RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000333090.4

TSKU-201, Transcript of tsukushi, small leucine rich proteoglycan, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TSKU, Length 2,712 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSKU-201ENST00000333090 GOLGA8OA6NCC3 632 aa24.21■■□□□ 1.47
TSKU-201ENST00000333090 GOLGA8NF8WBI6 632 aa24.21■■□□□ 1.47
TSKU-201ENST00000333090 GPR25O00155 361 aa24.21■■□□□ 1.47
TSKU-201ENST00000333090 DPYSL4O14531 572 aa24.21■■□□□ 1.47
TSKU-201ENST00000333090 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
TSKU-201ENST00000333090 TNFAIP1Q13829 316 aa24.21■■□□□ 1.47
TSKU-201ENST00000333090 EPGNQ6UW88 154 aa24.21■■□□□ 1.47
TSKU-201ENST00000333090 NETO2Q8NC67 525 aa24.21■■□□□ 1.47
TSKU-201ENST00000333090 PPP1R36Q96LQ0 422 aa24.21■■□□□ 1.47
TSKU-201ENST00000333090 LRGUKQ96M69 825 aa24.21■■□□□ 1.47
TSKU-201ENST00000333090 OR52B2Q96RD2 323 aa24.21■■□□□ 1.47
TSKU-201ENST00000333090 CEP41Q9BYV8 373 aa24.21■■□□□ 1.47
TSKU-201ENST00000333090 GRIP2Q9C0E4 1043 aa24.21■■□□□ 1.47
TSKU-201ENST00000333090 CDH19Q9H159 772 aa24.21■■□□□ 1.47
TSKU-201ENST00000333090 MINDY3Q9H8M7 445 aa24.21■■□□□ 1.47
TSKU-201ENST00000333090 PREBQ9HCU5 417 aa24.21■■□□□ 1.47
TSKU-201ENST00000333090 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
TSKU-201ENST00000333090 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
TSKU-201ENST00000333090 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa24.21■■□□□ 1.47
TSKU-201ENST00000333090 PARP14Q460N5 1801 aa24.21■■□□□ 1.47
TSKU-201ENST00000333090 CENPFP49454 3210 aa24.21■■□□□ 1.47
TSKU-201ENST00000333090 DENRO43583 198 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
TSKU-201ENST00000333090 F7P08709 466 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
TSKU-201ENST00000333090 MLH1P40692 756 aa24.21■■□□□ 1.47
TSKU-201ENST00000333090 INSCQ1MX18 579 aa24.21■■□□□ 1.47
TSKU-201ENST00000333090 NADK2Q4G0N4 442 aa24.21■■□□□ 1.47
TSKU-201ENST00000333090 HTR3CQ8WXA8 447 aa24.21■■□□□ 1.47
TSKU-201ENST00000333090 ARNTL2Q8WYA1 636 aa24.21■■□□□ 1.47
TSKU-201ENST00000333090 SEPT1Q8WYJ6 367 aa24.21■■□□□ 1.47
TSKU-201ENST00000333090 PGLYRP2Q96PD5 576 aa24.21■■□□□ 1.47
TSKU-201ENST00000333090 LGMNQ99538 433 aa24.21■■□□□ 1.47
TSKU-201ENST00000333090 DTLQ9NZJ0 730 aa24.21■■□□□ 1.47
TSKU-201ENST00000333090 MORF4L1Q9UBU8 362 aa24.21■■□□□ 1.47
TSKU-201ENST00000333090 STK39Q9UEW8 545 aa24.21■■□□□ 1.47
TSKU-201ENST00000333090 FBXO21O94952 628 aa24.2■■□□□ 1.47
TSKU-201ENST00000333090 PENKP01210 267 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.47
TSKU-201ENST00000333090 STAG3L1P0CL83 205 aa24.2■■□□□ 1.47
TSKU-201ENST00000333090 DESP17661 470 aa24.2■■□□□ 1.47
TSKU-201ENST00000333090 PTPRAP18433 802 aa24.2■■□□□ 1.47
TSKU-201ENST00000333090 PGAM1P18669 254 aa24.2■■□□□ 1.47
TSKU-201ENST00000333090 PRDX6P30041 224 aa24.2■■□□□ 1.47
TSKU-201ENST00000333090 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.47
TSKU-201ENST00000333090 NAPRTQ6XQN6 538 aa24.2■■□□□ 1.47
TSKU-201ENST00000333090 LCA5Q86VQ0 697 aa24.2■■□□□ 1.47
TSKU-201ENST00000333090 METTL25Q8N6Q8 603 aa24.2■■□□□ 1.47
TSKU-201ENST00000333090 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa24.2■■□□□ 1.47
TSKU-201ENST00000333090 CXorf38Q8TB03 319 aa24.2■■□□□ 1.47
TSKU-201ENST00000333090 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.47
