RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000363613.1

RNU6-1017P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1017, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1017P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1017P-201ENST00000363613 TNFRSF8P28908 595 aa7.3□□□□□ -1.24
RNU6-1017P-201ENST00000363613 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
RNU6-1017P-201ENST00000363613 HOXC13P31276 330 aa7.3□□□□□ -1.24
RNU6-1017P-201ENST00000363613 FDFT1P37268 417 aa7.3□□□□□ -1.24
RNU6-1017P-201ENST00000363613 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
RNU6-1017P-201ENST00000363613 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
RNU6-1017P-201ENST00000363613 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
RNU6-1017P-201ENST00000363613 AP1B1Q10567 949 aa7.3□□□□□ -1.24
RNU6-1017P-201ENST00000363613 MMRN1Q13201 1228 aa7.3□□□□□ -1.24
RNU6-1017P-201ENST00000363613 SEMA3BQ13214 749 aa7.3□□□□□ -1.24
RNU6-1017P-201ENST00000363613 GPS2Q13227 327 aa7.3□□□□□ -1.24
RNU6-1017P-201ENST00000363613 SLC12A1Q13621 1099 aa7.3□□□□□ -1.24
RNU6-1017P-201ENST00000363613 AUHQ13825 339 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
RNU6-1017P-201ENST00000363613 CAMK1Q14012 370 aa7.3□□□□□ -1.24
RNU6-1017P-201ENST00000363613 DPYSQ14117 519 aa7.3□□□□□ -1.24
RNU6-1017P-201ENST00000363613 P3H1Q32P28 736 aa7.3□□□□□ -1.24
RNU6-1017P-201ENST00000363613 PARP15Q460N3 678 aa7.3□□□□□ -1.24
RNU6-1017P-201ENST00000363613 MPPE1Q53F39 396 aa7.3□□□□□ -1.24
RNU6-1017P-201ENST00000363613 SLC45A4Q5BKX6 768 aa7.3□□□□□ -1.24
RNU6-1017P-201ENST00000363613 MS4A13Q5J8X5 152 aa7.3□□□□□ -1.24
RNU6-1017P-201ENST00000363613 MPP7Q5T2T1 576 aa7.3□□□□□ -1.24
RNU6-1017P-201ENST00000363613 ZNF697Q5TEC3 545 aa7.3□□□□□ -1.24
RNU6-1017P-201ENST00000363613 TXNDC8Q6A555 127 aa7.3□□□□□ -1.24
RNU6-1017P-201ENST00000363613 AADACL2Q6P093 401 aa7.3□□□□□ -1.24
RNU6-1017P-201ENST00000363613 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa7.3□□□□□ -1.24
RNU6-1017P-201ENST00000363613 NUDT18Q6ZVK8 323 aa7.3□□□□□ -1.24
RNU6-1017P-201ENST00000363613 CHST9Q7L1S5 443 aa7.3□□□□□ -1.24
RNU6-1017P-201ENST00000363613 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
RNU6-1017P-201ENST00000363613 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
RNU6-1017P-201ENST00000363613 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
RNU6-1017P-201ENST00000363613 ZNF354CQ86Y25 554 aa7.3□□□□□ -1.24
RNU6-1017P-201ENST00000363613 CPNE8Q86YQ8 564 aa7.3□□□□□ -1.24
RNU6-1017P-201ENST00000363613 JAMLQ86YT9 394 aa7.3□□□□□ -1.24
RNU6-1017P-201ENST00000363613 DENND1CQ8IV53 801 aa7.3□□□□□ -1.24
RNU6-1017P-201ENST00000363613 LGI2Q8N0V4 545 aa7.3□□□□□ -1.24
RNU6-1017P-201ENST00000363613 CNPY4Q8N129 248 aa7.3□□□□□ -1.24
RNU6-1017P-201ENST00000363613 CPXM2Q8N436 756 aa7.3□□□□□ -1.24
RNU6-1017P-201ENST00000363613 ATPAF2Q8N5M1 289 aa7.3□□□□□ -1.24
RNU6-1017P-201ENST00000363613 ALLCQ8N6M5 410 aa7.3□□□□□ -1.24
RNU6-1017P-201ENST00000363613 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
RNU6-1017P-201ENST00000363613 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
RNU6-1017P-201ENST00000363613 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
RNU6-1017P-201ENST00000363613 SLC35B2Q8TB61 432 aa7.3□□□□□ -1.24
RNU6-1017P-201ENST00000363613 GDPD5Q8WTR4 605 aa7.3□□□□□ -1.24
RNU6-1017P-201ENST00000363613 IFT81Q8WYA0 676 aa7.3□□□□□ -1.24
RNU6-1017P-201ENST00000363613 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
RNU6-1017P-201ENST00000363613 SNF8Q96H20 258 aa7.3□□□□□ -1.24
RNU6-1017P-201ENST00000363613 NECTIN4Q96NY8 510 aa7.3□□□□□ -1.24
