RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000337004.8

PTDSS1-201, Transcript of phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTDSS1, Length 2,366 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1-201ENST00000337004 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
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PTDSS1-201ENST00000337004 ENO4A6NNW6 628 aa22.04■■□□□ 1.12
PTDSS1-201ENST00000337004 PRKCGP05129 697 aa22.04■■□□□ 1.12
PTDSS1-201ENST00000337004 CPA3P15088 417 aa22.04■■□□□ 1.12
PTDSS1-201ENST00000337004 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
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PTDSS1-201ENST00000337004 PID1Q7Z2X4 250 aa22.04■■□□□ 1.12
PTDSS1-201ENST00000337004 ZNF567Q8N184 647 aa22.04■■□□□ 1.12
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PTDSS1-201ENST00000337004 ECSITQ9BQ95 431 aa22.04■■□□□ 1.12
PTDSS1-201ENST00000337004 PRDM12Q9H4Q4 367 aa22.04■■□□□ 1.12
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PTDSS1-201ENST00000337004 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
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PTDSS1-201ENST00000337004 TNIP3Q96KP6 325 aa22.04■■□□□ 1.12
PTDSS1-201ENST00000337004 ZNF560Q96MR9 790 aa22.04■■□□□ 1.12
PTDSS1-201ENST00000337004 ADAM28Q9UKQ2 775 aa22.04■■□□□ 1.12
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PTDSS1-201ENST00000337004 ZNF792Q3KQV3 632 aa22.03■■□□□ 1.12
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PTDSS1-201ENST00000337004 POU5F2Q8N7G0 328 aa22.03■■□□□ 1.12
PTDSS1-201ENST00000337004 NETO2Q8NC67 525 aa22.03■■□□□ 1.12
PTDSS1-201ENST00000337004 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
PTDSS1-201ENST00000337004 ADAMTS10Q9H324 1103 aa22.03■■□□□ 1.12
PTDSS1-201ENST00000337004 LRRC40Q9H9A6 602 aa22.03■■□□□ 1.12
PTDSS1-201ENST00000337004 S100A14Q9HCY8 104 aa22.03■■□□□ 1.12
PTDSS1-201ENST00000337004 SNX15Q9NRS6 342 aa22.03■■□□□ 1.12
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PTDSS1-201ENST00000337004 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa22.03■■□□□ 1.12
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PTDSS1-201ENST00000337004 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
PTDSS1-201ENST00000337004 RECQL4O94761 1208 aa22.03■■□□□ 1.12
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PTDSS1-201ENST00000337004 SPRP35270 261 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
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PTDSS1-201ENST00000337004 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa22.02■■□□□ 1.12
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PTDSS1-201ENST00000337004 COX16Q9P0S2 106 aa22.02■■□□□ 1.12
PTDSS1-201ENST00000337004 PDP2Q9P2J9 529 aa22.02■■□□□ 1.12
PTDSS1-201ENST00000337004 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.11
PTDSS1-201ENST00000337004 SERPINB8P50452 374 aa22.02■■□□□ 1.11
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PTDSS1-201ENST00000337004 RBBP8Q99708 897 aa22.02■■□□□ 1.11
PTDSS1-201ENST00000337004 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.11
PTDSS1-201ENST00000337004 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.11
PTDSS1-201ENST00000337004 BFARQ9NZS9 450 aa22.02■■□□□ 1.11
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PTDSS1-201ENST00000337004 ACTRT2Q8TDY3 377 aa22.01■■□□□ 1.11
PTDSS1-201ENST00000337004 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
PTDSS1-201ENST00000337004 NT5C3BQ969T7 300 aa22.01■■□□□ 1.11
PTDSS1-201ENST00000337004 ISL2Q96A47 359 aa22.01■■□□□ 1.11
PTDSS1-201ENST00000337004 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa22.01■■□□□ 1.11
PTDSS1-201ENST00000337004 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
PTDSS1-201ENST00000337004 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa22.01■■□□□ 1.11
PTDSS1-201ENST00000337004 XPOTO43592 962 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
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