RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000310418.8

CLTB-201, Transcript of clathrin light chain B, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLTB, Length 1,215 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTB-201ENST00000310418 IL21RQ9HBE5 538 aa23.53■■□□□ 1.36
CLTB-201ENST00000310418 POPDC2Q9HBU9 364 aa23.53■■□□□ 1.36
CLTB-201ENST00000310418 KIAA1468Q9P260 1216 aa23.53■■□□□ 1.36
CLTB-201ENST00000310418 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
CLTB-201ENST00000310418 KLK13Q9UKR3 277 aa23.53■■□□□ 1.36
CLTB-201ENST00000310418 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa23.53■■□□□ 1.36
CLTB-201ENST00000310418 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
CLTB-201ENST00000310418 ZFHX4Q86UP3 3567 aa23.52■■□□□ 1.36
CLTB-201ENST00000310418 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
CLTB-201ENST00000310418 CER1O95813 267 aa23.52■■□□□ 1.36
CLTB-201ENST00000310418 MATKP42679 507 aa23.52■■□□□ 1.36
CLTB-201ENST00000310418 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
CLTB-201ENST00000310418 CAMK4Q16566 473 aa23.52■■□□□ 1.36
CLTB-201ENST00000310418 ARHGAP44Q17R89 818 aa23.52■■□□□ 1.36
CLTB-201ENST00000310418 ZNF423Q2M1K9 1284 aa23.52■■□□□ 1.36
CLTB-201ENST00000310418 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
CLTB-201ENST00000310418 FSCBQ5H9T9 825 aa23.52■■□□□ 1.36
CLTB-201ENST00000310418 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa23.52■■□□□ 1.36
CLTB-201ENST00000310418 LGI2Q8N0V4 545 aa23.52■■□□□ 1.36
CLTB-201ENST00000310418 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
CLTB-201ENST00000310418 THAP9Q9H5L6 903 aa23.52■■□□□ 1.36
CLTB-201ENST00000310418 MSRB2Q9Y3D2 182 aa23.52■■□□□ 1.36
CLTB-201ENST00000310418 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa23.52■■□□□ 1.36
CLTB-201ENST00000310418 NUMA1Q14980 2115 aa23.51■■□□□ 1.35
CLTB-201ENST00000310418 A0A1B0GVT2 93 aa23.51■■□□□ 1.35
CLTB-201ENST00000310418 TMEM8BA6NDV4 472 aa23.51■■□□□ 1.35
CLTB-201ENST00000310418 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
CLTB-201ENST00000310418 SLC9A1P19634 815 aa23.51■■□□□ 1.35
CLTB-201ENST00000310418 USP8P40818 1118 aa23.51■■□□□ 1.35
CLTB-201ENST00000310418 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
CLTB-201ENST00000310418 PDCLQ13371 301 aa23.51■■□□□ 1.35
CLTB-201ENST00000310418 HLA-BQ31612 363 aa23.51■■□□□ 1.35
CLTB-201ENST00000310418 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
CLTB-201ENST00000310418 PITRM1Q5JRX3 1037 aa23.51■■□□□ 1.35
CLTB-201ENST00000310418 RAP1GAP2Q684P5 730 aa23.51■■□□□ 1.35
CLTB-201ENST00000310418 CHSY1Q86X52 802 aa23.51■■□□□ 1.35
CLTB-201ENST00000310418 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa23.51■■□□□ 1.35
CLTB-201ENST00000310418 BTN2A3PQ96KV6 586 aa23.51■■□□□ 1.35
CLTB-201ENST00000310418 MRGPRX3Q96LB0 322 aa23.51■■□□□ 1.35
CLTB-201ENST00000310418 SGK2Q9HBY8 427 aa23.51■■□□□ 1.35
CLTB-201ENST00000310418 APEX2Q9UBZ4 518 aa23.51■■□□□ 1.35
CLTB-201ENST00000310418 TJP2Q9UDY2 1190 aa23.51■■□□□ 1.35
CLTB-201ENST00000310418 BECN2A8MW95 431 aa23.5■■□□□ 1.35
CLTB-201ENST00000310418 SIN3BO75182 1162 aa23.5■■□□□ 1.35
CLTB-201ENST00000310418 IGLV3-25P01717 112 aa23.5■■□□□ 1.35
CLTB-201ENST00000310418 ZNF883P0CG24 379 aa23.5■■□□□ 1.35
CLTB-201ENST00000310418 TACR2P21452 398 aa23.5■■□□□ 1.35
CLTB-201ENST00000310418 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
CLTB-201ENST00000310418 APBA1Q02410 837 aa23.5■■□□□ 1.35