RNU6-1017P-201ENST00000363613 KLC2Q9H0B6 622 aa7.3□□□□□ -1.24
RNU6-1017P-201ENST00000363613 MAGEH1Q9H213 219 aa7.3□□□□□ -1.24
RNU6-1017P-201ENST00000363613 IL21Q9HBE4 155 aa7.3□□□□□ -1.24
RNU6-1017P-201ENST00000363613 PCDH9Q9HC56 1237 aa7.3□□□□□ -1.24
RNU6-1017P-201ENST00000363613 EPB41L5Q9HCM4 733 aa7.3□□□□□ -1.24
RNU6-1017P-201ENST00000363613 TMEM248Q9NWD8 314 aa7.3□□□□□ -1.24
RNU6-1017P-201ENST00000363613 OSER1Q9NX31 292 aa7.3□□□□□ -1.24
RNU6-1017P-201ENST00000363613 OBP2AQ9NY56 170 aa7.3□□□□□ -1.24
RNU6-1017P-201ENST00000363613 WHRNQ9P202 907 aa7.3□□□□□ -1.24
RNU6-1017P-201ENST00000363613 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
RNU6-1017P-201ENST00000363613 ANAPC5Q9UJX4 755 aa7.3□□□□□ -1.24
RNU6-1017P-201ENST00000363613 DNPEPQ9ULA0 475 aa7.3□□□□□ -1.24
RNU6-1017P-201ENST00000363613 VANGL2Q9ULK5 521 aa7.3□□□□□ -1.24
RNU6-1017P-201ENST00000363613 CPQQ9Y646 472 aa7.3□□□□□ -1.24
RNU6-1017P-201ENST00000363613 HS3ST4Q9Y661 456 aa7.3□□□□□ -1.24
RNU6-1017P-201ENST00000363613 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa7.3□□□□□ -1.24
RNU6-1017P-201ENST00000363613 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa7.29□□□□□ -1.24
RNU6-1017P-201ENST00000363613 A0A1B0GVM2 712 aa7.29□□□□□ -1.24
RNU6-1017P-201ENST00000363613 ILVBLA1L0T0 632 aa7.29□□□□□ -1.24
RNU6-1017P-201ENST00000363613 C2orf78A6NCI8 922 aa7.29□□□□□ -1.24
RNU6-1017P-201ENST00000363613 TCAF2A6NFQ2 919 aa7.29□□□□□ -1.24
RNU6-1017P-201ENST00000363613 C5orf60A6NFR6 353 aa7.29□□□□□ -1.24
RNU6-1017P-201ENST00000363613 E7EVH7 732 aa7.29□□□□□ -1.24
RNU6-1017P-201ENST00000363613 H0Y626 953 aa7.29□□□□□ -1.24
RNU6-1017P-201ENST00000363613 DCLK1O15075 740 aa7.29□□□□□ -1.24
RNU6-1017P-201ENST00000363613 KCNN4O15554 427 aa7.29□□□□□ -1.24
RNU6-1017P-201ENST00000363613 TTI1O43156 1089 aa7.29□□□□□ -1.24
RNU6-1017P-201ENST00000363613 OPHN1O60890 802 aa7.29□□□□□ -1.24
RNU6-1017P-201ENST00000363613 RAMP2O60895 175 aa7.29□□□□□ -1.24
RNU6-1017P-201ENST00000363613 GCATO75600 419 aa7.29□□□□□ -1.24
RNU6-1017P-201ENST00000363613 RFPL2O75678 378 aa7.29□□□□□ -1.24
RNU6-1017P-201ENST00000363613 OLFM2O95897 454 aa7.29□□□□□ -1.24
RNU6-1017P-201ENST00000363613 CD48P09326 243 aa7.29□□□□□ -1.24
RNU6-1017P-201ENST00000363613 IRF1P10914 325 aa7.29□□□□□ -1.24
RNU6-1017P-201ENST00000363613 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
RNU6-1017P-201ENST00000363613 OR1E1P30953 314 aa7.29□□□□□ -1.24
RNU6-1017P-201ENST00000363613 KCNJ1P48048 391 aa7.29□□□□□ -1.24
RNU6-1017P-201ENST00000363613 LMAN1P49257 510 aa7.29□□□□□ -1.24
RNU6-1017P-201ENST00000363613 RENBPP51606 427 aa7.29□□□□□ -1.24
RNU6-1017P-201ENST00000363613 CDK16Q00536 496 aa7.29□□□□□ -1.24
RNU6-1017P-201ENST00000363613 SLC20A2Q08357 652 aa7.29□□□□□ -1.24
RNU6-1017P-201ENST00000363613 PTK6Q13882 451 aa7.29□□□□□ -1.24
RNU6-1017P-201ENST00000363613 SLMAPQ14BN4 828 aa7.29□□□□□ -1.24
RNU6-1017P-201ENST00000363613 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
RNU6-1017P-201ENST00000363613 LLGL1Q15334 1064 aa7.29□□□□□ -1.24
RNU6-1017P-201ENST00000363613 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
RNU6-1017P-201ENST00000363613 ELF2Q15723 593 aa7.29□□□□□ -1.24
RNU6-1017P-201ENST00000363613 CA9Q16790 459 aa7.29□□□□□ -1.24
RNU6-1017P-201ENST00000363613 C5orf22Q49AR2 442 aa7.29□□□□□ -1.24
RNU6-1017P-201ENST00000363613 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
RNU6-1017P-201ENST00000363613 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
RNU6-1017P-201ENST00000363613 RAP1GAP2Q684P5 730 aa7.29□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.4 ms