RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319942.7

RABGGTB-201, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTB, Length 1,496 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-201ENST00000319942 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 DONSONQ9NYP3 566 aa10.44□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 PAK5Q9P286 719 aa10.44□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 FRMPD3Q5JV73 1810 aa10.44□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 TET1Q8NFU7 2136 aa10.44□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 WDR27A2RRH5 827 aa10.43□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP10.43□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 IRAK2O43187 625 aa10.43□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 GJB5O95377 273 aa10.43□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 IGLV3-25P01717 112 aa10.43□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 CSH1P0DML2 217 aa10.43□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 CSH2P0DML3 217 aa10.43□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 RPL17P18621 184 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 MX2P20592 715 aa10.43□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 SERPINB6P35237 376 aa10.43□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 HSD17B3P37058 310 aa10.43□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 GPR15P49685 360 aa10.43□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 FAM193AP78312 1265 aa10.43□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 IFFO1Q0D2I5 559 aa10.43□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 RAB33AQ14088 237 aa10.43□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP10.43□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 MSANTD2Q6P1R3 559 aa10.43□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 C16orf59Q7L2K0 433 aa10.43□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa10.43□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 CCDC25Q86WR0 208 aa10.43□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF276Q8N554 614 aa10.43□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 PDZD8Q8NEN9 1154 aa10.43□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa10.43□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 GPR152Q8TDT2 470 aa10.43□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 OVCA2Q8WZ82 227 aa10.43□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 CASP10Q92851 521 aa10.43□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 C1orf74Q96LT6 269 aa10.43□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 RAD9AQ99638 391 aa10.43□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa10.43□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 MAGEB5Q9BZ81 275 aa10.43□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 ARHGEF4Q9NR80 690 aa10.43□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa10.43□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 GMIPQ9P107 970 aa10.43□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa10.43□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 TLR6Q9Y2C9 796 aa10.43□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa10.43□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP10.42□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC38A8A6NNN8 435 aa10.42□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP10.42□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 KCNN4O15554 427 aa10.42□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 APOEP02649 317 aa10.42□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa10.42□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 ETS1P14921 441 aa10.42□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 ERCC2P18074 760 aa10.42□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 EPHB2P29323 1055 aa10.42□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 RPL22P35268 128 aaKnown RBP10.42□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 PPP3CCP48454 512 aa10.42□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP10.42□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 TBX4P57082 545 aa10.42□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP10.42□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 SEMA3BQ13214 749 aa10.42□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP10.42□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 DPYSQ14117 519 aa10.42□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 VEPH1Q14D04 833 aa10.42□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP10.42□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP10.42□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC45A4Q5BKX6 768 aa10.42□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 C10orf120Q5SQS8 335 aa10.42□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 RHBDF2Q6PJF5 856 aa10.42□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP10.42□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 HOOK3Q86VS8 718 aa10.42□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 PPIL6Q8IXY8 311 aa10.42□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 LZTR1Q8N653 840 aa10.42□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 TTC9BQ8N6N2 239 aa10.42□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 STKLD1Q8NE28 680 aa10.42□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 GIPC2Q8TF65 315 aa10.42□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 TTLL2Q9BWV7 592 aa10.42□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 VN1R3Q9BXE9 311 aa10.42□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 TXLNGYQ9BZA5 131 aa10.42□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 SIK2Q9H0K1 926 aa10.42□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa10.42□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 NMUR1Q9HB89 426 aa10.42□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 CYP4F11Q9HBI6 524 aa10.42□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 USP29Q9HBJ7 922 aa10.42□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP10.42□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 DTLQ9NZJ0 730 aa10.42□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 FNIP2Q9P278 1114 aa10.42□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP10.42□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 SHOC2Q9UQ13 582 aa10.42□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 PLAAQ9Y263 795 aa10.42□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 PCNTO95613 3336 aa10.42□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 C5orf60A6NFR6 353 aa10.42□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 KCNU1A8MYU2 1149 aa10.42□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 GOLGA8KD6RF30 607 aa10.42□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 PRRG1O14668 218 aa10.42□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 ADAM12O43184 909 aa10.42□□□□□ -0.74
RABGGTB-201ENST00000319942 MTSS1O43312 755 aa10.42□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.7 ms