CLTB-201ENST00000310418 GBP6Q6ZN66 633 aa23.5■■□□□ 1.35
CLTB-201ENST00000310418 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
CLTB-201ENST00000310418 KDM1BQ8NB78 822 aa23.5■■□□□ 1.35
CLTB-201ENST00000310418 BIRC7Q96CA5 298 aa23.5■■□□□ 1.35
CLTB-201ENST00000310418 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
CLTB-201ENST00000310418 TM7SF3Q9NS93 570 aa23.5■■□□□ 1.35
CLTB-201ENST00000310418 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
CLTB-201ENST00000310418 ERVW-1Q9UQF0 538 aa23.5■■□□□ 1.35
CLTB-201ENST00000310418 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa23.5■■□□□ 1.35
CLTB-201ENST00000310418 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
CLTB-201ENST00000310418 AKAP13Q12802 2813 aa23.5■■□□□ 1.35
CLTB-201ENST00000310418 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
CLTB-201ENST00000310418 FSBPO95073 299 aa23.49■■□□□ 1.35
CLTB-201ENST00000310418 MOCS3O95396 460 aa23.49■■□□□ 1.35
CLTB-201ENST00000310418 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
CLTB-201ENST00000310418 UBE2HP62256 183 aa23.49■■□□□ 1.35
CLTB-201ENST00000310418 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
CLTB-201ENST00000310418 ARID5BQ14865 1188 aa23.49■■□□□ 1.35
CLTB-201ENST00000310418 TAF5Q15542 800 aa23.49■■□□□ 1.35
CLTB-201ENST00000310418 TEAD4Q15561 434 aa23.49■■□□□ 1.35
CLTB-201ENST00000310418 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
CLTB-201ENST00000310418 GANCQ8TET4 914 aa23.49■■□□□ 1.35
CLTB-201ENST00000310418 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
CLTB-201ENST00000310418 TM9SF3Q9HD45 589 aa23.49■■□□□ 1.35
CLTB-201ENST00000310418 OSGEPQ9NPF4 335 aa23.49■■□□□ 1.35
CLTB-201ENST00000310418 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP23.49■■□□□ 1.35
CLTB-201ENST00000310418 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa23.49■■□□□ 1.35
CLTB-201ENST00000310418 SCML1Q9UN30 329 aa23.49■■□□□ 1.35
CLTB-201ENST00000310418 ASPMQ8IZT6 3477 aa23.49■■□□□ 1.35
CLTB-201ENST00000310418 IGF2RP11717 2491 aa23.48■■□□□ 1.35
CLTB-201ENST00000310418 CBFA2T3O75081 653 aa23.48■■□□□ 1.35
CLTB-201ENST00000310418 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
CLTB-201ENST00000310418 FTH1P19P0C7X4 201 aa23.48■■□□□ 1.35
CLTB-201ENST00000310418 CD27P26842 260 aa23.48■■□□□ 1.35
CLTB-201ENST00000310418 EXOC3L4Q17RC7 722 aa23.48■■□□□ 1.35
CLTB-201ENST00000310418 C9orf64Q5T6V5 341 aa23.48■■□□□ 1.35
CLTB-201ENST00000310418 USP30Q70CQ3 517 aa23.48■■□□□ 1.35
CLTB-201ENST00000310418 WDTC1Q8N5D0 677 aa23.48■■□□□ 1.35
CLTB-201ENST00000310418 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa23.48■■□□□ 1.35
CLTB-201ENST00000310418 SHC3Q92529 594 aa23.48■■□□□ 1.35
CLTB-201ENST00000310418 FAM204AQ9H8W3 233 aa23.48■■□□□ 1.35
CLTB-201ENST00000310418 FBXL12Q9NXK8 326 aa23.48■■□□□ 1.35
CLTB-201ENST00000310418 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa23.48■■□□□ 1.35
CLTB-201ENST00000310418 CEP83Q9Y592 693 aa23.48■■□□□ 1.35
CLTB-201ENST00000310418 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
CLTB-201ENST00000310418 FAM221BA6H8Z2 402 aa23.47■■□□□ 1.35
CLTB-201ENST00000310418 TTC34A8MYJ7 566 aa23.47■■□□□ 1.35
CLTB-201ENST00000310418 KCNU1A8MYU2 1149 aa23.47■■□□□ 1.35
CLTB-201ENST00000310418 F5H5T6 163 aa23.47■■□□□ 1.35
CLTB-201ENST00000310418 PON1P27169 355 aa23.47■■□□□ 1.35
CLTB-201ENST00000310418 GRIA4P48058 902 aa23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.7 ms