RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000363350.1

RNU6-179P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 179, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-179P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-179P-201ENST00000363350 HTATIP2Q9BUP3 242 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-179P-201ENST00000363350 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-179P-201ENST00000363350 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
RNU6-179P-201ENST00000363350 SFXN1Q9H9B4 322 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-179P-201ENST00000363350 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-179P-201ENST00000363350 TXNRD2Q9NNW7 524 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-179P-201ENST00000363350 SLC22A11Q9NSA0 550 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-179P-201ENST00000363350 KIF17Q9P2E2 1029 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-179P-201ENST00000363350 KCND3Q9UK17 655 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-179P-201ENST00000363350 RCE1Q9Y256 329 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-179P-201ENST00000363350 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-179P-201ENST00000363350 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
RNU6-179P-201ENST00000363350 ZNF804BA4D1E1 1349 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-179P-201ENST00000363350 B9A039 149 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-179P-201ENST00000363350 E7EVH7 732 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-179P-201ENST00000363350 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
RNU6-179P-201ENST00000363350 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
RNU6-179P-201ENST00000363350 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
RNU6-179P-201ENST00000363350 AKR1A1P14550 325 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-179P-201ENST00000363350 TFEBP19484 476 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-179P-201ENST00000363350 B4GALNT1Q00973 533 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-179P-201ENST00000363350 MTA1Q13330 715 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-179P-201ENST00000363350 CUL4BQ13620 913 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-179P-201ENST00000363350 TAF5Q15542 800 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-179P-201ENST00000363350 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-179P-201ENST00000363350 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
RNU6-179P-201ENST00000363350 MORN5Q5VZ52 161 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-179P-201ENST00000363350 ZNF626Q68DY1 528 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-179P-201ENST00000363350 DHRS13Q6UX07 377 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-179P-201ENST00000363350 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
RNU6-179P-201ENST00000363350 RASGRP2Q7LDG7 609 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-179P-201ENST00000363350 MDGA2Q7Z553 956 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-179P-201ENST00000363350 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-179P-201ENST00000363350 HERC6Q8IVU3 1022 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-179P-201ENST00000363350 UEVLDQ8IX04 471 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-179P-201ENST00000363350 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
RNU6-179P-201ENST00000363350 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
RNU6-179P-201ENST00000363350 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-179P-201ENST00000363350 RUBCNQ92622 972 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-179P-201ENST00000363350 RILPL2Q969X0 211 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-179P-201ENST00000363350 VOPP1Q96AW1 172 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-179P-201ENST00000363350 SIGLEC11Q96RL6 698 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-179P-201ENST00000363350 ZNF347Q96SE7 839 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-179P-201ENST00000363350 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-179P-201ENST00000363350 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
RNU6-179P-201ENST00000363350 ITM2CQ9NQX7 267 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-179P-201ENST00000363350 FEM1BQ9UK73 627 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-179P-201ENST00000363350 BTBD3Q9Y2F9 522 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-179P-201ENST00000363350 PLEKHD1A6NEE1 506 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-179P-201ENST00000363350 GRM8O00222 908 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-179P-201ENST00000363350 IRAK2O43187 625 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-179P-201ENST00000363350 USP12O75317 370 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-179P-201ENST00000363350 CTSAP10619 480 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-179P-201ENST00000363350 SLC12A2P55011 1212 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-179P-201ENST00000363350 ACTR2P61160 394 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-179P-201ENST00000363350 RPS13P62277 151 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
RNU6-179P-201ENST00000363350 GHRHRQ02643 423 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-179P-201ENST00000363350 EFR3AQ14156 821 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-179P-201ENST00000363350 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP3.55□□□□□ -1.84
RNU6-179P-201ENST00000363350 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-179P-201ENST00000363350 MTX3Q5HYI7 312 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-179P-201ENST00000363350 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-179P-201ENST00000363350 SLC2A7Q6PXP3 512 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-179P-201ENST00000363350 SYT13Q7L8C5 426 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-179P-201ENST00000363350 EXOC8Q8IYI6 725 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-179P-201ENST00000363350 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
RNU6-179P-201ENST00000363350 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
RNU6-179P-201ENST00000363350 PIGSQ96S52 555 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-179P-201ENST00000363350 FAM167BQ9BTA0 163 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-179P-201ENST00000363350 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
RNU6-179P-201ENST00000363350 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
RNU6-179P-201ENST00000363350 PDE11AQ9HCR9 933 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-179P-201ENST00000363350 RASSF1Q9NS23 344 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-179P-201ENST00000363350 MTMR4Q9NYA4 1195 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-179P-201ENST00000363350 BAG5Q9UL15 447 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-179P-201ENST00000363350 DGKBQ9Y6T7 804 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-179P-201ENST00000363350 LMTK3Q96Q04 1460 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-179P-201ENST00000363350 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-179P-201ENST00000363350 KCNU1A8MYU2 1149 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-179P-201ENST00000363350 MCIDASD6RGH6 385 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-179P-201ENST00000363350 KRT38O76015 456 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-179P-201ENST00000363350 CD63P08962 238 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-179P-201ENST00000363350 CHN1P15882 459 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-179P-201ENST00000363350 PRPH2P23942 346 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-179P-201ENST00000363350 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-179P-201ENST00000363350 PCP4P48539 62 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-179P-201ENST00000363350 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-179P-201ENST00000363350 ADPRHP54922 357 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-179P-201ENST00000363350 CDK18Q07002 472 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-179P-201ENST00000363350 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-179P-201ENST00000363350 PPFIA1Q13136 1202 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-179P-201ENST00000363350 PDCLQ13371 301 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-179P-201ENST00000363350 STIM1Q13586 685 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-179P-201ENST00000363350 SEMA3AQ14563 771 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-179P-201ENST00000363350 PGM5Q15124 567 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-179P-201ENST00000363350 ADCK5Q3MIX3 580 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-179P-201ENST00000363350 FBXO47Q5MNV8 452 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-179P-201ENST00000363350 LIPMQ5VYY2 423 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-179P-201ENST00000363350 CNGA4Q8IV77 575 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-179P-201ENST00000363350 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.7 ms