□□□□□ -0.06
CD48-201ENST00000368045 ITM2AO43736 263 aa14.65□□□□□ -0.06
CD48-201ENST00000368045 FBXO21O94952 628 aa14.65□□□□□ -0.06
CD48-201ENST00000368045 MPOP05164 745 aa14.65□□□□□ -0.06
CD48-201ENST00000368045 PDHA1P08559 390 aa14.65□□□□□ -0.06
CD48-201ENST00000368045 LINGO3P0C6S8 592 aa14.65□□□□□ -0.06
CD48-201ENST00000368045 NPR3P17342 541 aa14.65□□□□□ -0.06
CD48-201ENST00000368045 SMPD1P17405 629 aa14.65□□□□□ -0.06
CD48-201ENST00000368045 TKTP29401 623 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
CD48-201ENST00000368045 TYK2P29597 1187 aa14.65□□□□□ -0.06
CD48-201ENST00000368045 PRDX6P30041 224 aa14.65□□□□□ -0.06
CD48-201ENST00000368045 SCN1AP35498 2009 aa14.65□□□□□ -0.06
CD48-201ENST00000368045 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
CD48-201ENST00000368045 CRADDP78560 199 aa14.65□□□□□ -0.06
CD48-201ENST00000368045 ADIGQ0VDE8 80 aa14.65□□□□□ -0.06
CD48-201ENST00000368045 SCAPQ12770 1279 aa14.65□□□□□ -0.06
CD48-201ENST00000368045 HIC1Q14526 733 aa14.65□□□□□ -0.06
CD48-201ENST00000368045 DCAF6Q58WW2 860 aa14.65□□□□□ -0.06
CD48-201ENST00000368045 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
CD48-201ENST00000368045 CCNYQ8ND76 341 aa14.65□□□□□ -0.06
CD48-201ENST00000368045 NLGN2Q8NFZ4 835 aa14.65□□□□□ -0.06
CD48-201ENST00000368045 OR6Y1Q8NGX8 325 aa14.65□□□□□ -0.06
CD48-201ENST00000368045 FBXO27Q8NI29 283 aa14.65□□□□□ -0.06
CD48-201ENST00000368045 DTX3LQ8TDB6 740 aa14.65□□□□□ -0.06
CD48-201ENST00000368045 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
CD48-201ENST00000368045 NRCAMQ92823 1304 aa14.65□□□□□ -0.06
CD48-201ENST00000368045 PANX3Q96QZ0 392 aa14.65□□□□□ -0.06
CD48-201ENST00000368045 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
CD48-201ENST00000368045 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
CD48-201ENST00000368045 HES2Q9Y543 173 aa14.65□□□□□ -0.06
CD48-201ENST00000368045 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
CD48-201ENST00000368045 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
CD48-201ENST00000368045 AP2A1O95782 977 aa14.65□□□□□ -0.06
CD48-201ENST00000368045 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
CD48-201ENST00000368045 PRKCGP05129 697 aa14.65□□□□□ -0.06
CD48-201ENST00000368045 RALBP11234 206 aa14.65□□□□□ -0.06
CD48-201ENST00000368045 CPA3P15088 417 aa14.65□□□□□ -0.06
CD48-201ENST00000368045 KCNA4P22459 653 aa14.65□□□□□ -0.06
CD48-201ENST00000368045 COPAP53621 1224 aa14.65□□□□□ -0.06
CD48-201ENST00000368045 LIMK2P53671 638 aa14.65□□□□□ -0.06
CD48-201ENST00000368045 IRX4P78413 519 aa14.65□□□□□ -0.06
CD48-201ENST00000368045 DEUP1Q05D60 604 aa14.65□□□□□ -0.06
CD48-201ENST00000368045 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
CD48-201ENST00000368045 MDH1BQ5I0G3 518 aa14.65□□□□□ -0.06
CD48-201ENST00000368045 C1orf146Q5VVC0 180 aa14.65□□□□□ -0.06
CD48-201ENST00000368045 C10orf107Q8IVU9 208 aa14.65□□□□□ -0.06
CD48-201ENST00000368045 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa14.65□□□□□ -0.06
CD48-201ENST00000368045 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP14.65□□□□□ -0.06
CD48-201ENST00000368045 CMTM5Q96DZ9 223 aa14.65□□□□□ -0.06
CD48-201ENST00000368045 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
CD48-201ENST00000368045 SORT1Q99523 831 aa14.65□□□□□ -0.06
CD48-201ENST00000368045 OSMRQ99650 979 aa14.65□□□□□ -0.06
CD48-201ENST00000368045 RBBP8Q99708 897 aa14.65□□□□□ -0.06
CD48-201ENST00000368045 LRRC4Q9HBW1 653 aa14.65□□□□□ -0.06
CD48-201ENST00000368045 KRT82Q9NSB4 513 aa14.65□□□□□ -0.06
CD48-201ENST00000368045 NDE1Q9NXR1 346 aa14.65□□□□□ -0.06
CD48-201ENST00000368045 BFARQ9NZS9 450 aa14.65□□□□□ -0.06
CD48-201ENST00000368045 SEPT10Q9P0V9 454 aa14.65□□□□□ -0.06
CD48-201ENST00000368045 MID2Q9UJV3 735 aa14.65□□□□□ -0.06
CD48-201ENST00000368045 GJD2Q9UKL4 321 aa14.65□□□□□ -0.06
CD48-201ENST00000368045 TRHDEQ9UKU6 1024 aa14.65□□□□□ -0.06
CD48-201ENST00000368045 PSAT1Q9Y617 370 aa14.65□□□□□ -0.06
CD48-201ENST00000368045 CDY2AQ9Y6F7 541 aa14.65□□□□□ -0.06
CD48-201ENST00000368045 CDY1Q9Y6F8 540 aa14.65□□□□□ -0.06
CD48-201ENST00000368045 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa14.65□□□□□ -0.06
CD48-201ENST00000368045 A0A088AWK7 358 aa14.64□□□□□ -0.07
CD48-201ENST00000368045 MAGEB16A2A368 324 aa14.64□□□□□ -0.07
CD48-201ENST00000368045 DPPA5A6NC42 116 aa14.64□□□□□ -0.07
CD48-201ENST00000368045 TMEM114B3SHH9 223 aa14.64□□□□□ -0.07
CD48-201ENST00000368045 M0QYT0 321 aa14.64□□□□□ -0.07
CD48-201ENST00000368045 AP3B1O00203 1094 aa14.64□□□□□ -0.07
CD48-201ENST00000368045 SIN3BO75182 1162 aa14.64□□□□□ -0.07
CD48-201ENST00000368045 USP1O94782 785 aa14.64□□□□□ -0.07
CD48-201ENST00000368045 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.3 ms