TSKU-201ENST00000333090 FZD8Q9H461 694 aa24.2■■□□□ 1.47
TSKU-201ENST00000333090 SNX15Q9NRS6 342 aa24.2■■□□□ 1.47
TSKU-201ENST00000333090 ANK1P16157 1881 aa24.2■■□□□ 1.46
TSKU-201ENST00000333090 USP46P62068 366 aa24.2■■□□□ 1.46
TSKU-201ENST00000333090 SLC6A3Q01959 620 aa24.2■■□□□ 1.46
TSKU-201ENST00000333090 GK3PQ14409 553 aa24.2■■□□□ 1.46
TSKU-201ENST00000333090 PPM1LQ5SGD2 360 aa24.2■■□□□ 1.46
TSKU-201ENST00000333090 KLHDC10Q6PID8 442 aa24.2■■□□□ 1.46
TSKU-201ENST00000333090 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
TSKU-201ENST00000333090 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP24.2■■□□□ 1.46
TSKU-201ENST00000333090 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
TSKU-201ENST00000333090 MTMR10Q9NXD2 777 aa24.2■■□□□ 1.46
TSKU-201ENST00000333090 HESX1Q9UBX0 185 aa24.2■■□□□ 1.46
TSKU-201ENST00000333090 AP4B1Q9Y6B7 739 aa24.2■■□□□ 1.46
TSKU-201ENST00000333090 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa24.19■■□□□ 1.46
TSKU-201ENST00000333090 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
TSKU-201ENST00000333090 CRTAMO95727 393 aa24.19■■□□□ 1.46
TSKU-201ENST00000333090 FLOT2Q14254 428 aa24.19■■□□□ 1.46
TSKU-201ENST00000333090 TCF7L2Q9NQB0 619 aa24.19■■□□□ 1.46
TSKU-201ENST00000333090 SYBUQ9NX95 663 aa24.19■■□□□ 1.46
TSKU-201ENST00000333090 A0A0A0MRY4 1105 aa24.19■■□□□ 1.46
TSKU-201ENST00000333090 NEMP1O14524 444 aa24.19■■□□□ 1.46
TSKU-201ENST00000333090 SRGAP2BP0DMP2 458 aa24.19■■□□□ 1.46
TSKU-201ENST00000333090 NR2C2P49116 596 aa24.19■■□□□ 1.46
TSKU-201ENST00000333090 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
TSKU-201ENST00000333090 LRRC8BQ6P9F7 803 aa24.19■■□□□ 1.46
TSKU-201ENST00000333090 IYDQ6PHW0 289 aa24.19■■□□□ 1.46
TSKU-201ENST00000333090 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa24.19■■□□□ 1.46
TSKU-201ENST00000333090 SNX32Q86XE0 403 aa24.19■■□□□ 1.46
TSKU-201ENST00000333090 SPATA13Q96N96 652 aa24.19■■□□□ 1.46
TSKU-201ENST00000333090 CSPG4P5Q96PW8 444 aa24.19■■□□□ 1.46
TSKU-201ENST00000333090 NT5C1AQ9BXI3 368 aa24.19■■□□□ 1.46
TSKU-201ENST00000333090 FAM49BQ9NUQ9 324 aa24.19■■□□□ 1.46
TSKU-201ENST00000333090 GALNT8Q9NY28 637 aa24.19■■□□□ 1.46
TSKU-201ENST00000333090 AP4E1Q9UPM8 1137 aa24.19■■□□□ 1.46
TSKU-201ENST00000333090 IQCF3P0C7M6 154 aa24.19■■□□□ 1.46
TSKU-201ENST00000333090 MLNP12872 115 aa24.19■■□□□ 1.46
TSKU-201ENST00000333090 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
TSKU-201ENST00000333090 THOP1P52888 689 aa24.19■■□□□ 1.46
TSKU-201ENST00000333090 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
TSKU-201ENST00000333090 DPYSL2Q16555 572 aa24.19■■□□□ 1.46
TSKU-201ENST00000333090 LY6KQ17RY6 165 aa24.19■■□□□ 1.46
TSKU-201ENST00000333090 SMYD5Q6GMV2 418 aa24.19■■□□□ 1.46
TSKU-201ENST00000333090 DNERQ8NFT8 737 aa24.19■■□□□ 1.46
TSKU-201ENST00000333090 CDRT15Q96T59 188 aa24.19■■□□□ 1.46
TSKU-201ENST00000333090 SERPINI1Q99574 410 aa24.19■■□□□ 1.46
TSKU-201ENST00000333090 AS3MTQ9HBK9 375 aa24.19■■□□□ 1.46
TSKU-201ENST00000333090 PICK1Q9NRD5 415 aa24.19■■□□□ 1.46
TSKU-201ENST00000333090 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
TSKU-201ENST00000333090 ATICP31939 592 aa24.18■■□□□ 1.46
TSKU-201ENST00000333090 GP5P40197 560 aa24.18■■□□□ 1.46
TSKU-201ENST00000333090 CCDC153Q494R4 210 aa24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.6 ms